RSウイルス感染症の地理情報システム(GIS)を用いた空間的分子疫学研究

利用地理信息系统（GIS）进行呼吸道合胞病毒感染的空间分子流行病学研究

• 批准号: 15790520
• 负责人: 齋藤 玲子
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Niigata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15790520/
• 关键词: RSウイルス; 分子疫学; 地理情報システム(GIS); 感染症; 地理情報システム

RSウイルス(以下RSVと略す)はA型とB型に分類され、主に冬期に流行し乳幼児の下気道感染起因ウイルスとして重要である。我々は表面抗原であるG蛋白第二可変領域の塩基解析からA又はB型と遺伝子型を決定し、RSウイルスの地域内流行状況について地理情報システム(Geographic Information System)を用いて地理的・空間的に解析してきた。前年度を通じて多数の検体が集まったため今年度は分子生物学的遺伝子型解析を主に行った。平成15年度より引き続き平成16年度も新潟市内の小児科医院を受診した下気道炎を疑わせる乳幼児から、同意の上、鼻腔吸引液を採取し、患者検体からRT-PCRでA・B型の分類を行い、さらにPCR産物をシークエンスしてRSVのG蛋白第二可変部位の塩基配列を決定し、Peretらの方法(J Gen Virol, 1998)を用い樹形図に展開し遺伝子型を決定した。前回報告した平成15年7月以降、平成17年2月まで354件検体採取され、うち123件がA型、27件がB型RSVであった。平成15年は9月から11月にかけてA型を中心とした流行で、平成16年1月以降春先まで散発的にB型がみられ、同年11〜12月に再びA型が主流の大きな流行がみられた。平成15年は遺伝子型GA5がA型の主流であったが、平成16年秋からは今までの分類型に属さない新しい遺伝子型のA型RSVの流行をみており、この変化は宿主免疫を逃れるための変異と思われRSVの進化を見る上で今後の流行動勢が興味深い。B型RSVに関しては平成14年秋に初めて検出された、G蛋白第二可変部位に60塩基の挿入がみられる特殊な型が平成15年も検出され続け、この年は全例同型であった。平成16年秋以降も検出されているものの挿入の無い通常型も混じっていた。この特殊なB型RSVは平成11年にブエノスアイレスで初めて検出され、平成14年秋〜冬には当教室以外にも札幌、横浜市でも確認され全国的に流行した可能性があり、RSVの世界的な伝播形式を考える上でも非常に興味深い所見と思われ、英文雑誌発表を行った(次ページ研究発表リスト)。

RS病毒（以下简称为RSV缩写为RSV）分为A型和B型，主要在冬季流行，并且很重要，这是由婴儿和幼儿的下呼吸道感染引起的病毒。我们已经从G蛋白的第二个变量区域的基础分析（是表面抗原）确定了A或B类型和基因型，并使用地理信息系统在地理位置和空间上分析了RS病毒的局部爆发状态。由于上一年收集了大量标本，因此我们今年主要进行了分子生物学基因分型。从2003年起，2004年，从婴儿和幼儿收集了下呼吸道炎症的婴儿和幼儿，他们在同意同意后访问了尼加塔市的一家儿科诊所，患者标本被分类为A和B类型，使用RT-PCR进行了序列，并确定了第二个基本序列，并确定了第二个基本序列，并确定了第二个基本序列的量子。 Peret等方法。 （J Gen Virol，1998）确定基因型。自2003年7月和2005年2月的上一份报告以来，收集了354个标本，其中123个是A型，27个是B型RSV。在2003年，该流行病主要是从9月至11月的A型，从2004年1月到早春，B型被偶发地看到，并且在同年的11月和12月再次出现了一场主要的流行病。在2003年，基因型GA5是A型的主流，但是自2004年秋天以来，我们已经看到A-Type RSV的流行（一种不属于先前分类的新基因型），这种变化被认为是逃避宿主免疫力的突变，未来的行为将有趣地研究RSV的进化。关于B RSV型，这是一种特殊类型，在2002年秋天首次检测到，其中60个碱基被插入第二个变量G蛋白位点，并于2003年继续检测到，在所有情况下，它都是同构的。它还包括一个常规型号，该模型被检测到2004年秋季，但没有插入。这种特殊类型的B RSV于1999年首次在布宜诺斯艾利斯（Buenos Aires）检测到，并在2002年秋季至冬季在萨波罗和横滨得到证实，并可能已成为全国性的趋势。在考虑全球RSV传输形式时，这似乎是一个非常有趣的发现，并发表在英语杂志上（下一页的研究演示列表）。

项目成果

Molecular epidemiology of respiratory syncytial virus infections among children with acute respiratory symptoms in a community over three seasons

• DOI: 10.1128/jcm.43.1.36-40.2005
• 发表时间: 2005-01-01
• 期刊: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 9.4
• 作者: Sato, M;Saito, R;Suzuki, H
• 通讯作者: Suzuki, H