Analysis of the mRNA silencing mechanism by small RNA in E. coli

大肠杆菌小RNA沉默机制分析

• 批准号: 22770175
• 负责人: MORITA Teppei
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Suzuka University of Medical Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22770175/
• 关键词: 低分子RNA; 遺伝子発現抑制; 大腸菌; 塩基対形成; RNAシャペロン; 遺伝子発現制御

SgrS is a well-characterized Hfq-binding sRNA. In this project, I tried to define the SgrS region required for translation repression of ptsG mRNA, and to clarify the mechanism by which Hfq promotes the base-pairing between SgrS and ptsG mRNA. The major findings are : 1) SgrS168-181(14 nt) is a minimal base-pair region for translational repression of ptsG mRNA ; 2) the polyU tail of rho-independent terminator is essential for Hfq action ; 3) the subregion between 711 and 750 of RNase E is sufficient for the functional interaction with Hfq to support the rapid degradation of ptsG mRNA.

SgrS 是一种充分表征的 Hfq 结合 sRNA。在这个项目中，我试图定义 ptsG mRNA 翻译抑制所需的 SgrS 区域，并阐明 Hfq 促进 SgrS 和 ptsG mRNA 之间碱基配对的机制。主要发现是： 1) SgrS168-181(14 nt) 是 ptsG mRNA 翻译抑制的最小碱基对区域； 2) rho独立终止子的polyU尾对于Hfq作用至关重要； 3) RNase E 711和750之间的亚区域足以与Hfq发生功能性相互作用，以支持ptsG mRNA的快速降解。

项目成果

Hfq binding at RhlB-recognition region of RNase E is crucial for the rapid degradation of target mRNAs mediated by sRNAs in E

Hfq 与 RNase E 的 RhlB 识别区结合对于 E 中 sRNA 介导的靶 mRNA 的快速降解至关重要

• 发表时间: 2011
• 作者: Ikeda; Y.; Yagi; M.; Morita; T.;Aiba; H
• 通讯作者: H

Both polyU tail and the upstream region of rho-independent terminator are required for the functional interaction of SgrS with Hfq

SgrS 与 Hfq 的功能相互作用需要 PolyU 尾部和 rho 独立终止子的上游区域

• 发表时间: 2011
• 作者: 石川博一;大鷹弘紀;森田鉄兵;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

Generation of functional E.coli DicF small RNA and the role of the 3' polyU stretch in Hfq bindiag

功能性大肠杆菌 DicF 小 RNA 的生成以及 3 PolyU 延伸在 Hfq 绑定中的作用

• 发表时间: 2011
• 作者: 森田鉄兵;飯田芳文;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

大腸菌小分子RNAの作用機構の解析:塩基対形成領域とHfq結合領域間の距離の重要性

大肠杆菌小RNA作用机制分析：碱基配对区与Hfq结合区距离的重要性

• 发表时间: 2010
• 作者: 石川博一;大鷹弘紀;森田鉄兵;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二

遺伝子発現制御機構における大腸菌低分子RNA3'末端ポリU配列の役割

大肠杆菌小RNA 3端polyU序列在基因表达控制机制中的作用

• 发表时间: 2011
• 作者: 大鷹弘紀;石川博一;森田鉄兵;饗場弘二
• 通讯作者: 饗場弘二