Identification of Regulation Targets and Analysis of Regulation Modes by Uncharacterized Transcription Factors from Escherichia coli

大肠杆菌非特征性转录因子调控靶点的识别及调控模式分析

• 批准号: 18310133
• 负责人: ISHIHAMA Akira
• 金额: $ 11.67万
• 依托单位: Hosei University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18310133/
• 关键词: ゲノム調節; 転写; 遺伝子; 細菌; 発現制御; 転写因子; 転写包括制御; RNAポリメラーゼ; プロモーター; 転写制御ネットワーク; GENOMIC SELEX; 大腸菌; 環境応答; 転写制御; 転写調節ネットワーク; GENONIC SELEX

転写酵素RNAポリメラーゼの転写対象遺伝子群の選択は、転写因子との相互作用によって決定される。約300種類の大腸菌転写因子のうち、約100種は制御機能未知である。本研究では、機能未知転写因子が認識する配列から制御機能を同定するGenomic SELEX法を開発した。純化転写因子を利用した解析から、各転写因子の制御対象遺伝子群の同定に成功したことで、ゲノム転写包括制御の全貌解明の展望が開けた。

转录酶RNA聚合酶的转录基因的选择取决于它们与转录因子的相互作用。在大约300种类型的大肠杆菌转录因子中，大约100个具有未知的调节功能。在这项研究中，我们开发了一种基因组SELEX方法，该方法从未知功能转录因子识别的序列中识别调节功能。使用纯化的转录因子通过分析对每个转录因子进行调节的基因组的成功鉴定为完全阐明综合基因组转录控制的前景打开了前景。

项目成果

大腸菌ゲノム転写の包括制御

全面控制大肠杆菌基因组转录

• 发表时间: 2009
• 作者: 太田 邦史;他;石浜明
• 通讯作者: 石浜明

Comprehensive analysis for the recognition sequences of DNA-binding transcription factors within the E. coli genome using the newly developed‘Promoter Chip'

利用新开发的“启动子芯片”全面分析大肠杆菌基因组内DNA结合转录因子的识别序列

• 发表时间: 2009
• 作者: Yamamoto;K.;Shimada;T.;Ishlhama;A.
• 通讯作者: A.

Curli織毛発現調節の分子機構の解明

阐明Curli毛发表达调控的分子机制

• 发表时间: 2007
• 作者: 小笠原 寛;山田 佳代子;郡 彩子;山本 兼由;石浜 明
• 通讯作者: 石浜 明

Transcriptionai Response of Escherichia coli to Extemal Metais

大肠杆菌对外部代谢的转录反应

• 发表时间: 2008
• 作者: K.Yamamoto and A;ishihama
• 通讯作者: ishihama

Multi-Scale Genetics towards Understanding the Regulatory Roles of All Transcription Factors from a Single Organism Escherichia coll. Asian Conference on Transcription (ACT)

多尺度遗传学了解单一生物体埃希氏菌所有转录因子的调节作用。

• 发表时间: 2008
• 作者: Ishihama;A.
• 通讯作者: A.