プロテオミクスによる脳神経系腫瘍の診断・治療法の基礎開発

利用蛋白质组学进行脑和神经系统肿瘤诊断和治疗方法的基础开发

基本信息

批准号：
16023252
负责人：
荒木令江
金额：
$ 3.46万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

脳神経系腫瘍の発生初期から進行度や予後予測、薬物治療効果などをモニタリングできる簡便な臨床マーカーを検索する目的で、ヒト脳神経系組織・細胞のプロテオームデータバンクの構築、及び最新の高感度proteomic differential display法による腫瘍関連組織・細胞の解析法の検討を行っている。本研究では、gliomaの形成進行に関連して変化する蛋白質群の検出・同定を、患者脳組織、神経系培養細胞を用いて、2D-DIGE法とnanoLC-MASショシトガン法(clCAT法およびiTRAQ法)を用いたProteomic Differential Displayによる定量的蛋白質情報、及び同時進行で得たmRNA発現情報を統合して、最も重要な細胞内異常シグナルの抽出を試みた。Proteomic Differential Display法では、ヒトGliomaにおいて腫瘍化に関わるものとして221個、薬剤耐性に関わる201個の特異的な蛋白質を検出・同定した。これらにはリン酸化修飾の差異の見られる28個の特異的分子を含め、既知の腫瘍関連分子のみならず腫瘍マーカーとして興味深い分子群が多数含まれていた。同時に、同じ組織・細胞サンプルからトランスクリプトーム解析試料抽出法を検討し解析結果を比較検討した。全解析データから特異的な活性化シグナルネットワークの抽出を行ったところ、血管新成・血管透過性・細胞周期・接着因子関連分子群の関与するキャスケードの上昇、及び特異的核内レセプター群、転写因子群とそれらの下流分子群の活性化が認められた。本研究における検討によって、高感度な脳腫瘍のProteomic Differential Display法、及びその異常活性化シグナルの抽出方法が確立され、その有用性が証明された。

为了寻找易于使用的临床标志物，能够从脑和神经系统肿瘤发展的早期阶段监测其进展、预后和药物治疗效果，我们正在构建人脑和神经系统肿瘤的蛋白质组数据库我们正在研究利用显示方法分析肿瘤相关组织和细胞的方法。在本研究中，我们将使用 2D-DIGE 方法、nanoLC-MAS Shoshitogan 方法（clCAT 方法和 iTRAQ 方法）使用患者脑组织和培养的神经系统细胞检测和鉴定一组与神经胶质瘤形成进展相关的蛋白质。我们尝试通过整合蛋白质组差异显示（使用2017）获得的定量蛋白质信息和同时获得的mRNA表达信息来提取最重要的细胞内异常信号。利用蛋白质组差异显示方法，我们检测并鉴定了221个与肿瘤发生有关的特定蛋白质和201个与人类胶质瘤耐药性有关的特定蛋白质。其中包括 28 个显示出磷酸化差异的特定分子，不仅包括已知的肿瘤相关分子，还包括一大群作为肿瘤标志物感兴趣的分子。同时，我们研究了从相同组织/细胞样本中进行转录组分析的样本提取方法，并比较了分析结果。当我们从所有分析数据中提取特定的激活信号网络时，我们发现涉及血管生成、血管通透性、细胞周期和粘附因子相关分子的级联，以及特定核受体组和因子的激活。并观察到它们的下游分子。通过本研究的研究，建立了一种高灵敏度的脑肿瘤蛋白质组差异显示方法和提取异常激活信号的方法，并证明了它们的实用性。

项目成果

期刊论文数量（16）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

脳腫瘍の病態プロテオミクズで見えてくる新たなシグナル伝達経路"プロテオミクスでみえてくる生命機能の新たなメカニズム"

脑肿瘤病理学蛋白质组学揭示的新信号转导途径“蛋白质组学揭示生命功能的新机制”

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
実験医学 23・7
影响因子：
0
作者：
Araki;N.;荒木令江;荒木令江
通讯作者：
荒木令江

疾患プロテオミクスの最前線

疾病蛋白质组学的前沿

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
影响因子：
0
作者：
Corvalan A;Ding S;Koriyama C;Carrascal E;Carrasquilla G;Backhouse C;Urzua L;Argandona J;Palma M;Eizuru Y;Akiba S.;荒木令江;Castillo A. et al.;荒木令江;Corvalan A. et al.;荒木令江;Castillo A. et al.;Cabrera ME. et al.;荒木令江;Tabata H. et al.;荒木令江;Campos F. et al.;荒木令江;Campos F. et al.;荒木令江;Marugame T. et al.;Yoshiwara E. et al.;荒木令江;荒木令江編集
通讯作者：
荒木令江編集

「in vitroラベル法」オンラインLC-MS法による発現プロファイル解析

使用“体外标记法”在线LC-MS方法进行表达谱分析

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
決定版!プロテオーム解析マニュアル
影响因子：
0
作者：
Araki;N.;荒木令江
通讯作者：
荒木令江

プロテオミクスによる疾患研究と臨床診断に向かう戦略

使用蛋白质组学进行疾病研究和临床诊断的策略

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
疾患プロテオミクスの最前線 2
影响因子：
0
作者：
Araki;N.;荒木令江;荒木令江;荒木令江
通讯作者：
荒木令江

Role of TAFII-17, a VDR binding protein, in the increased osteoclast formation in Paget's disease

DOI：
10.1359/jbmr.040312
发表时间：
2004-07-01
期刊：
JOURNAL OF BONE AND MINERAL RESEARCH
影响因子：
6.2
作者：
Kurihara, N;Reddy, SV;Roodman, GD
通讯作者：
Roodman, GD

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DOI：
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0
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DOI：
发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
0
作者：
Corvalan A;Ding S;Koriyama C;Carrascal E;Carrasquilla G;Backhouse C;Urzua L;Argandona J;Palma M;Eizuru Y;Akiba S.;荒木令江;Castillo A. et al.;荒木令江;Corvalan A. et al.;荒木令江;Castillo A. et al.;Cabrera ME. et al.;荒木令江;Tabata H. et al.;荒木令江;Campos F. et al.;荒木令江;Campos F. et al.;荒木令江;Marugame T. et al.;Yoshiwara E. et al.;荒木令江
通讯作者：
荒木令江