Systems genomics in Drosophila

果蝇系统基因组学

• 批准号: 17017032
• 负责人: AIGAKI Toshiro
• 金额: $ 113.92万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17017032/
• 关键词: ゲノム; 遺伝子; 表現型; データベース; ショウジョウバエ; 遺伝子強制発現; RNAi; 形態; ストレス感受性; 画像データ; 組織サイズ; ライブイメージング; 遺伝子強制; 強制発現システム; 翅; インスリンシグナリング; カスパーゼシグナリング; 強制発現ベクター; 強制発現変異体; Gene Searchシステム; GS系統; GSベクター; GAL4-UASシステム; 表現型情報

Drosophila melanogaster is a model organism that have been extensively studied for their genes' functions through both forward and reverse genetic approaches. However, it has been estimated that only one-third of all genes in the genome could be mutated to easily detectable phenotypes, such as lethality, sterility or morphological abnormality. In order to reveal novel gene functions that may not be revealed with conventional approaches, we develop methods involving computational image analyses of adult wings and time-lapse confocal microscopic images of embryogenesis. To screen and identify new genes and/or new functions of known genes, we established and utilized a library of Gene Search (GS) lines and inducible RNAi lines as a resource to screen gain-of-function and reduction-of-function mutations. We identified and characterized various genes that include those involved in morphogenesis, immune response, stress resistance and longevity.

果蝇Melanogaster是一种模型生物，通过前进和反向遗传方法，已经对其基因功能进行了广泛研究。但是，据估计，基因组中所有基因中只有三分之一可以突变以易于检测的表型，例如致死性，无菌或形态异常。为了揭示可能不会使用常规方法揭示的新基因功能，我们开发了涉及成人翅膀的计算图像分析和胚胎发生的延时共聚焦显微镜图像。为了筛选和识别已知基因的新基因和/或新功能，我们建立并利用了基因搜索库（GS）线和诱导的RNAi线路作为筛选功能获得和减少功能突变的资源。我们确定并表征了各种基因，其中包括涉及形态发生，免疫反应，抗压力和寿命的基因。

项目成果

Identification of functionally important amino acids in two odorant-binding proteins, OBP57d and OBP57e.

鉴定两种气味结合蛋白 OBP57d 和 OBP57e 中功能重要的氨基酸。

• 发表时间: 2009
• 作者: J;Nakagawa.T;Aigaki.T;Matsuo
• 通讯作者: Matsuo

Chemical genetics in Drosophila : development of a versatile culture system and an automated phenotype analysis for a high-throughput sample.

果蝇化学遗传学：开发多功能培养系统和高通量样品的自动表型分析。

• 发表时间: 2009
• 作者: Y;Sato.T;Kaneuchi.O;Masuda.K;Muramatsu.M;Tsuda.T;Aigaki
• 通讯作者: Aigaki

Practical guide of live imagining for developmental biologists, Development

发育生物学家的实时想象实用指南，发育

• 发表时间: 2008
• 期刊: Growth and Differentiation
• 作者: Kato;K.;Hayashi;S.
• 通讯作者: S.

Thioredoxin suppresses Parkin-associated Endothelin Receptor-like Recepto-induced neurrotoxicity and extends longevity in Drosophila.

硫氧还蛋白抑制帕金相关内皮素受体样受体诱导的神经毒性并延长果蝇的寿命。

• 发表时间: 2007
• 期刊: J. Biol. Chem. 282
• 作者: Umeda-Kameyama;Y.;Tsuda;M.;Ohkura;C.;Matsuo;T.;Namba;Y.;Ohuchi;Y.;Aigaki;T.
• 通讯作者: T.

老化・老年病研究のため動 物実験ガイドブック72-77ショウジョウバエモデル(日本基礎老化学)

用于衰老和老年疾病研究的动物实验指南72-77果蝇模型（日本基础衰老研究）

• 发表时间: 2008
• 作者: 津田学;大高領介;相垣敏郎;Aigaki T;相垣敏郎
• 通讯作者: 相垣敏郎