歯根膜全遺伝子パスウェイ解析による未来型オーダーメード歯周組織再生治療の新展開

基于牙周膜全基因通路分析的未来定制牙周组织再生治疗新进展

基本信息

批准号：
18659622
负责人：
村上伸也
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

1)DNAチップによる歯根膜細胞分化過程のトランスクリプトーム解析歯周組織再生過程をin vitroで再現するために、当教室で樹立した歯根膜細胞を長期培養した際の遺伝子発現をDNAチップを用いて解析を試みた。すなわち、歯根膜細胞からRNAを培養0日目、3日目、6日目、9日目、12日目、15日目、18日目に抽出し、それぞれのサンプルRNAから逆転写反応により、Cyamine dye(cy3およびcy5)にて標識されたプローブを調整し、DNAチップにハイブリダイゼーションした。そして、培養0日目のサンプルをリファレンスコントロールとして、それぞれの培養日サンプルとの間で遺伝子発現を比較した。2)クラスター分析・GeneOntology解析による歯根膜全遺伝子パスウェイの解明上記1)で得られた遺伝子発現データを統計学的処理することにより、遺伝子の発現パターンを指標とした遺伝子発現クラスター分析、および各遺伝子の生物学的機能を示すGeneOntology解析を行うことにより、歯周組織再生過程における全遺伝子トランスクリプトーム解析を行った。さらに、クラスター分析とGeneOntology解析の結果を統合することにより、統計学に基づいた歯周組織再生過程における代謝および細胞内シグナル分子の経路図(代謝・シグナルパスウェイ)を作成した。その結果、ヒト歯根膜細胞の全遺伝子プロファイリング解析の結果、ヒト歯根膜細胞の硬組織形成分化過程においてはヒト全遺伝子中3175個の遺伝子が有意な発現変化を示すことが明らかとなった。

1）使用DNA芯片对牙周韧带细胞分化的过程进行转录组分析，以便在体外重现牙周组织再生的过程，我们试图分析我们课堂上建立的牙周韧带细胞的基因表达，以使用DNA芯片进行长期培养。也就是说，在培养的第0、3、6、9、12、15和18天，从牙周韧带细胞中提取RNA，并通过从每个样品RNA的逆转录反应制备了标记为Cyamine Dye（CY3和CY5）的探针，并杂交至DNA芯片。然后，在培养的第0天使用样品作为参考对照，在各自培养日的样品之间比较了基因表达。 2）通过聚类分析和基因生态学分析来阐明所有牙周韧带基因途径，通过统计处理上述1）中获得的基因表达数据，使用基因表达聚类分析使用基因表达模式作为指标进行，以及基因观念学分析，并显示了每个基因转录组和所有基因转录分析的生物学功能，并在所有基因转录过程中进行了经过重新定期分析。此外，通过整合聚类分析和基因生态学分析的结果，我们基于统计量创建了牙周组织再生过程中代谢和细胞内信号分子的途径（代谢信号途径）。结果，对人牙周韧带细胞的所有基因分析的分析表明，在硬组织形成和人类牙周韧带细胞的分化过程中，所有人类基因的3175个基因在表达上均显示出显着变化。

项目成果

期刊论文数量（1）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

ヒト歯根膜細胞の硬組織形成分化過程における全遺伝子発現プロファイリング解析

人牙周膜细胞硬组织形成分化过程全基因表达谱分析

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Naoyuki Takahashi;et. al.;Pan Y;Ohnishi H;張剛太;張剛太;Yasuko Ishikawa;Yasuko Ishikawa;王 ?;石川康子;王〓;Wang D;石川康子;張剛太;康金森;張剛太;康金森;張剛太;Zhenfang Yuan;Gouta Cho;Yuan Pan;石川康子;石川康子;石川康子;米田晋也
通讯作者：
米田晋也