Comparative genome study on evolution and diversity of lower plants

低等植物进化和多样性的比较基因组研究

• 批准号: 17018020
• 负责人: FUKUZAWA Hideya
• 金额: $ 71.94万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018020/
• 关键词: 光合成; 環境応答; 生殖; 緑藻; 苔類; 鮮類; ゲノム; 次世代シーケンサー; 蘚類; 二酸化炭素; 蘚苔類; 形態形成; 完全長Cdna; コケ植物; 完全長cDNA; 緑藻クラミドモナス; ゼニゴケY染色体; ヒメツリガネゴケ; 完全長cDNAライブラリ; 遺伝子発現プロファイル; 低温順化; 生殖器官; 発生; 発生分化; 適応進化; 藻クラミドモナス; 性染色体

By determining sequences of newly established genomic libraries (BAC and FOSMID) of Chlamydomonas reinhardtii, we have identified new genes on the genomic R-domain regions responsible to the sex determination. We have developed genome viewers which display the detail information on locations of EST, BAC, FOSMID clones as well as the Illumina or SOLid short reads (36-76 nucleotide) on the chromosomes of Chlamydomonas reinhardtii as well as of a moss, Physcomitrella patenswas. Functions of CO_2-responsive proteins and CO_2-signal transduction pathway was. EST and SNPs/SSRs markers were isolated from a liverwort, Marchantia polymorpha. Genes for morphogenesis were phylogenetically analyzed, revealed the evolution of land plants.

通过确定新建立的基因组文库（BAC和FOSMID）reinhardtii的序列，我们已经确定了负责性别确定的基因组R域区域的新基因。我们开发了基因组观看仪，这些观众在EST，BAC，FOSMID克隆以及Reinhardtii染色体上以及Moss，Physcomitrella Patenswas上的详细信息以及Illumina或实心短读（36-76个核苷酸）上。 CO_2响应蛋白和CO_2信号转导途径的功能是。从Liverwort（Marchantia Polymorpha）分离出EST和SNP/SSRS标记。对形态发生的基因进行了系统发育分析，揭示了土地植物的演变。

项目成果

Gene organization of the liverwort Y chromosome reveals distinct sex chromosome evolution in a haploid system

• DOI: 10.1073/pnas.0609054104
• 发表时间: 2007-04-10
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Yamato, Katsuyuki T.;Ishizaki, Kimitsune;Ohyama, Kanji
• 通讯作者: Ohyama, Kanji

クラミドモナス統合データベースChlamyBase (Kyoto Chlamydomonas Genome Database, KCGD)

衣藻综合数据库ChlamyBase（京都衣藻基因组数据库，KCGD）

Production of arachidonic and eicosapentaenoic acids in plants using bryophyte fatty acid delta6-desaturase, delta6-elongase, and delta5-desaturase genes

使用苔藓植物脂肪酸δ6-去饱和酶、δ6-延长酶和δ5-去饱和酶基因在植物中生产花生四烯酸和二十碳五烯酸

• 发表时间: 2008
• 期刊: Biosci. Biotechnol. Biochem 72
• 作者: Kajikawa M;他
• 通讯作者: 他

A front-end desaturase from the green alga Chlamydomonas reinhardtii produces pinolenic and coniferonic acids by ω13 desaturation.

来自绿藻莱茵衣藻的前端去饱和酶通过 ω13 去饱和产生松油酸和松柏酸。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Plant Cell Physiol. 47
• 作者: Yamato;K.T.et al.;Hanawa Y他;Ozaki H 他;Kajikawa M
• 通讯作者: Kajikawa M

無機炭素濃縮に必要であるLCIBはピレノイド周囲でLCICと複合体を形成して機能する

LCIB 是无机碳富集所必需的，它通过与核糖核周围的 LCIC 形成复合物来发挥作用。

• 发表时间: 2009
• 作者: 山野隆志;他
• 通讯作者: 他