Identification and utilization of genes for carbon-concentratingmechanism and hydrogen production in microalga by digital expression analyses.

通过数字表达分析鉴定和利用微藻碳浓缩机制和产氢基因。

基本信息

批准号：
22380059
负责人：
FUKUZAWA Hideya
金额：
$ 11.4万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

Algal photosynthesis, which is base for production of bio-materials, is supported by carbon-concentrating mechanism (CCM). To identify CCM-related genes, RNA-seq analyses using different RNA samples prepared from cells cultured in various stress conditions including low-CO2 or nitrogen starved conditions. Using RNA-seq data and genomic sequence data, we have developed a new expression database for green alga, Chlamydomonas reinhardtii. Genes which are induced in low-CO2 stress conditions, nitrogen-starved conditions, and anaerobic conditions were identified by comparing the RNA expression profiles. Several CCM-related genes were artificially overexpressed in transgenic Chlamydomonas cells and the photosynthetic characteristics were show to be significantly improved than wild type cells.

藻类材料的生产基础藻类光合作用是由碳浓缩机制（CCM）支持的。为了鉴定与CCM相关的基因，使用在各种应力条件下培养的细胞制备的不同RNA样品进行RNA-Seq分析，包括低CO2或氮饥饿条件。使用RNA-seq数据和基因组序列数据，我们开发了一个用于绿色藻类的新表达数据库，Chlamydomonas Reinhardtii。通过比较RNA表达谱，鉴定出在低CO2应力条件，氮含有条件和厌氧条件下诱导的基因。在转基因衣原体细胞中人为地表达了几种与CCM相关的基因，并且光合作用特性比野生型细胞显着改善。

项目成果

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专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Visualization of digital expression profiles on the nuclear genome of the mating-type minus strain by Kyoto Chlamydomonas Genome Database (KCGD): Expression from the mating-type locus and CO2-limiting stress responses

京都衣藻基因组数据库 (KCGD) 对交配型负菌株核基因组数字表达谱的可视化：交配型基因座的表达和 CO2 限制应激反应

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
中尾祐士;服部淳子;原唯史;山口浩輝;郷田秀一郎;真柳浩太;神田大輔;角田佳充;木村誠;Fukuzawa H
通讯作者：
Fukuzawa H

緑藻クラミドモナスにおける CCM1 複合体を介した CO_2 応答性遺伝子の転写調節機構

绿藻衣藻中CO_2响应基因通过CCM1复合体的转录调控

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
山野隆志;谷口丈晃;舟津尚子;中田光隆;柳瀬麻里;鈴木穣;菅野純夫;福澤秀哉
通讯作者：
福澤秀哉

Photosynthetic carbon assimilation is dependent on the pyrenoid-localized protein complex LCIB/LCIC, which responds to CO_2 and light

光合碳同化依赖于类核蛋白复合物 LCIB/LCIC，它对 CO_2 和光做出反应

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Asada A;Yamano T;Fukuzawa H
通讯作者：
Fukuzawa H

緑藻クラミドモナスにおける無機炭素濃縮機構と脂質代謝

绿藻衣藻无机碳富集机制及脂质代谢

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
光合成研究
影响因子：
0
作者：
T. Shiota;M. Maruyama;M. Miura;Y. Tamura;K. Yamano;M. Esaki;and T. Endo;田村　康;Makiko Kobayashi;Yamashino Takahumi;Yamashino Takahumi;Ito Shogo;Kumiko Samejima;Laura Wood;鮫島久美子;本田信治;高鳥直士，熊野岳，西駕秀俊，西田宏記;福澤秀哉
通讯作者：
福澤秀哉

細胞壁溶解が不要なクラミドモナス形質転換法を用いた挿入変異株 Index ライブラリーの作成

使用不需要细胞壁裂解的衣藻转化方法创建插入突变体索引库