有性・無性植物に感染するジェミニウイルスの分子進化

感染有性和无性植物的双生病毒的分子进化

基本信息

批准号：
08257214
负责人：
矢原徹一
金额：
$ 0.64万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1996
资助国家：
日本
起止时间：
1996 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒヨドリバナには有性生殖型と無性生殖型があり、無性生殖型は高い頻度でジェミニウイルスの感染を受ける。有性生殖がウイルスの感染防御に役立っているという仮説を検証するために、ホストレンジを決定するC4遺伝子を含むDNA領域の変異を、有性生殖集団と無性生殖集団の間で比較した。調査は伊豆半島天城山北斜面に自生する2集団で行った。これら2集団においてホスト1個体にいくつの遺伝的に異なるウイルスが感染しているかを非対称PCR-SSCP法を改良して調査した。その結果、無性ホスト集団では3つのSSCPタイプが見られ、これらの単一感染、二重感染、三重感染の頻度は、ポアソン分布を仮定した期待値とよく一致した。一方、有性ホスト集団では6つのSSCPタイプが見られ、単一感染の頻度が有意に低く、二重感染の頻度が有意に高かった。この結果は、ウイルス感染への抵抗力に関して、有性集団では個体間変異があることを示唆する。次に各SSCPタイプから複数のPCR産物の配列を決定し、日本各地から得られたウイルスとの系統関係を調査した。ウイルスの系統は地理的にまとまる傾向を示さず、地域集団間の移住が頻繁に起きていると考えられる。ただし、各SSCPタイプ内の配列変異は単系統となり、いくつかのSSCPタイプも姉妹関係にあることがわかった。これらの分化は集団内で起きたものと考えられる。そこで、有性生殖ホスト集団内で起きたと考えられるアミノ酸置換数と地理的に異なる集団間で起きたと考えられるアミノ酸置換数を比較した結果、前者ではC4のアミノ酸置換数がC4以外の領域のそれより多く、後者では逆の関係が得られた。この結果は統計的に有意であり、有性ホスト集団内ではアミノ酸置換が加速されることが示唆された。

Badribana具有性生殖类型和无性繁殖类型，无性繁殖类型高度感染了双子座病毒。为了验证有性繁殖对病毒感染保护有用的假设，在性生殖组和亚西亚生殖群之间比较了DNA区域的突变，包括确定宿主范围的C4基因。该调查是在两组在Izu半岛Amagi Mountain North Slope上进行的。在这两组中，研究了不对称的PCR-SSCP方法，其中有多少个遗传学病毒被一个宿主感染。结果，在Averon宿主组中看到了三种SSCP类型，并且这些单一感染，双感染和三重感染的频率与假设Porson分布的期望值非常一致。另一方面，在性宿主组中发现了六种SSCP类型，单个感染的频率显着低，并且双感染的频率显着高。该结果表明，性群体在抗病感染方面存在突变。接下来，根据每种SSCP类型确定多个PCR产物的序列，并研究了与从日本各地获得的病毒的关系。病毒系统没有显示地理单位，并且认为区域组之间的迁移经常。但是，发现每种SSCP类型中的序列突变成为一个单个系统，并且一些SSCP类型也与姐妹相关。这些分化被认为是在一个组中发生的。因此，由于比较了氨基酸的替代品（被认为发生在一组包含的生殖宿主中，氨基酸替代物被认为发生在地理不同组之间，因此前者是C4氨基酸取代的区域除了C4以外，后者具有相反的关系。该结果具有统计学意义，表明在性宿主组中氨基酸取代是加速的。