多色蛍光標識プライマーを用いたSTR多座位同時増幅分析法による日本人起源の探究

使用多色荧光标记引物进行 STR 多位点同步扩增分析探索日本起源

• 批准号: 12012204
• 负责人: 山本 敏充
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12012204/
• 关键词: STR; Multiplex PCR; Capillary electrophoresis; 集団遺伝学; 日本人の起源; 蛍光標識プライマー

法医学の分野では、DNAによる個人識別や親子鑑定などのため、STR(Short Tandem Repeat)領域が最も汎用されている。これらを分析するために、多色蛍光標識プライマーを用いたMultiplex-PCR法を利用して開発されたキット(AmpFlSTR Profiler plus kitとCofiler kit)を用いて、13のローカス(D3S1358,vWA,FGA,TH01,TPOX,CSF1PO,D18S51,D21S11,D8S1179,D16S539,D5S818,D13S317,D7S820)が簡便に増幅・タイピングできる。この2つのキットを利用して計13STRローカスのアレル頻度を中国人5集団(陜西省108名、江蘇省119名、福建省116名、湖南省105名、広東省111名)及びタイ人(バンコク市183名)で算出した。昨年度までに各ローカスのアレル頻度を算出した日本人2集団(本土及び琉球)、韓国人(ソウル市)、中国人(北京市近郊)、ミャンマー人(ヤンゴン市)を含めた計11集団で、アレル頻度が比較的安定するといわれている100以上のサンプル数を用いて、計1493サンプルをタイピングした。この13ローカスのSTRのアレル頻度分布から遺伝距離DAを算出し、近隣結合法により系統樹を作成した。本土日本人と沖縄日本人で1つ、中国の北中部である北京市近郊、陜西省と江蘇省の集団で1つ、中国の南部である福建省、湖南省と広東省の集団で1つ、ビルマ人とタイ人で1つの同じクラスターを形成し、そのtopologyは現在の地理的分布をよく反映していた。

在法医医学领域，STR（短串联重复）领域是使用DNA和亲子测试的个人鉴定的最常见领域类型。为了分析这些分析，13个位置（D3S1358，VWA，FGA，TH01，TPOX，CSF1PO，D18S51，D18S51，D21S11，D8S1179，D16S539，D16S539，D5S818，D13S317，D13S317，D7S820）易于使用和使用COF（AMPLIFIFIED）（AMPLIFIFIED）（AMPLIFIED）（AMPLIFIED（AMPLIFIED））套件）使用多色荧光标记的引物使用多重PCR方法开发。使用这两个套件，由五个中国群体（Shaanxi Province的108人，江苏省119人，福建省的116人，湖南省的116人，在荷兰省的116人，在广东省的111人）和塔尼斯（Bangkok City的183人）计算了13个str的等位基因的频率。总共使用总共11个样本键入了1,493个样本，其中包括两个日本人口（大陆和龙京人），韩国人（首尔），中国人（北京）和缅甸（Yangon），这些样本计算了去年的等位基因频率。根据13个基因座的Str的等位基因频率分布计算遗传距离DA，并使用相邻的耦合方法创建了系统发育树。它形成了相同的集群：一个用于大陆的日本人和冲绳的日本人，一个用于北京的郊区，一个用于中国中部的中国，一个用于Shaanxi和Jiangsu省，一个用于中国南部，一个用于中国的南部，一个是福建和匈奴和恩南和吉安的群体，一个是为福吉安和恩南和泰国人提供的。

项目成果

T.Yoshimoto: "A new triplex STR system without irregular alleles by silver staining and its potential application to forensic analvsis."J.Forensic Sci.. 46(in press). (2001)

T.Yoshimoto：“一种通过银染色去除不规则等位基因的新三链 STR 系统及其在法医分析中的潜在应用。”J.Forensic Sc​​i.. 46（印刷中）。

T.Yamamoto: "The application of minisatellite variant repeat mapping by PCR (MVR-PCR) in a paternity case showing false exclusion due to STR mutation."J.Forensic Sci.. 46(in press). (2001)

T.Yamamoto：“通过 PCR (MVR-PCR) 进行小卫星变异重复定位在亲子鉴定案例中的应用，显示由于 STR 突变导致的错误排除。”J.Forensic Sc​​i.. 46（印刷中）。

M.Tanaka: "Usefulness of a toothbrush as a source of evidential DNA for typing."J.Forensic Sci.. 45(3). 674-676 (2000)

M.Tanaka：“牙刷作为打字证据 DNA 来源的有用性。”J.Forensic Sc​​i. 45(3)。