新しい遺伝子座位(D7S21)で応用されたMVR-PCR法による集団遺伝学的解析

使用 MVR-PCR 方法对新基因位点 (D7S21) 进行群体遗传分析

基本信息

批准号：
08670482
负责人：
山本敏充
金额：
$ 1.15万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
1996
资助国家：
日本
起止时间：
1996 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08670482/
关键词：
ヒトミニサテライト MVR-PCR D7S21 集団遺伝

项目摘要

ミニサテライトDNAの1つであるMS31Aのフランキング領域に存在する3箇所の遺伝的多型部位を利用してアリルの繰り返し単位内の変異(a-,t-,O-タイプ)をマッピングするアリル特異的MVR-PCR法を用いて149個の血縁関係のない日本人のアリルを分析したところ、異なるアリルが147種類検出された。ドットマトリックス法によってホモロジーの分析をしたところ、それぞれ部分的に特定のリピート配列を共有する7つのグループに分けられ、99.99%以上の高いヘテロ接合度を示したが、17.4%のアリルは全長50リピート程度の比較的短いものであり、これらの殆どが酷似したリピート配列を持ち、Caucasianのアリルには見られないものであった。これらの短いアリルにはaOaOaで繰り返しが終わる特徴的な構造を持つものが多くみられた。また、繰り返し単位内のa-,t-,O-タイプの組成は、それぞれ49.6%、45.3%、0.9%でa-,t-タイプの比はほとんど同じであった。このグループのアリルの突然変異率は高くないことが予想され、これらのアリルは他のアリル特異的MVR-PCR法が可能で、現在までに多くのアリルが検出されているMS32共に用いるとさらに多くの集団遺伝学的研究、特に日本人集団の起源などの研究にかかさない遺伝情報を与えてくれることがわかった。このように、MS31Aアリルのアリル特異的MVR-PCR法によるマッピングは日本人だけでなく、世界中における民族特異性や相互の関連性について極めて有力な遺伝マーカーになり得るものと期待された。

当使用等位基因特异性MVR-PCR法对149个无关的日本等位基因进行分析时，在Minisatellite DNA的侧翼地区使用三个遗传多态性位点，是Minisatellite DNA之一，以映射突变（A-，T-，O-Types），在不相反的反复位置中，是147个不同的异位。使用DOT矩阵方法进行了同源分析，每个组分为七个组，分别具有特定的重复序列，高度的杂合性为99.99％或更多，但17.4％的等位基因相对较短，总长度约为50个重复，其中大多数重复序列非常相似，并且在Caucas Allees中没有发现非常相似的重复序列。这些短等位基因中的许多具有独特的结构，以AOAOA结束。此外，重复单元中A-，T-和O型的组成分别为49.6％，45.3％和0.9％，A-和T型的比率几乎相同。预计该组中等位基因的突变速率不高，并且发现这些等位基因可以由其他等位基因特异性的MVR-PCR方法使用，并且当与MS32一起使用（迄今已检测到的MS32）时，它提供的遗传信息提供了更多的遗传信息，这些信息不需要用于更多的人群遗传研究，尤其是日本人群的起源。因此，可以预期，由等位基因特异性MVR-PCR对MS31A烯丙基的映射可能是种族特异性的极有效的遗传标记，并且不仅在日本人民，而且在世界各地都相互关联。