Tissue-specific regulation of translation initiation mediated by ribosome heterogeneity

核糖体异质性介导的翻译起始的组织特异性调控

• 批准号: 22H02549
• 负责人: 藤原 俊伸
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: Kindai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02549/
• 关键词: 翻訳制御; リボソーム; RNA結合蛋白質; RNA結合タンパク質

本年度では、1.ポリオウイルスIRESの翻訳開始機構をモデルとしたリボソーム結合因子による神経細胞特異的翻訳開始制御の分子機構、2.HAVIRESの翻訳開始機構をモデルとしたリボソーム結合因子による肝細胞特異的翻訳開始制御の分子機構の２種類のIRES依存的な翻訳開始の分子機構を生化学的解析した。その結果、これまでに発見しているポリオウイルスの翻訳を制御するリボソーム結合因子の変異体を得ることに成功し、これら変異体がポリオウイルスの翻訳を制御不能となっていることを署名した。さらに、肝細胞由来のリボソーム結合因子がHAV IRES依存的な翻訳を活性化することを発見した。HAVのIRES依存的翻訳機構に関わるリボソーム結合因子同定と性状解析を足がかりに、組織特異的タンパク質合成制御機構とウイルスのトロピズムとの相関を明らかにすることを試みている。分担者の三嶋は、神経細胞および肝細胞由来の培養細胞系でリボソームプロファイリングを実施するための条件検討を行なった。またヒト培養細胞のデータをもとに翻訳効率とRNA制御配列を紐づけるための解析パイプラインを構築した。さらに分担者の伊藤は、哺乳類由来再構成型翻訳システムのすべての因子をヒト由来とするために、それまで異種であるマウス由来かつN末端を削っていたeIF4Gについて、ヒト由来eIF4G1の全長の大量発現系を構築し、精製した。これまでのeIF4Gとほぼ同じ効率で試験管内翻訳システムが機能することを確認した。また代表者は、神経結合タンパク質と翻訳開始因子eIF3との相互作用を明らかにし、神経細胞独自の翻訳システムについて新たな知見を得、論文誌上で発表した。

在今年，我们生化分析了翻译起始的两种类型的IRES依赖性分子机制：1。通过核糖体结合因子对翻译起始的神经元特异性调节的分子机制，它是基于Poliovirus IRES和2的翻译机制的转换机制的模型。核糖体结合因子，该因子是基于Havires的翻译起始机理建模的。结果，我们成功地获得了控制迄今为止发现的脊髓病毒翻译的核糖体结合因子的突变体，并签署了这些突变体无法控制脊髓灰质炎病毒的翻译。此外，我们发现肝细胞衍生的核糖体结合因子激活了HAV IRES依赖性翻译。使用HAV的IRES依赖性翻译机制涉及的核糖体结合因子，我们试图阐明组织特异性蛋白质合成调节机制与病毒性向Tropism之间的相关性。共享者Mishima检查了对来自神经元和肝细胞的培养细胞系进行核糖体分析的条件。此外，根据来自培养的人类细胞的数据，构建了分析管道，以将翻译效率与RNA控制序列联系起来。此外，为了使哺乳动物衍生的重建类型翻译系统的所有因素衍生自人类，共享者构建了EIF4G人类衍生的EIF4G1的全长表达系统，以前曾从异元小鼠中删除N-ensinus，并已被削弱，并已被削弱。已经证实，体外翻译系统的作用几乎与以前的EIF4G相同。该代表还揭示了神经结合蛋白与翻译起始因子EIF3之间的相互作用，获得了有关神经元翻译系统的新知识，并将其发布在期刊上。

项目成果

Revisit of miRISC-mediated translation regulation

重新审视 miRISC 介导的翻译调控

• 发表时间: 2022
• 作者: Mai Miyao;Ayumi Mori;Yurika Sakamura;Takumi Tomohiro;Akira Fukao;Yoshinori Funakami;Shungo Adachi;Tohru Natsume;Koji Onomoto;Mitsutoshi Yoneyama;Toru Suzuki;Tadashi Yamamoto and Toshinobu Fujiwara
• 通讯作者: Tadashi Yamamoto and Toshinobu Fujiwara

神経特異的RNA結合タンパク質HuDは翻訳開始因子eIF3と相互作用する

神经特异性 RNA 结合蛋白 HuD 与翻译起始因子 eIF3 相互作用

• 发表时间: 2022
• 作者: 西阪 皓理;友廣 拓生;深尾 亜喜良;船上 仁範;藤原 俊伸
• 通讯作者: 藤原 俊伸

The analysis of hepatitis C virus IRES dependent translation by MAPK signaling pathway

MAPK信号通路对丙型肝炎病毒IRES依赖翻译的分析

• 发表时间: 2022
• 作者: Sakiko Tsujita;Takumi Tomohiro;Akira Fukao;Yoshinori Funakami;Ryosuke Satoh;Reiko Sugiura;Toshinobu Fujiwara
• 通讯作者: Toshinobu Fujiwara

Neuronal RNA-Binding Protein HuD Interacts with Translation Initiation Factor eIF3

• DOI: 10.1248/bpb.b22-00478
• 发表时间: 2023-02-01
• 期刊: BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN
• 影响因子: 2
• 作者: Nishisaka，Hikari;Tomohiro，Takumi;Fujiwara，Toshinobu
• 通讯作者: Fujiwara，Toshinobu

Positive and negative regulation of poliovirus IRES translation by tissue-specific factors

组织特异性因素对脊髓灰质炎病毒 IRES 翻译的正向和负向调节

• 发表时间: 2022
• 作者: Hikaru Sakamoto;Akitoshi Sadahiro;Akira Fukao;Yoshinori Funakami;Naoki Takizawa;Osamu Takeuchi;Toshinobu Fujiwara
• 通讯作者: Toshinobu Fujiwara