ペプチドタグを用いたタンパク質のアモルファス凝集体の制御及びその細胞毒性の解析
使用肽标签控制无定形蛋白聚集体并分析其细胞毒性
基本信息
- 批准号:17F17392
- 负责人:
- 金额:$ 1.41万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2017
- 资助国家:日本
- 起止时间:2017-11-10 至 2020-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
タンパク質の不定形な凝集(アモルファス凝集)は、創薬やバイオ産業において重要な現象であるにもかかわらず、その物理化学的特徴解析及び生物学的影響は殆ど解明されていない。本計画では、受入研究者が独自に開発した3~7残基から成る溶解性制御タグ(Solubility Controlling Peptide;SCPタグ)を用いてタンパク質(デング4型由来エンベロープ糖タンパク質第3ドメイン、以下DEN4-ED3)を不定形な可溶性凝集体(soluble amorphous aggregates)に会合させた。くわえて、SCPタグ配列を変異させることで凝集体のサイズを制御し、不定形で可溶な凝集体を安定的に形成させ、凝集の物性や構造を動的光散乱法などの分光学的手法を用いて明らかにした。また、単量体では無毒なDEN4-ED3にSCPタグを付加し可溶性会合体を形成させると細胞毒性を有することを解明した。さらに、可溶性会合体が大きな凝集体に成長すると細胞毒性が失われるということも見出した。神経変性疾患の原因分子とされているアミロイドでも類似した観測がされており、アミロイド線維核(pre-fibril)は毒性を有し、線維に成長したアミロイドは細胞毒性を失うという報告が多くなされている。しかし、アモルファス凝集では我々が知る限り初めての報告である。以上のことから、タンパク質が比較的小さなアモルファスな会合体を形成すると細胞毒性が生ずることを解明した。なお、現在執筆中の論文においては、外国人特別研究員Velmurugan氏が執筆した原稿を基に論文を共同で仕上げて投稿する予定であったが、コロナウイルス流行のため、執筆が遅れている。
尽管蛋白质的无定形聚集是药物发现和生物工业中的重要现象,但其理化特性和生物学效应在很大程度上是未知的。在本项目中,我们利用宿主研究人员自主研发的由3至7个残基组成的溶解度控制肽(SCP标签)来组装分析蛋白质(登革热4型衍生包膜糖蛋白第三结构域,以下简称DEN4-ED3)成可溶性无定形聚集体。此外,通过突变SCP标签序列,我们可以控制聚集体的大小,稳定地形成无定形和可溶性聚集体,并使用动态光散射等光谱方法研究聚集体的物理性质和结构。方法。我们还发现,单体形式无毒的 DEN4-ED3 在添加 SCP 标签形成可溶性聚集体时会变得具有细胞毒性。此外,我们发现当可溶性聚集体长成大聚集体时,细胞毒性就会消失。对淀粉样蛋白也进行了类似的观察,淀粉样蛋白被认为是神经退行性疾病的致病分子,并且有许多报道称淀粉样蛋白原纤维核(前原纤维)具有毒性,并且已经长成原纤维的淀粉样蛋白失去细胞毒性。 。然而,据我们所知,这是第一份关于无定形聚集的报告。基于上述,我们发现当蛋白质形成相对较小的无定形聚集体时,就会发生细胞毒性。目前正在撰写的论文原计划根据外籍研究员Velmurugan撰写的手稿共同完成并提交,但由于冠状病毒的爆发,写作被推迟了。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Misfolding of a Single Disulfide Bonded Globular Protein into a Low-Solubility Species Conformationally and Biophysically Distinct from the Native One
- DOI:10.3390/biom9060250
- 发表时间:2019-06-01
- 期刊:
- 影响因子:5.5
- 作者:Saotome, Tomonori;Yamazaki, Toshio;Kuroda, Yutaka
- 通讯作者:Kuroda, Yutaka
Biophysical characterization of an insoluble species formed by a chemically intact single disulfide bonded BPTI
由化学完整的单一二硫键 BPTI 形成的不溶性物质的生物物理表征
- DOI:
- 发表时间:2018
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Punitha Velmurugan;Yutaka Kuroda
- 通讯作者:Yutaka Kuroda
溶解性制御タグ(SCPタグ)を用いたタンパク質凝集体の形成速度の解析及びその制御法の開発
使用溶解度控制标签(SCP标签)分析蛋白质聚集体的形成率并开发控制方法
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Onchaiya Sawaros;Velmurugan Punitha;黒田 裕
- 通讯作者:黒田 裕
Amorphous aggregates of dengue variants induce irreversible depolarization of mitochondria and the release of cytochrome c. online
登革热变异体的无定形聚集体诱导线粒体不可逆去极化和细胞色素 c 的释放。
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Aklima Jannatul;Velmurugan Punitha;Kuroda Yutaka;Ohta Yoshihiro
- 通讯作者:Ohta Yoshihiro
Investigation on the relationship between cytotoxicity and amorphous oligomers
