Comprehensive screening of gene expression pattern as indicator of stress diagnosis in leaf photosynthesis

综合筛选基因表达模式作为叶片光合作用胁迫诊断指标

• 批准号: 22780135
• 负责人: SAITO Hideyuki
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22780135/
• 关键词: 遺伝子発現; 機能ゲノム学; ゲノム生物学的情報; ストレス診断; DNAマイクロアレイ; ブナ; ゲノム生理生態学; 土壌乾燥ストレス; マクロアレイ

We generated 355, 845, 739 sequence from a full-length enriched cDNA library of beech(Fagus crenata) leaves by using 454 next generation sequencer. The DNA microarray for analysis of gene expression of beech leaves was developed, 12, 446 annotated genes and 31, 357 non-annotated genes. The high temperature-, drought-and acidification(H_2O_2)-specific gene expression patterns were found. The soil-drought intensity-and its history-dependent gene expression pattern related to photosynthetic reduction were found. These results suggested that transcriptome analysis will became promising method that provides useful indicators for diagnosis of health and stress of beech leaves.

我们使用 454 下一代测序仪从山毛榉叶全长富集 cDNA 文库中生成了 355、845、739 序列。开发了用于分析山毛榉叶片基因表达的DNA微阵列，有12, 446个注释基因和31, 357个未注释基因。发现了高温、干旱和酸化(H_2O_2)特异性基因表达模式。发现了与光合作用减少相关的土壤干旱强度及其历史依赖性基因表达模式。这些结果表明转录组分析将成为有前途的方法，为诊断山毛榉叶子的健康和应激提供有用的指标。

项目成果

ブナ林のたどっている道-分布域北限の動向-

山毛榉林的轨迹～分布范围北端的动向～

• 发表时间: 2012
• 作者: 斎藤秀之

ブナのDNAマイクロアレイの開発

山毛榉 DNA 微阵列的开发

• 发表时间: 2011
• 作者: 斎藤秀之・瀬々潤・清水(稲継)理恵・神村章子・山田宰靖・清水健太郎

ブナ葉の高温・乾燥・酸化ストレスに応答する発現遺伝子の網羅的探索

全面寻找山毛榉叶片响应高温、干燥和氧化应激的表达基因

• 发表时间: 2011
• 作者: 斎藤秀之;山田宰靖;瀬々潤;福崎睦美;清水(稲継)理恵;清水健太郎
• 通讯作者: 清水健太郎

摩周湖における対流圏オゾン濃度とその植物影響について

摩周湖对流层臭氧浓度及其对植物的影响

• 发表时间: 2010
• 作者: 山口高志・龍田慎平・渡辺誠・渡邊忠・久保島康行・斎藤秀之・野口泉・小池孝良

ブナ林の遺伝子診断による環境ストレス評価

利用山毛榉林基因诊断进行环境压力评估

• 发表时间: 2012
• 作者: 斎藤秀之