次世代シーケンサーを用いた法科学的視点に基づく植物の個体識別法の開発

使用下一代测序仪开发基于法医学视角的植物单株识别方法

基本信息

批准号：
22K21101
负责人：
中村隆太
金额：
$ 1.58万
依托单位：
National Research Institute of Police Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-08-31 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K21101/
关键词：
植物系統分類ヒヨドリバナ属次世代シーケンサー MIG-seq 個体識別

项目摘要

今年度の研究に関しては、まず研究に用いるヒヨドリバナ属のサンプル採集について、採集地点及び必要な許可申請について調査を行った。対象としているヒヨドリバナ属植物は、主に秋頃に開花する植物であるため、採集自体はほとんど実施できなかったが、一部の種に関しては採集を実施した。採集できた個体については、形態観察を行い、種の同定を行った。琉球地方には冬に開花する種が存在するため、これの採集を図ったが、所内の手続きの関係で、2023年4月に実施することになった。なお、計画時に考えていた国立科学博物館の筑波実験植物園で栽培されている、主に琉球列島に生育しているヒヨドリバナ属は、博物館の担当者に確認したところ利用不可であったため、琉球列島の個体についても自力で採集する必要があることが判明した。一方、東京大学大学院理学系研究科附属植物園（小石川植物園）のヒヨドリバナ属については、申請を行えば利用できることが確認できたため、2023年度にこれを行う。また、植物分類学会に参加し、現在の植物分類における形態観察、DNAを用いた系統解析の現状について情報収集を行った。形態観察については、あまり詳しい発表が無かったものの、本研究計画時に想定していたような、図鑑に記載されている内容を基にした観察が基本であった。DNAを用いた系統解析についても、本研究で計画しているMIG-seqを用いた研究が多数発表されていたことから、この手法の有用性が確認できた。

关于今年的研究，我们首先研究了收集点和所需的许可申请，以收集用于研究的Bully Ribana属。目标隆起的植物主要在秋天开花，因此几乎没有进行，但收集了一些物种。对于收集的个体，观察到形式并确定该物种。由于在冬季盛开的ryukyu地球上有种子，我们已经收集了这一点，但是由于内部的程序，它将在2023年4月实施。此外，在计划期间计划的国家科学博物馆的Tsukuba实验植物园中种植的Ryukyu群岛属是无法使用的有必要自己收集个人。另一方面，植物园（Koishikawa植物园），东京大学科学研究生院（Koishikawa植物园）的属被证实可以通过申请使用，因此可以在2023年进行。此外，我们参加了工厂分类协会，并收集了有关当前植物分类中使用DNA的正式分析状态的信息。尽管关于形式观察的详细公告并没有太多详细的公告，但这种观点是基于图画书中所述的内容，如本研究计划中所预期的那样。关于使用DNA的系统分析，本研究中计划的许多研究使用了一些研究，因此确认了该方法的有用性。