Metabolic mechanism of host extracellular matrices, glycosaminoglycans, in streptococci

链球菌宿主细胞外基质、糖胺聚糖的代谢机制

• 批准号: 23580112
• 负责人: HASHIMOTO Wataru
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23580112/
• 关键词: 連鎖球菌; 宿主細胞外マトリックス; グリコサミノグリカン; 代謝機構; イソメラーゼ; 還元酵素; X線結晶構造解析; 不飽和グルクロニルヒドロラーゼ; 応用微生物学; 微生物代謝; 構造生物学; 代謝酵素; 遺伝子クラスター; 構造機能相関; 異性化酵素; 細胞外マトリックス; 感染症

Pathogenic streptococci degrade host extracellular matrices, glycosaminoglycans, to unsaturated uronic acid and amino sugar by polysaccharide lyase and unsaturated glucuronyl hydrolase (UGL). Unsaturated uronic acid was found metabolized to 2-keto-3-deoxy-D-gluconic acid through subsequent reaction of Gbs1892 isomerase and Gbs1891 reductase. These enzymes were encoded in the UGL genetic cluster, suggesting that repression of this cluster contributes to establishment of a novel therapy for strectococcal infectious diseases.

致病性链球菌降解宿主细胞外基质，糖胺聚糖，通过多糖裂解酶和不饱和葡萄糖酰基水解酶（UGL）通过多糖裂解酶和非饱和尿酸和氨基糖。发现不饱和的尿酸通过随后的GBS1892异构酶和GBS1891还原酶的后续反应来代谢为2-Keto-3-脱氧-D-葡萄糖酸。这些酶是在UGL遗传簇中编码的，这表明对该簇的抑制有助于建立一种新型的链球菌传染病疗法。

项目成果

Induced-fit motion of a lid loop involved in catalysis in alginate lyase A1-III. Acta Crystallograph. Sect

参与藻酸盐裂解酶 A1-III 催化的盖环的诱导配合运动。

• 发表时间: 2012
• 期刊: D Biological Crystallopgraphy
• 作者: Bunzo Mikami;Mizuho Ban;Sachiko Suzuki;Hye-Jin Yoon;Osamu Miyake;Masayuki Yamasaki;Kohei Ogura;Yukie Maruyama;Wataru Hashimoto;and Kousaku Murata
• 通讯作者: and Kousaku Murata

⑤Yukie Maruyama, Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto. Crystal structure of heparan sulfate lyase HepC mutant from Pedobacter heparinus. PDB ID, 4MMI, 2013年9月9日.(研究成果データベース)

⑤Yukie Maruyama、Yusuke Nakamichi、Bunzo Mikami、Kousaku Murata 和 Wataru Hashimoto。来自 PDB ID 的硫酸乙酰肝素裂解酶 HepC 突变体的晶体结构，4MMI，2013 年 9 月 9 日。（研究结果数据库）

③Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata. Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase specific for heparin. PDB ID, 3WIW, 2013年9月26日.(研究成果データベース)

③Yusuke Nakamichi、Bunzo Mikami、Wataru Hashimoto、Kousaku Murata。肝素特异性不饱和葡萄糖醛酸水解酶的晶体结构，3WIW，2013 年 9 月 26 日。（研究结果数据库）

Recognition of Heteropolysaccharide Alginate by Periplasmic Solute-Binding Proteins of a Bacterial ABC Transporter

• DOI: 10.1021/bi300194f
• 发表时间: 2012-05-01
• 期刊: BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 2.9
• 作者: Nishitani, Yu;Maruyama, Yukie;Murata, Kousaku
• 通讯作者: Murata, Kousaku

細菌のアルギン酸代謝に関わる新規なNADH要求性α-ケト酸還元酵素

一种参与细菌藻酸盐代谢的新型 NADH 需要 α-酮酸还原酶

• 发表时间: 2013
• 作者: 高瀬隆一;河井重幸;橋本渉;村田幸作
• 通讯作者: 村田幸作