ペプチドセレクションによる酵素ミミック創薬のための戦略

使用肽选择的酶模拟药物发现策略

基本信息

批准号：
18F18727
负责人：
菅裕明
金额：
$ 0.77万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-07-25 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18F18727/
关键词：
FIT system Foldamers Macrocyclic peptides

项目摘要

This work has harvested the potential of flexizymes (artificial aminoacylation ribozymes) coupled to an in vitro translation system (the “flexible” in vitro translation system, FIT), led to the ribosomal incorporation of the largest and bulkiest residues to date. Briefly, foldamers -molecules with a strong tendency to adopt a folded conformation- composed of aromatic oligoamides have been recently proven capable of initiating translation, yielding the first-of-their-kind foldamer-peptide-hybrids. In our current work, we expanded the repertoire of foldamer functionalities and have demonstrated that side-chain modification of the helical structures grants access to previously inaccessible chemical and structural space. The incorporation of both the bulkiest and largest single residues that have been introduced by the ribosome has been demonstrated. Additionally, intrigued by the ribosomal tolerance towards aromatic oligoamides during translation initiation, we advanced our investigations and explored the possibility of incorporating these abiotic molecules as appendages during translation elongation. Our results indicated that the incorporation of an amino acid residue with a foldamer on the side-chain, as long as a heptapeptide, is feasible. It demonstrates for the first time the tolerance of the ribosome towards residues of that size and expands the current understanding on the limitations of the translational machinery. The above studies have paved the way towards the introduction of foldamers into mRNA display for the discovery of functional foldamer-peptide hybrids.

这项工作收获了柔性酶（人工氨酰化核酶）与体外翻译系统（“灵活的”体外翻译系统，FIT）耦合的潜力，导致迄今为止最大和最笨重的残基掺入核糖体。 - 具有强烈采用折叠构象倾向的分子 - 由芳香族低聚酰胺组成，最近已被证明能够启动翻译，从而产生同类中的第一个在我们目前的工作中，我们扩展了折叠体的功能，并证明了螺旋结构的侧链修饰可以实现以前无法访问的化学和结构空间，从而可以掺入最大和最大的单个残基。此外，由于对翻译起始过程中核糖体对芳香族寡酰胺的耐受性感兴趣，我们进一步探索了将这些非生物分子作为附属物纳入的可能性。我们的结果表明，在侧链上掺入折叠体（只要是七肽）是可行的，这首次证明了核糖体对该大小的残基的耐受性。上述研究扩展了目前对翻译机制局限性的理解，为将折叠体引入 mRNA 展示中以发现功能性折叠体-肽杂合体铺平了道路。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Ribosomally synthesized foldamer-containing peptides

核糖体合成的含折叠体的肽

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hirose H;Tsiamantas C;Katoh T;Suga H.;Tsiamantas Christos;Tsiamantas Christos
通讯作者：
Tsiamantas Christos

In Vitro Translated Peptide-Foldamer Hybrid Macrocycles

体外翻译的肽-折叠体杂化大环化合物

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hirose H;Tsiamantas C;Katoh T;Suga H.;Tsiamantas Christos;Tsiamantas Christos;Tsiamantas Christos
通讯作者：
Tsiamantas Christos

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