歯根膜全遺伝子パスウェイ解析による未来型オーダーメード歯周組織再生治療の新展開

基于牙周膜全基因通路分析的未来定制牙周组织再生治疗新进展

基本信息

批准号：
18659622
负责人：
村上伸也
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

1)DNAチップによる歯根膜細胞分化過程のトランスクリプトーム解析歯周組織再生過程をin vitroで再現するために、当教室で樹立した歯根膜細胞を長期培養した際の遺伝子発現をDNAチップを用いて解析を試みた。すなわち、歯根膜細胞からRNAを培養0日目、3日目、6日目、9日目、12日目、15日目、18日目に抽出し、それぞれのサンプルRNAから逆転写反応により、Cyamine dye(cy3およびcy5)にて標識されたプローブを調整し、DNAチップにハイブリダイゼーションした。そして、培養0日目のサンプルをリファレンスコントロールとして、それぞれの培養日サンプルとの間で遺伝子発現を比較した。2)クラスター分析・GeneOntology解析による歯根膜全遺伝子パスウェイの解明上記1)で得られた遺伝子発現データを統計学的処理することにより、遺伝子の発現パターンを指標とした遺伝子発現クラスター分析、および各遺伝子の生物学的機能を示すGeneOntology解析を行うことにより、歯周組織再生過程における全遺伝子トランスクリプトーム解析を行った。さらに、クラスター分析とGeneOntology解析の結果を統合することにより、統計学に基づいた歯周組織再生過程における代謝および細胞内シグナル分子の経路図(代謝・シグナルパスウェイ)を作成した。その結果、ヒト歯根膜細胞の全遺伝子プロファイリング解析の結果、ヒト歯根膜細胞の硬組織形成分化過程においてはヒト全遺伝子中3175個の遺伝子が有意な発現変化を示すことが明らかとなった。

1）利用DNA芯片对牙周膜细胞分化过程进行转录组分析为了在体外重现牙周组织再生过程，我们利用DNA芯片分析了本实验室建立的牙周膜细胞长期培养过程中的基因表达。我试着分析一下。即，在培养第0天、第3天、第6天、第9天、第12天、第15天和第18天从牙周膜细胞中提取RNA，并对各样品RNA进行逆转录反应。制备氰胺染料（cy3 和 cy5）并与 DNA 芯片杂交。然后，使用培养第0天的样品作为参考对照，比较每个培养日的样品之间的基因表达。 2)通过聚类分析和GeneOntology分析阐明牙周膜中的所有基因通路通过对上述1)中获得的基因表达数据进行统计处理，以基因表达模式为指标进行基因表达聚类分析，并对每个基因进行GeneOntology分析，显示全基因转录组在牙周组织再生过程中的生物学功能。此外，通过整合聚类分析和GeneOntology分析的结果，我们创建了牙周组织再生过程中代谢和细胞内信号分子的基于统计的通路图（代谢/信号通路）。结果，对人牙周膜细胞的全基因谱分析表明，所有人类基因中有3175个基因在人牙周膜细胞的硬组织形成分化过程中表现出显着的表达变化。

项目成果

期刊论文数量（1）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

ヒト歯根膜細胞の硬組織形成分化過程における全遺伝子発現プロファイリング解析

人牙周膜细胞硬组织形成分化过程全基因表达谱分析

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Naoyuki Takahashi;et. al.;Pan Y;Ohnishi H;張剛太;張剛太;Yasuko Ishikawa;Yasuko Ishikawa;王 ?;石川康子;王〓;Wang D;石川康子;張剛太;康金森;張剛太;康金森;張剛太;Zhenfang Yuan;Gouta Cho;Yuan Pan;石川康子;石川康子;石川康子;米田晋也
通讯作者：
米田晋也