细胞毒性与无定形寡聚物关系的研究
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Velmurugan Punitha;Aklima Jannatul;Ohta Yoshihiro;Kuroda Yutaka
- 通讯作者:Kuroda Yutaka
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
黒田 裕其他文献
短いペプチドタグを付加したデングウイルス由来エンベロープタンパク質第3ドメインにおける会合状態および免疫原性の評価
添加短肽标签的登革热病毒来源包膜蛋白第三结构域的结合状态和免疫原性评估
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
三浦 史帆;Islam M Mohammad;黒田 裕 - 通讯作者:
黒田 裕
SCPタグを付加したBPTIの溶解傾向性におけるアミノ酸の寄与の探究
探索氨基酸对 SCP 标记的 BPTI 溶解倾向的贡献
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
髙木 開生;黒田 裕 - 通讯作者:
黒田 裕
Biophysical analysis of protein solubility and aggregation
蛋白质溶解度和聚集的生物物理分析
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
大川 真実;Rahman Nafsoon;三浦 史帆;黒田 裕;Kuroda Yutaka - 通讯作者:
Kuroda Yutaka
全原子MDシミュレーションによるアラニンスキャニング変異を導入したアミロイド形成ペプチドの凝集解析
使用全原子 MD 模拟引入丙氨酸扫描突变的淀粉样蛋白形成肽的聚集分析
- DOI:
- 发表时间:
2014 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小須田 慧司;末永 敦;佐藤 雄士;泰地 真弘人;黒田 裕 - 通讯作者:
黒田 裕
Control of protein aggregation and oligomerization using short SEP (Solubility Enhancing Peptide) tags
使用短 SEP(溶解度增强肽)标签控制蛋白质聚集和寡聚化
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Kabir Md. Golam;Islam Mohammmad Monirul;黒田 裕 - 通讯作者:
黒田 裕
黒田 裕的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('黒田 裕', 18)}}的其他基金
神経ペプチドの体系的なデータベースの構築と機械学習法を用いたその構造傾向性の予測
使用机器学习方法构建神经肽系统数据库并预测其结构趋势
- 批准号:
15F15080 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
デング由来エンベロープ糖タンパク質におけるエピトープ領域の新規解析法の開発
开发分析登革热包膜糖蛋白表位区域的新方法
- 批准号:
09F09096 - 财政年份:2009
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
アミノ酸配列単純化法を用いた蛋白質のフォールディング・溶解度を定量的に調べる研究
利用氨基酸序列简化法定量研究蛋白质折叠和溶解度的研究
- 批准号:
16041247 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
相似海外基金
Basic research to enable monitoring genome editing effects on dynamics of genetic information
监测基因组编辑对遗传信息动态影响的基础研究
- 批准号:
18K06679 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of extracellular matrix mimicking method for the regulation of stem cell functions by constructive approach
通过构建性方法开发细胞外基质模拟方法来调节干细胞功能
- 批准号:
17H04741 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
Studies on Asymmetric Nitroaldol Reaction using mutant albumins
突变体白蛋白不对称硝醛醇反应的研究
- 批准号:
16K05706 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Complex protein fishing method using proximity dependent reaction of modified transglutaminase
使用修饰转谷氨酰胺酶的邻近依赖性反应的复杂蛋白质捕捞方法
- 批准号:
16K06865 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of regenerative medical materials with the ability to promote wound healing using CXCL12.
使用 CXCL12 开发能够促进伤口愈合的再生医疗材料。
- 批准号:
16K11635 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 1.41万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)