酵母ゲノムにおいてクロマチン構造を介した転写調節機構の解明

阐明酵母基因组染色质结构介导的转录调控机制

• 批准号: 08274217
• 负责人: 清水 光弘
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Tokyo University of Pharmacy and Life Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08274217/
• 关键词: クロマチン; ヌクレオソーム; 転写制御; リプレッサー; DNAの高次構造; Z-DNA; 出芽酵母; ゲノム

1.Rme1pによる新しい転写抑制機構-Activator Exclusion at a DistanceRme1pは,S.cerevisiae一倍体において減数分裂の開始を阻害する,という重要な機能を担っている.我々は,Rme1pによる転写抑制機構として,遠隔的にactivatorsの結合を阻害することを明らかにした.そして,この機構を「activator exclusion」と名付け,Rme1pが染色体上で転写不活性なクロマチンドメインを構築する,というモデルを提唱した.activator exclusionには,グローバルな転写因子Rgr1pとSin4pが必要であり,この抑制機構にクロマチン構造が関与していることが示唆された.そこで,Rme1pによる転写抑制とクロマチン構造との関係について調べた結果,(1)IME1遺伝子上流においてポジショニングしたヌクレオソームを介してRme1pの2つの結合部位が空間的に近くに配置されること,(2)CYC1-lacZミニ染色体上で,activatorsの結合部位近傍のヌクレオソームの構築にRme1pが関与していること,が示唆された.現在,クロマチン構造と転写抑制との関係について解析を進めている.2.クロマチンの構築におけるDNAの高次構造の役割in vivoでの特殊はDNA配列によるヌクレオソームの排除機構を明らかにするために、種々の(A)_nならびにZ-DNA配列の影響について検討した.(A)_n配列が15bp以上に長くなると、その領域近傍からヌクレオソームは排除された.一方、Z-DNAを容易に形成する(CG)_n配列はヌクレオソーム形成を阻害したが,(CA)_n配列は大きな影響を及ぼさなかった.以上の結果は、塩基配列に固有なDNA構造が,in vivoでのヌクレオソーム形成の重要な因子の一つであることを示している。

1. Rme1p 的新转录抑制机制 - 远处的激活剂排除 Rme1p 在抑制单倍体酿酒酵母减数分裂的启动中发挥着重要作用。我们已经证明，这种机制可以通过结合激活剂来远程抑制。我们提出了一个模型，其中 Rme1p 在染色体上构建转录失活的染色质结构域。需要全局转录因子Rgr1p和Sin4p来进行抑制，有人认为染色质结构参与了这种抑制机制。研究Rme1p转录抑制与染色质结构之间关系的结果表明，（1）Rme1p的2个通过核小体定位IME1 基因的上游。这些结果表明，两个结合位点在空间上彼此靠近，并且（2）Rme1p 参与了 CYC1-lacZ 微型染色体上激活剂结合位点附近的核小体组装。我们目前正在分析染色质结构与染色质结构之间的关系。 2. DNA高级结构在染色质构建中的作用。为了阐明体内特定DNA序列排斥核小体的机制，我们研究了各种(A)_n和Z-DNA序列的影响。当(A)_n序列长于15 bp时，附近的区域另一方面，容易形成Z-DNA的(CG)_n序列抑制核小体形成，但(CA)_n序列没有显着影响。独特的DNA结构。已表明这是体内核小体形成的重要因素之一。

项目成果

Mitsuhiro Shimizu,W.Li,H.Shindo & A.P.Mitchell: "Transcriptional repression at a distance through exclusion of activator binding in vivo." Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.94. 790-795 (1997)

清水光宏,W.Li,H.Shindo