ヘリコバクター・シネディの特定のクローンに存在する新規のゲノム修飾の役割解明

阐明电影螺杆菌特定克隆中存在的新基因组修饰的作用

• 批准号: 19K07074
• 负责人: 林原 絵美子
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K07074/
• 关键词: Phosphorothioate化修飾; Helicobacter cinaedi; DNA修飾; メチル化; Helicobacter; Dnd遺伝子; Restriction-Modification; Phosphorothioate DNA

DNAのPhosphorothioate（PT）化修飾は最近近年明らかになった新規のDNA修飾であり，メチル化修飾では塩基がメチル化されるのに対し，PT化修飾ではデオキシリボースを繋ぐリン酸基の酸素が硫黄に置換される．メチル化修飾は外来DNAから自己のDNAを守るRestriction-Modification（RM）システムの一環であるだけでなく，遺伝子の発現調節を介して病原性や環境適応に寄与している．一方，PT化修飾の役割には不明な点が多い．そこで，本研究ではH. cinaediのPT化修飾が，病原性や環境適応においてどのような役割を果たしているのかに着目する．今年度はCaco-2感染実験での評価とマウス感染実験での評価系を構築を行った。またSMRT法により同定したPT化の標的モチーフ（PT化されているのは一部のモチーフのみ）とトランスクリプトーム解析で発現変動のあった遺伝子について位置関係の解析を行った。

DNA的磷酸硫酸盐（PT）修饰是一种新的DNA修饰，最近揭示了甲基化修饰，导致碱是甲基化的，而PT修饰取代了将脱氧核糖连接的磷酸盐组中的氧气。甲基化修饰不仅是保护自己的DNA免受异物DNA的限制修饰（RM）系统的一部分，而且还通过调节基因表达来有助于致病性和环境适应。另一方面，关于PT修饰的作用有许多未知数。因此，在这项研究中，我们着重于PT修饰在Cinaedi在致病性和环境适应中的作用。今年，我们构建了一个用于CACO-2感染实验和小鼠感染实验的评估系统。此外，分析了通过SMRT方法鉴定的PTization的靶标基序（仅一些基序被PT），并通过转录组分析分析具有表达变化的基因。

项目成果

Characterization of HcaA, a novel autotransporter protein in Helicobacter cinaedi, and its role in host cell adhesion

• DOI: 10.1101/2022.11.18.517170
• 发表时间: 2023-09-21
• 期刊: bioRxiv
• 作者: Aoki，Sae;Mori，Shigetarou;Rimbara，Emiko
• 通讯作者: Rimbara，Emiko

Antimicrobial resistance in Helicobacter cinaedi

胃螺杆菌的抗菌药物耐药性

• 发表时间: 2020
• 作者: 林原絵美子;森茂太郎;金玄;鈴木仁人;柴山恵吾
• 通讯作者: 柴山恵吾

Helicobacter suis胃粘膜感染と病態発症

猪螺杆菌胃黏膜感染及病理发展

• 发表时间: 2021
• 作者: 鈴木仁人;林原絵美子;松井英則;徳永健吾;柴山恵吾
• 通讯作者: 柴山恵吾

Helicobacter suis SNTW101株の培養成功と完全ゲノム配列の決定

猪螺杆菌SNTW101菌株成功培养及全基因组序列测定

• 发表时间: 2020
• 作者: 林原絵美子;松井英則;鈴木仁人;中村正彦;柴山恵吾;徳永健吾
• 通讯作者: 徳永健吾

ヘリコバクター・スイス感染症の診断のための定期健康診断の提案

关于定期体检诊断猪螺杆菌感染的建议

• 发表时间: 2020
• 作者: 松井英則;林原絵美子;鈴木仁人;柴山恵吾
• 通讯作者: 柴山恵吾