High quality genome assembly and construction of high-resolution linkage map by sequencing and SNPs typing of haploid genome individuals

通过单倍体基因组个体的测序和 SNP 分型,实现高质量基因组组装和高分辨率连锁图的构建

基本信息

  • 批准号:
    25640099
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.58万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 财政年份:
    2013
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2013-04-01 至 2015-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ダブルハプロイド個体を活用した高品質トラフグゲノムアセンブリの作成
使用双单倍体个体创建高质量的虎河豚基因组组装
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    張虹;陳盈光;木下滋晴;浅川修一;鈴木穣;清水厚志;岡野栄之;工藤 純;斎藤和敬;渡部終五
  • 通讯作者:
    渡部終五
Genome and transcriptome analysis of aquatic organisms by next generation sequencing
通过下一代测序对水生生物进行基因组和转录组分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    張虹;陳盈光;木下滋晴;浅川修一;鈴木穣;清水厚志;岡野栄之;工藤 純;斎藤和敬;渡部終五;S. Asakawa
  • 通讯作者:
    S. Asakawa
Utilization of a doubled-haploid individual in construction of a high-quality torafugu (Takifugu rubripes) genome assembly
利用双单倍体个体构建高质量红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)基因组组装
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hong Zhang;Shigeharu Kinoshita;Engkong Tan;Yutaka Suzuki;Atsushi Shimizu;Hideyuki Okano;Jun Kudoh;Kazuyoshi Saito;Shugo Watabe;Shuichi Asakawa
  • 通讯作者:
    Shuichi Asakawa
Dramatic improvement in genome assembly achieved using doubled-haploid genomes.
使用双单倍体基因组实现了基因组组装的显着改进。
  • DOI:
    10.1038/srep06780
  • 发表时间:
    2014-10-27
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Zhang H;Tan E;Suzuki Y;Hirose Y;Kinoshita S;Okano H;Kudoh J;Shimizu A;Saito K;Watabe S;Asakawa S
  • 通讯作者:
    Asakawa S
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