抗体ライブラリーを用いた生体分子の標的認識の分子機構データベースの構築

利用抗体库构建生物分子靶点识别的分子机制数据库

基本信息

批准号：
15014230
负责人：
林宣宏
金额：
$ 3.84万
依托单位：
Fujita Health University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

抗体の標的分子認識の分子機構を抗体ライブラリーを使って網羅的に扱って、生物が有している標的分子の認識機構を総括的に解析し、生命分子の有する標的分子認識機構のデータベースを作成する。最初の段階では[エピトープ]-[抗体の抗原認識部位のアミノ酸配列]相関データベースの構築を進める。ある程度データが蓄積されれば、機能が未知の遺伝子産物に対する抗体の抗原認識部位のアミノ酸配列から、当該データベースの検索によりその機能が未知の遺伝子産物が関わっている相互作用を抽出することができる。"[抗体]-[抗原]データベース"、"[抗体]-[エピトープ]データベース"、"[抗体機能部位]-[エピトープ]データベース"の段階的構築を進めている。"[抗体]-[抗原]データベース"の構築は順調に進んでおり、既に約6,000個の抗体遺伝子の登録を終えている。また、いくつかの抗体に対して、抗原に対する結合定数とそのエピトープの決定を体系的に行った。その結果、免疫系は、最初は認識があいまいで抗原特異性がオーバラップする抗体群(naive repertory)をあらかじめ準備していて、何かしらの抗原が侵入してきたときには、一気に特定の抗体の抗原特異性をあげてそれに対処するというようにして、分子認識のあいまいな抗体と厳密な抗体を巧妙に使い分けていることが分子レベルで解ってきた。最初は標的認識があいまいな抗体の標的認識特異性を、生体がどのように高めているのかを学ぶことは、免疫学の見地からのみならず、バイオナノプローブの標的認識装置を設計するうえで大変に有効である。さらに、当初、仮定したように、naive repertoryから得られた抗体により、抗原と構造が似ている他の分子を捕まえることに成功した。

使用抗体文库对抗体靶分子识别的分子机制进行了全面处理，并分析了活生物体所拥有的靶分子的识别机制，并创建了由活体分子持有的靶分子识别机制的数据库。在第一步中，我们继续进行[抗体识别位点的[表位] - [氨基酸序列]相关数据库。一旦积累了一定量的数据，就可以通过搜索数据库来从具有未知功能的基因产物的抗原识别位点的氨基酸识别位点的氨基酸序列中提取涉及未知基因产物的相互作用。我们正在“ [抗体] - [抗原]数据库”，“ [抗体] - [表位]数据库”和“ [抗体函数位点] - [EPITEPOPE]数据库”的阶段进展。 “抗体 - 抗原数据库”的构建正在顺利进行，并且已经注册了大约6,000个抗体基因。此外，对于某些抗体，系统地确定了抗原及其表位的结合常数。结果，在分子水平上发现了免疫系统已提前准备了幼稚的记忆，在识别含糊不清和抗原特异性重叠时，并且当一些抗原入侵时，它迅速提高了特定抗体的抗原特异性并与之交易，并且在分子水平上巧妙地将抗体使用抗体识别抗体，并严格使用抗体。了解生物体如何增强最初具有模棱两可靶标识别的抗体的靶标识别特异性不仅在免疫学的角度也非常有效，而且在设计bionananoprobes的目标识别设备方面也非常有效。此外，正如最初假定的那样，从幼稚存储库中获得的抗体能够捕获与抗原结构相似的其他分子。

项目成果

期刊论文数量（6）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Mamoru Matsubara, Koiti Titani, Hisaaki Taniguchi, Nobuhiro Hayashi: "Direct involvement of protein myristoylation in MARCKS-calmodulin interaction."J.Biol.Chem.. 278. 48898-48902 (2003)

Mamoru Matsubara、Koiti Titani、Hisaaki Taniguchi、Nobuhiro Hayashi：“蛋白质肉豆蔻酰化直接参与 MARCKS-钙调蛋白相互作用。”J.Biol.Chem.. 278. 48898-48902 (2003)

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Mamoru Matsubara, Nobuhiro Hayashi, Tao Jing, Koiti Titani: "Regulation of Endothelial Nitric Oxide Synthase by Protein Kinase C"J.Biochem.. 133. 773-781 (2003)

Mamoru Matsubara、Nobuhiro Hayashi、Tao Jing、Koiti Titani：“蛋白激酶 C 对内皮一氧化氮合酶的调节”J.Biochem.. 133. 773-781 (2003)

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Sebastian Maurer-Stroh, Masaki Gouda, Maria Novatchkova, Alexander Schleiffer, Georg, Schneider, Fernanda L.Sirota, Michael Wildpaner, Nobuhiro Hayashi, Frank Eisenhaber: "MYRbase : Evoluation of genome-wide glycine myristoylation enlarges functional spec

Sebastian Maurer-Stroh、Masaki Gouda、Maria Novatchkova、Alexander Schleiffer、Georg、Schneider、Fernanda L.Sirota、Michael Wildpaner、Nobuhiro Hayashi、Frank Eisenhaber：“MYRbase：全基因组甘氨酸肉豆蔻酰化的进化扩大了功能规格