Comprehensive Analysis for Improvement of the Therapeutic Outcome against Esophageal Cancer by the High-Precision Molecular and Genetic Evaluation

高精度分子遗传评价综合分析食管癌治疗效果的改善

• 批准号: 21229015
• 负责人: MORI Masaki
• 金额: $ 135.37万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009-05-11 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21229015/
• 关键词: 食道扁平上皮癌; エキソーム解析; CYP2A6; ALDH2; pathway解析; コピー数解析; エキソーム; 変異スペクトラ; 喫煙・飲酒; スーパーコンピュータ; 遺伝子多型; 環境側因子; 変異率; EBウイルス; 三位一体解析; 次世代シークエンサー; アレイCGH; 発現アレイ; 17q25; Notch1; 外科学; 分子遺伝学; オミックス医療

To obtain a landscape of genomic alterations in ESCC, we performed whole-exome sequencing on 144 paired DNA samples from Japanese cohort, combined with SNP-array based CN profiling. Substitution patterns of single-nucleotide mutations substantially vary among cases, and the variation was significantly associated with not only alcohol and tobacco consumption, but also related genetic factors: ALDH2 and CYP2A6 polymorphisms. We also identified TP53, NOTCH1, MLL2, NFE2L2, etc. as significantly mutated genes. Moreover, TET2 and NFE2L2 mutations contribute to the malignancy by upregulating invasiveness and oxidoreductase activity, respectively. Finally, our pathway-level analysis shows that genomic alteration are dispersed across cancer-associated pathways including cell cycle, epigenetic regulators, NOTCH, RTK-PI3K pathways etc. Collectively, this study contributes to understanding of ESCC pathophysiology and provides a new basis for designing novel therapeutic strategies.

为了获得ESCC中基因组改变的景观，我们对日本同胞的144个配对DNA样品进行了全外观测序，并结合了基于SNP阵列的CN分析。单个核苷酸突变的替代模式在病例中有很大变化，并且这种变化不仅与酒精和烟草的消费量显着相关，还与相关的遗传因素相关：ALDH2和CYP2A6多态性。我们还将TP53，Notch1，Mll2，NFE2L2等确定为显着突变的基因。此外，TET2和NFE2L2突变分别通过上调侵袭性和氧化还原酶活性来促进恶性肿瘤。最后，我们的途径级分析表明，基因组改变分散在癌症相关的途径之间，包括细胞周期，表观遗传调节剂，Notch，RTK-PI3K途径等，这项研究有助于理解ESCC病理生理学，并为设计新的治疗策略提供新的基础。

项目成果

進行癌はなぜ治りにくいか?-癌幹細胞からの知見-

为什么晚期癌症难以治愈？ - 癌症干细胞的知识 -

• 发表时间: 2011
• 期刊: 別府市医師会報
• 作者: Yamamoto;M.;Saito;T.;Isogai;A.;Kurita;M.;Kondo;T.;et al.;森正樹
• 通讯作者: 森正樹

癌の転移・浸潤メカニズムの解明に向けて～マウスモデルを用いた研究で世界をリード～

阐明癌症转移和侵袭的机制 - 小鼠模型研究处于世界领先地位 -

• 发表时间: 2011
• 期刊: 大腸癌Frontier
• 作者: Hasegawa H;Fujita T;et al.;森正樹
• 通讯作者: 森正樹

再発3

复发3

• 发表时间: 2011
• 作者: 小林ゆり;齋藤継之;磯貝 明;Fujita T;森正樹
• 通讯作者: 森正樹

Strong interaction between alcohol drinking and smoking habits on ESCC was observed among only individuals having ADH1B and/or ALDH2 variants

仅在具有 ADH1B 和/或 ALDH2 变异的个体中观察到饮酒和吸烟习惯对 ESCC 的强烈相互作用

• 发表时间: 2010
• 作者: Tanaka F;Yamamoto K;Suzuki S;Inoue H;Koshi Mimori;Ishii H;Mori M;Kiban S team
• 通讯作者: Kiban S team

がん転移の病態と治療

癌症转移的病理学和治疗

• 发表时间: 2011
• 作者: Keita Emura;Atsuko Miyaji;and Kazumasa Omote;中尾一和;森正樹
• 通讯作者: 森正樹