Mechanism for regulation of DECODE complexes in gene activation

基因激活中DECODE复合物的调节机制

• 批准号: 17054033
• 负责人: OGATA Kazuhiro
• 金额: $ 67.58万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17054033/
• 关键词: 転写因子; タンパク質-核酸複合体; Ets1,Runx1,エンハンサー; 化学修飾; 連携研究者; 転写制御因子; エンハンソソーム; Runx1; Ets1; ヒストンシャペロン; クロマチンリモデリング; エンハンセオソーム; ヒストンシヤペロン; リン酸化; MeCP2

Multiple transcription factors (TFs) regulate transcription by forming TFs-DNA complexes. A cell signaling causes chemical modification of transcription factors, which modulates transcriptional activities. Besides, effect of chemical modification of transcription factors on their activity in the context of TFs-DNA complexes, however, is largely unknown. In this sturdy, we showed that the phosphorylation of a transcription factor Ets1 "differentially" modulates Ets1-containing TFs-DNA complexes. In addition, we clarified the underlying mechanism by which the selective modulation of Ets1-containing TFs-DNA complexes is achieved using NMR analyses of allosteric regulation of Runx1 by CBFβ and crystallographic analyses of multiprotein-DNA complex comprised of Ets1, Runx1 and CBFβ formed on the TCRα gene enhancer.

多个转录因子 (TF) 通过形成 TF-DNA 复合物来调节转录，细胞信号传导会引起转录因子的化学修饰，从而调节转录活性。此外，转录因子的化学修饰对其在 TF-DNA 复合物中的活性产生影响。然而，在这一点上，我们发现转录因子 Ets1 的磷酸化“差异”地调节含有 Ets1 的 TFs-DNA 复合物。使用 CBFβ 对 Runx1 变构调节的 NMR 分析和对 TCRα 基因增强子上形成的由 Ets1、Runx1 和 CBFβ 组成的多蛋白-DNA 复合物的晶体学分析，阐明了选择性调节包含 Ets1 的 TFs-DNA 复合物的基本机制。

项目成果

The 8th and 9th tandem spectrin-like repeats of utrophin cooperatively form a functional unit to interact with polarity-regulating kinase PAR-1b

• DOI: 10.1016/j.bbrc.2009.11.144
• 发表时间: 2010-01-01
• 期刊: BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
• 影响因子: 3.1
• 作者: Yamashita, Kazunari;Suzuki, Atsushi;Ohno, Shigeo
• 通讯作者: Ohno, Shigeo

分子構造の揺らぎに注目したRunx1/AML1の活性制御機構解析

以分子结构波动为重点分析Runx1/AML1活性调控机制

• 发表时间: 2008
• 作者: 椎名政昭;嶋村麻利子;豊後泰子;緒方一博
• 通讯作者: 緒方一博

Analysis of cooperative DNA binding activity between c-Ets1 and Runx1 on various enhancers.

分析 c-Ets1 和 Runx1 对各种增强子的协同 DNA 结合活性。

• 发表时间: 2010
• 作者: Uchiyama A;Shiina M;Hamada K;Bungo T;Shimamura M;Ogata K
• 通讯作者: Ogata K

Molecular mechanisms for allosteric regulation of Runx1 activity.

Runx1 活性变构调节的分子机制。

• 发表时间: 2008
• 作者: Shiina M;Shimamura M;Bungo T;Ogata K
• 通讯作者: Ogata K

NMR analyses of molecular fluctuations of Runx1 and its correlation with functional regulations.

Runx1分子波动的NMR分析及其与功能调控的相关性。

• 发表时间: 2006
• 作者: Shiina M;Takata S;Bungo T;Shimamura M;Ogata K
• 通讯作者: Ogata K