双極性障害大規模シーケンス解析による稀な生殖細胞系列変異と体細胞変異の包括的研究

通过大规模测序分析全面研究双相情感障碍中罕见的种系和体细胞突变

基本信息

批准号：
21H02855
负责人：
高田篤
金额：
$ 11.07万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02855/
关键词：
エクソーム次世代シーケンサー双極性障害体細胞変異

项目摘要

2022年度は、昨年度までに取得したエクソームシーケンスデータの解析を行い、クオリティコントロール、シーケンスマッピング、変異コール、変異タイプ等の基本的なアノテーションの付与などを実施した。引き続いて、コントロールデータとの統計比較、種々のアノテーション（一般集団での頻度、ミスセンス変異の有害度、エピゲノム・転写因子結合情報等）を進めるためのデータ処理を行っている。また、体細胞変異の解析を優先する形で研究を進め、その成果を共同研究として論文としてまとめた。並行して、他の精神神経疾患のゲノムデータ解析を実施し、疾患間比較の基盤を構築した。また、ゲノム解析で同定される疾患関連遺伝子・変異の機能解析を行うための細胞実験系を整備し、CRISPR/Cas9で変異を導入した細胞のRNA-seq解析等を実施した。関連するプロジェクトとして、機械学習手法を用いて神経発達障害原因遺伝子を大規模に同定した研究（Hamanaka et al., Genome Medicine 2022）、ゲノムワイド関連解析の成果に基づいて作製された双極性障害モデルマウスを多角的に解析した研究（Yamamoto et al., Molecular Psychiatry 2023）等の成果を報告した他、統合失調症の分子病理研究に関する最新の知見をまとめるとともに今後の研究の方向性について論じた総説（Nakamura and Takata, Molecular Psychiatry 2023）等を発表した。

在2022年，我们分析了直到去年获得的外显子序列数据，并提供了基本注释，例如质量控制，序列映射，突变调用和突变类型。随后，进行数据处理以提高与控制数据和各种注释（普通人群的频率，错义突变的有害性，表观基因组/转录因子结合信息等）的统计比较。此外，对体细胞突变的分析进行了优先进行研究，并将这项研究的结果汇编成论文作为联合研究项目。同时，进行了其他神经精神疾病的基因组数据分析，以建立隔离间比较的基础。此外，我们开发了一个细胞实验系统，用于通过基因组分析鉴定的疾病相关基因和突变的功能分析，并对已引入CRISPR/CAS9引入的细胞进行了RNA-Seq分析。相关项目包括对使用机器学习方法引起的神经发育障碍引起的基因的大规模鉴定的研究（Hamanaka等人，基因组医学2022），以及基于全基因组关联分析的结果（Yamamomoto等人的摩擦性研究），对躁郁症模型的多方面分析进行了多方面分析研究。并讨论未来研究的方向（Nakamura和Takata，分子精神病学2023）。

项目成果

期刊论文数量（20）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

クラスタ/ハブ細胞を決定する遺伝子・鍵分子経路の特定およびヒト疾患との関連解析

鉴定决定簇/中心细胞的基因和关键分子途径并分析与人类疾病的关系

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
門前暁;堀越舞;菊池愛;多田羅洋太;真里谷靖;高田篤
通讯作者：
高田篤

クラスタ/ハブ細胞の遺伝子発現特性解明に向けた一細胞シーケンス解析の取り組み

单细胞序列分析努力阐明簇/中心细胞的基因表达特征

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
高岡秀旭，武田朱公，藤岡智宏，中嶋恒男，大山茜，伊藤祐規，鷹見洋一，竹屋泰，山本浩一，杉本研，樂木宏実，森下竜一;高田篤
通讯作者：
高田篤

The rare variant genetics of neuropsychiatric disorders; exome sequencing and beyond

神经精神疾病的罕见变异遗传学；

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Okada Tsuyoshi;Hori Hikaru;Hasegawa Naomi;Yasui-Furukori Norio;Hashimoto Ryota;高田篤
通讯作者：
高田篤

Investigation of newly arising mutations in psychiatric disorders and their implication in abnormal aging

研究精神疾病中新出现的突变及其对异常衰老的影响

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tashiro M;Ishioka Y;Mesfin BT;Inamura A,Watanuki S;Miyake M;Hiraoka K;Harada R;Furumoto S;Yanai K;Okamura N;Watabe H.;Kenji Hashimoto;高田篤
通讯作者：
高田篤

データ駆動型アプローチによるてんかん性脳症のゲノム解析と分子診断精度向上にむけての取り組み

使用数据驱动的方法提高癫痫性脑病基因组分析和分子诊断的准确性