Molecular Design of Drugs recognizing Trinucleotide Repeat Sequence.

识别三核苷酸重复序列的药物分子设计。

基本信息

批准号：
15201042
负责人：
NAKATANI Kazuhiko
金额：
$ 32.12万
依托单位：
Osaka University (2005)Kyoto University (2003-2004)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2005
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15201042/
关键词：
Trinucleotide Repeat Genetic Disease ミスマッチ CAGリピート

项目摘要

DNA trinucleotide repeats, particularly CXG, are common within the human genome. However, expansion of trinucleotide repeats is associated with a number of disorders, including Huntington's disease, spinobulbar muscular atrophy, and spinocerebellar ataxia1-4. In these cases, the repeat length is known to correlate with decreased age of onset and disease severity5,6. Repeat expansion of (CAG)n, (CTG)n, and (CGG)n trinucleotides may be related to the increased stability of alternative DNA hairpin structures consisting of CXG/CXG triads with X-X mismatches7-11. Small molecule ligands that selectively bound to CAG repeats could provide an important probe for determining repeat length and an important tool for investigating the in vivo repeat extension mechanism. Here we report that naphthyridine-azaquinolone (NA,1) is a ligand for CAG repeats and can be used as a diagnostic tool for determining repeat length. We show by NMR spectroscopy that binding of NA to CAG repeats induces extrusion of a cytidine nucleotide from the DNA helix.

DNA 三核苷酸重复序列，特别是 CXG，在人类基因组中很常见。然而，三核苷酸重复序列的扩增与许多疾病相关，包括亨廷顿舞蹈病、脊髓延髓肌萎缩症和脊髓小脑性共济失调1-4。在这些情况下，已知重复长度与发病年龄降低和疾病严重程度相关5,6。 (CAG)n、(CTG)n 和 (CGG)n 三核苷酸的重复扩增可能与由具有 X-X 错配的 CXG/CXG 三联体组成的替代 DNA 发夹结构的稳定性增加有关7-11。选择性结合CAG重复序列的小分子配体可以为确定重复序列长度提供重要探针，并为研究体内重复序列延伸机制提供重要工具。在这里，我们报道萘啶-氮杂喹诺酮 (NA,1) 是 CAG 重复的配体，可用作确定重复长度的诊断工具。我们通过 NMR 光谱表明，NA 与 CAG 重复序列的结合会诱导胞苷核苷酸从 DNA 螺旋中挤出。

项目成果

期刊论文数量（24）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

中谷和彦ほか: "Highly Sensitive Detection of GG Mismatched DNA by Surfaces Immobilized Naphthyridine Dimer through Poly(ethylene oxide) Linkers"Bioorg.Med.Chem.Lett.. 14. 1105-1108 (2004)

Kazuhiko Nakatani 等人：“通过聚（环氧乙烷）连接器通过表面固定的萘啶二聚体高度灵敏地检测 GG 错配 DNA”Bioorg.Med.Chem.Lett.. 14. 1105-1108 (2004)

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

中谷和彦ほか: "Detection of Guanine-Adenine Mismatches by Surface Plasmon Resonance Sensor carrving Naphthyridine-Asaguinolone Hybrid on the Surface"Nucleic Acids Res.. 32. 278-286 (2004)

Kazuhiko Nakatani 等人：“通过表面等离子共振传感器检测鸟嘌呤-腺嘌呤错配，表面等离激元共振传感器在表面上刻有萘啶-Asaguinolone 杂化物”核酸研究. 32. 278-286 (2004)

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

2-Ureidoquinoline : a useful molecular element for stabilizing single cytosine ant thymine bulges

2-脲基喹啉：一种用于稳定单胞嘧啶蚂蚁胸腺嘧啶凸起的有用分子元素

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 14
影响因子：
0
作者：
Taisei Kaizoji;Michiyo Kaizoji;D.Oyamatsu;児玉晴男;MGC Project Team;小野晋太郎;Imamura F;中谷和彦ほか
通讯作者：
中谷和彦ほか

The binding of Guanine-Guanine Mismatched DNA to Naphthyridine Dimer Immobilized Sensor Surfaces : Kinetic Aspects

鸟嘌呤-鸟嘌呤错配 DNA 与萘啶二聚体固定传感器表面的结合：动力学方面