酵母カンジダ・アルビカンスにおける人体内内生存戦略分子機構の解明

阐明酵母白色念珠菌在人体内生存策略的分子机制

• 批准号: 15013208
• 负责人: 知花 博治
• 金额: $ 2.43万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15013208/
• 关键词: 病原性真菌; ゲノム創薬; 染色体; トランスクリプトーム

Candida酵母は常在性寄生菌で免疫力の低下した患者に対し重篤な感染症を起こす真菌である。Candidaの病原性は未解明であり,我々は先ずCandidaの常在性のための戦略に興味を持ちCandidaの組換え体の構築および組換え体を用いた感染実験やトランスクリプトームにより常在性に関わる遺伝子の探索を行い,常在性の分子機構の解明をめざしている。Candida属の種の中で病原性は強いが組換え実験の難しいC.albicansと病原性は弱いが組換えの容易なC.glabrataの両方の利点を生かしながら我々は研究を進めている。スタンフォード大学やミネソタ大学等との共同研究によりC.albicansの全ゲノム配列(15.5Mbp)を含む421本のコンティグを完成させた。ゲノム上には6,421の遺伝子の存在が推測され米国科学アカデミー学会誌(PNAS)に受理された。我々は引き続きゲノムシークエンスの完成をめざし,C.albicansの染色体7番(1Mbp)のコンティグ間のギャップをクローズし,シークエンスを完成させることに成功した。またより正確な遺伝子予測を行なうために,既に解析が終了しているパン酵母(Saccharomyces cerevisiaei)のゲノムシークエンスを用いて真菌ゲノムに対するGlimmer2とCriticaを用いた遺伝子予測の信憑性試験を行なった。このジョイントプログラムを用いてC.albicansの染色体7番の遺伝子予測を行なった。

念珠菌是一种真菌，可引起由于居民寄生虫而导致免疫力不佳的患者的严重感染。尚未透露念珠菌的致病性，我们首先对念珠菌的居民性质的策略感兴趣，我们正在建立念珠菌重组，通过使用重组物质的感染实验来调查居民性质涉及的基因，以及阐明常驻分子机制的转录。在念珠菌属的物种中，我们正在利用两种白色念珠菌，这两种高度致病但难以重组实验，而glabrata则是较少的致病性，但易于重组。与斯坦福大学，明尼苏达大学和其他人的合作研究完成了421个重叠群，其中包含白色念珠菌的整个基因组序列（15.5 MBP）。在基因组上估计了6,421个基因的存在，并被国家科学院杂志（PNAS）接受。我们继续旨在完成基因组序列，缩小白色念珠菌染色体7（1Mbp）的重叠群之间的差距，并成功完成了序列。为了做出更准确的基因预测，我们使用基因组对基因组进行了基因预测的可信度测试，并使用基因组使用基因组，使用贝克酵母基因组（Saccharomyces cerevisiaei）进行了基因组，该基因组已经进行了分析。该联合程序用于预测白色念珠菌染色体数字7的基因。

项目成果

Chibana, H., Oka, N., Nagasawa, N., Shikinami, K., Nishimura, K., Magee, B.B., Magee, P.T., Mikami, Y: "How the physical map helps in completion of Candida albicans genome sequencing"Frontier Studies and International Networking of Genetic Resources in Pa

Chibana, H.、Oka, N.、Nagasawa, N.、Shikinami, K.、Nishimura, K.、Magee, B.B.、Magee, P.T.、Mikami, Y：“物理图谱如何帮助完成白色念珠菌基因组测序

Jones, T., Federspiel N.A, Chibana H., Dungan J., Kalman, S., Magee, B.B., Newport G., Thorstenson, Y.R., Agabian, N., Magee, P.T., Davis, R.W., Scherer S: "The Diploid Genome Sequence of Candida albicans"Proc Natl Acad Sci USA. (in press).

Jones, T.、Federspiel N.A、Chibana H.、Dungan J.、Kalman, S.、Magee, B.B.、Newport G.、Thorstenson, Y.R.、Agabian, N.、Magee, P.T.、Davis, R.W.、Scherer S：“

Chibana., H., Jones, T., Federspies, N.A., Dungan, J., Kalman, S., Magee, B.B., Forche, A., Lephart, P., Newport, G., Thorstenson Y.R.et al.: "Exploiting the DNA sequence and the physical map of the Candida albicans genome to examine in vivo chromosome dy

Chibana., H.、Jones, T.、Federspies, N.A.、Dungan, J.、Kalman, S.、Magee, B.B.、Forche, A.、Lephart, P.、Newport, G.、Thorstenson Y.R. 等人：