ヒヨドリバナに感染するジェミニウイルスの分子生態学

感染鹎的双生病毒的分子生态学

基本信息

批准号：
09874162
负责人：
矢原徹一
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒヨドリバナ属には有性生殖型と無性生殖型がある。ヒヨドリバナはジェミニウイルスの感染を受け、無性生殖型の方がより高い率で感染される。ジェミニウイルスは遺伝子レベルでよく研究されている植物ウイルスである。その知識を活用し、ホストと病原体の相互作用系で予測される淘汰の検出をめざすのが本研究の目的である。これまでの研究から、ホストレンジを決定するC4遺伝子を含むDNA領域をPCRで増幅し、PCR-SSCP法で多重感染を検出し、その上でSSCPタイプの配列を決定する技術的準備が整っている。また、ヨツバヒヨドリ有性集団とヒヨドリバナ無性集団が隣接する伊豆半島天城山北斜面で調査データを蓄積している。この調査地で各SSCPタイプから複数のPCR産物の配列を決定し、日本各地から得られたウイルスとの系統関係を調査した。ウイルスの系統は地理的にまとまる傾向を示さず、地域集団間の移住が頻繁に起きていると考えられる。ただし、各SSCPタイプ内の配列変異は単系統となり、いくつかのSSCPタイプも姉妹関係にあることがわかった。これらの分化は集団内で起きたものと考えられる。そこで、有性生殖ホスト集団内で起きたと考えられるアミノ酸置換数と地理的に異なる集団間で起きたと考えられるアミノ酸置換数を比較した結果、前者ではC4のアミノ酸置換数がC4以外の領域のそれより多く、後者では逆の関係が得られた。この結果は統計的に有意であり、有性ホスト集団内ではアミノ酸置換が加速されることが示唆された。

Bulbana属可以是性生殖的，并且无性繁殖。双子病毒百合的百合感染了双子座病毒，无性繁殖类型以较高的速度感染。双子病毒是在遗传水平上进行良好研究的植物病毒。这项研究的目的是利用这些知识来检测宿主 - 病原体相互作用系统中的预测选择。先前的研究已可以通过PCR扩增含有C4基因的DNA区域，该基因确定宿主范围，使用PCR-SSCP检测多种感染，然后确定SSCP类型序列。此外，调查数据累积在Amagiyama，Izu半岛的北坡上，在那里，Lionfish性的性鱼类和lion鱼的性群相邻。从该调查地点的每种SSCP类型确定了多个PCR产物的序列，并研究了与从日本各地获得的病毒的系统发育关系。病毒菌株没有显示出凝聚力组织的地理趋势，并且人们认为局部人群之间的迁移经常发生。然而，每种SSCP类型内的序列突变都是单属的，并且发现几种SSCP类型与姐妹有关。人们认为这些差异发生在人群中。因此，我们比较了被认为发生在性生殖宿主种群中的氨基酸取代的数量与据认为在不同地理种群之间发生的氨基酸取代的数量。在前者中，C4的氨基酸取代的数量大于除C4以外的区域的氨基酸取代，而后者获得了反相关关系。该结果具有统计学意义，表明在性宿主种群中加速了氨基酸取代。