プロテオームによる糖尿病病態解析法の開発

基于蛋白质组的糖尿病病理分析方法的开发

基本信息

批准号：
02J61461
负责人：
佐藤守
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Kitasato University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

当研究は、糖尿病病態を解明していく上で有用または必要となる解析法の開発を目的としている。本年度の主な成果は以下の2点である。1.多変量解析によるプロテオーム解析結果からの因子抽出と状態把握2型糖尿病モデルラットOLETFの約40種類の臓器において、週齢をおってプロテオームの変動をアガロース二次元電気泳動法で解析してきた。画像解析もほぼ終了しているが、変数が膨大な数になり、病態把握が困難な状態にあった。そこで今回、多変量解析を用いた因子抽出と病態把握を進めてきた。プロテオーム解析データの多変量解析例は数例しかなく、適応・最適化が困難ではあったが、血糖値、尿量、体重等で解析した場合、病態でのグルーピングに成功した。しかしながら、二次元電気泳動ゲルパターンから得られる膨大な数の変数から同様のグルーピングを得ることはまだできていない。これについては、現在アルゴリズムを作成中である。以前から解析している甲状腺機能低下症ラットのデータを用いて多変量解析を立ち上げ、ホルモン治療による回復度合い等の病態を三次元空間上で把握することに成功した。解析ソフト会社主催で行われたミーティングにおいてポスター賞を頂く事ができた。結果については現在論文作成中である。2.質量分析計による酸化タンパク質検出タグの開発老化等にともなうタンパク質の酸化はかなり知られているが、糖尿病では知られていない。当研究室で糖尿病モデルラット対象に酸化タンパク質の検出を行ったところ、糖尿病ではタンパク質の酸化が進んでいることが検出された。(Free Radial Biology ＆ Medicine 2003,Jan 1;34(1):11-22)しかしながら、この検出法では酸化タンパク質の酸化部位を特定することは無理である。そこで本年度、酸化タンパク質の定量比較、酸化部位特定をめざしたタグの開発を進めてきた。現在までに、標準酸化タンパク質の分離と検出に成功した。結果については現在論文作成中である。

本研究旨在开发对于阐明糖尿病病理学有用或必要的分析方法。今年的主要成果有以下两点。 1.使用多变量分析从蛋白质组分析结果中提取因素并了解状态我们使用琼脂糖二维电泳分析了2型糖尿病模型大鼠OLETF的约40个器官在一周龄期间的蛋白质组变化。图像分析已基本完成，但大量的变量使得了解疾病状态变得困难。因此，我们采用多变量分析来提取因素并了解病理状况。虽然蛋白质组分析数据的多变量分析例子很少，而且很难适应和优化，但我们在分析血糖水平、尿量、体重等时成功地根据病理情况进行分组。然而，目前还不可能从二维电泳凝胶图案获得的大量变量中获得类似的分组。我们目前正在为此开发一种算法。利用之前分析过的甲状腺功能减退大鼠的数据，我们进行了多变量分析，并成功地了解了三维空间中的病理状况，例如激素治疗的恢复程度。我在一家分析软件公司主办的会议上获得了海报奖。目前正在撰写有关结果的论文。 2. 开发使用质谱仪检测氧化蛋白质的标签伴随衰老的蛋白质氧化是众所周知的，但在糖尿病中却并非如此。当我们的实验室在糖尿病模型大鼠中检测到氧化蛋白质时，我们发现蛋白质氧化在糖尿病中进展。 (Free Radial Biology & Medicine 2003，Jan 1；34(1)：11-22) 然而，利用该检测方法，不可能确定氧化蛋白质的氧化位点。因此，今年我们一直在开发标签来定量比较氧化的蛋白质并识别氧化位点。迄今为止，标准氧化蛋白已被成功分离和检测。目前正在撰写有关结果的论文。