Serial analysis of gene expression (SAGE) bei Raps: Quantitative, differentielle Expressionsanalyse im sich entwickelnden Rapssamen zur Erzeugung von Transkriptionsmarkern für die Samenentwicklung

油菜籽基因表达 (SAGE) 的系列分析：油菜籽发育过程中的定量差异表达分析，以产生用于种子发育的转录标记

• 批准号: 5446801
• 负责人: Professor Dr. Rod Snowdon
• 金额: --
• 依托单位: Lehrstuhl für Pflanzenzüchtung
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2007-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5446801?language=en
• 关键词: Serial; analysis; gene; expression; SAGE

Serial analysis of gene expression (SAGE) ist eine Hochdurchsatz- sequenzbasierte Methode für die detaillierte und umfassende Transkriptomanalyse verschiedener Gewebe- und/oder Genotypen. Mittels SAGE ist sowohl die qualitative als auch die quantitative Analyse der exprimierten Gene im jeweiligen Gewebe zu einem definierten Zeitpunkt möglich. Im Gegensatz zu anderen Methoden - wie der Microarray-Technologie - können hierbei auch Gene mit einem sehr niedrigen Expressionsniveau detektiert werden, da mehrere tausend Transkripte analysiert werden. Solche schwach exprimierten Sequenzen können u.a. eine wesentliche Rolle in der Regulation von Transkription und Translation spielen. Ziel dieses Vorhabens ist eine umfassende Studie der Genexpression im Laufe der Samenentwicklung bei Raps, um solche Gene zu identifizieren, deren Über- bzw. Unterexpression zu bestimmten Zeitpunkten der Samenentwicklung mit Änderungen von wertbestimmenden Sameninhaltsstoffen assoziert sind. Die Erstellung von SAGE-Bibliotheken für Raps wird zum ersten Mal ein detailliertes zeitliches Profil des Rapssamen-Transkriptoms liefern und ebenfalls erstmalig eine für die genetische Analyse von Kulturpflanzen in Deutschland bisher nicht verwendete Technik etablieren. Durch die Identifizierung und Quantifizierung von Genen, die an der Rapssamenentwicklung beteiligt sind, können grundlegende Kenntnisse über das Genrepertoir im sich entwickelnden Rapssamen gewonnen und ein einzigartiger Vergleich mit vorhandenen Informationen zum Samen-Transkriptom des engverwandten Modell-Kreuzblütler Arabidopsis thaliana ermöglicht werden. Nicht zuletzt erwarten wir neue Hinweise bzw. Informationen über die hinter der Gentranskription steckenden Kontrollmechanismen, die in Zukunft eine neue Generation von Tranksriptionsmarkern ermöglichen könnten.

基因表达系列分析 (SAGE) 是一种详细的方法和 Transkriptomanalysis verschiedener Gewebe- und/oder Genotypen。定义Zeitpunkt möglich。转录和翻译规则中的我们。 mit änderungen von wertbestimmenden Sameninhaltsstoffen assoziert sind。德国的 Kulturpflanzen bisher nicht verwendete Technik etablieren。与拟南芥模型相关的翻译信息。 Zukunft eine neue Generation von Tranksriptionsmarkern ermöglichen könnten。