Study on the photoreaction dynamics of blue light sensor protein YtvA from Bacillus subtilis

枯草芽孢杆菌蓝光传感蛋白YtvA光反应动力学研究

基本信息

  • 批准号:
    23870015
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.08万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
  • 财政年份:
    2011
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2011 至 2012
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

We investigated the photoreaction dynamics of the blue light sensor protein YtvA to elucidate how the light signal is transferred from the LOV domain to the STAS domain using time-resolved transient grating (TG) method. The concentration dependence of the TG signals and cross-linking measurement showed that YtvA is in equilibrium between the hexamer and the dimer in the ground state. The hexamer underwent the global reaction which was manifested as a decrease in D. The D change of the hexamer might be caused by the change in inter-protein interaction between the dimers. Additionally, we have found significant effect of the salt concentration on the equilibrium in the ground state, which might be relevant for its salt stress response.
我们研究了蓝光传感器蛋白 YtvA 的光反应动力学,以阐明光信号如何使用时间分辨瞬态光栅 (TG) 方法从 LOV 结构域转移到 STAS 结构域。 TG 信号的浓度依赖性和交联测量表明 YtvA 在基态下处于六聚体和二聚体之间的平衡。六聚体发生了全局反应,表现为D的减少。六聚体的D变化可能是由于二聚体之间蛋白质间相互作用的变化引起的。此外,我们发现盐浓度对基态平衡有显着影响,这可能与其盐胁迫响应有关。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
光センサー蛋白質フォトトロピンの活性状態における構造揺らぎの評 価
光传感器蛋白促光素活性状态结构波动的评估
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Shimizu;T.;Ueda;J.;Ho;J.C.;Iwasaki;K.;Poellinger;L.;Harada;I.;and Sawada;Y.;DAN OHTAN WANG;中曽根祐介
  • 通讯作者:
    中曽根祐介
全長の青色光センサータンパク質YtvAの光化学反応ダイナミクス
全长蓝光传感器蛋白YtvA的光化学反应动力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takeshi Shimizu;et al;Dan Ohtan Wang;Seokwoo Choi
  • 通讯作者:
    Seokwoo Choi
過渡回折格子法による蛋白質反応の時間分解検出
使用瞬态光栅方法对蛋白质反应进行时间分辨检测
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kurihara D.;Hamamura Y.;Higashiyama T;塚越啓央;中曽根祐介
  • 通讯作者:
    中曽根祐介
Structural fluctuation of signalins state of phototropinl-LOV2 domain
趋光素l-LOV2结构域信号状态的结构波动
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yamagata;K. and Ueda;J.;中曽根祐介
  • 通讯作者:
    中曽根祐介
光センサー蛋白質フォトトロピンの反応中間体が持つ構造揺らぎの熱力学的評価
光敏蛋白向光素反应中间体结构波动的热力学评价
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    K. Tanaka;Y. Nakasone;K. Okajima;M. Ikeuchi;S. Tokutomi;M. Terazima;塚越啓央;中曽根祐介
  • 通讯作者:
    中曽根祐介
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

NAKASONE Yusuke其他文献

NAKASONE Yusuke的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('NAKASONE Yusuke', 18)}}的其他基金

Molecular mechanism of kinase activation of light sensor protein phototropin
光传感器蛋白向光素激酶激活的分子机制
  • 批准号:
    25840047
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 2.08万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

相似国自然基金

基因LOV1参与浒苔响应高温胁迫的分子机制
  • 批准号:
    42106099
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    20 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
核磁共振研究蓝光诱导的LOV2-Rit(PB)与膜相互作用的机制
  • 批准号:
    31800645
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    25.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
两类PDE控制离散矩阵的预处理及快速计算
  • 批准号:
    11771193
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    49.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
新奥尔松地区冰川融水入海途径中细菌群落对环境的适应性研究
  • 批准号:
    41776198
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    70.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
分数阶系统的李雅普洛夫型不等式及其稳定性研究
  • 批准号:
    11661065
  • 批准年份:
    2016
  • 资助金额:
    31.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目

相似海外基金

CAREER: Shedding light on the Photochemistry of the LOV Class of Flavin Photoreceptors
职业:揭示 LOV 类黄素光感受器的光化学
  • 批准号:
    2047667
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 2.08万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Molecular mechanisms for conversion and transduction of light signal in a light-activatable transcription factor
光激活转录因子中光信号转换和转导的分子机制
  • 批准号:
    19K06586
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.08万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Understanding the diversity of bacterial photosensors and developing light-based cell regulation technology
了解细菌光电传感器的多样性并开发基于光的细胞调节技术
  • 批准号:
    19K05781
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.08万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Develop light-oxygen-voltage (LOV) sensing optogenetics tools through novel computational approaches with experimental validation
通过经过实验验证的新颖计算方法开发光氧电压 (LOV) 传感光遗传学工具
  • 批准号:
    10661223
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 2.08万
  • 项目类别:
Devising a novel light-regulated channel based on minimum unit of voltage sensor domain
设计一种基于电压传感器域最小单元的新型光调节通道
  • 批准号:
    16K14555
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 2.08万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了