Discrimination between primary and metastatic lung tumors by genomic profile

通过基因组谱区分原发性和转移性肺肿瘤

基本信息

批准号：
21K08894
负责人：
後藤太一郎
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Yamanashi Prefectural Hospital Organization
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

他臓器癌(大腸癌、胃癌、乳癌、頭頚部癌、骨肉腫など)の治療歴があり、後に肺腫瘍が出現した患者で、2014年4月から2021年4月の期間に当院において肺腫瘍の摘出手術を施行した症例を対象とした。書面による同意が得られた患者を研究対象とし、本年度計42例での解析を行った。前年度に施行したNGS解析の結果を用いて、遺伝子変異のクラスター解析を行い、他臓器癌と肺腫瘍の遺伝子変異パターンを統計学的に比較検討した。42症例において、遺伝子変異パターンの一致、不一致により、原発性肺癌（7症例）または転移性肺腫瘍（35症例）と診断可能であった。また、Oligometastasisに対する手術治療（局所制御）の意義や長期予後への影響を検討するため、肺転移35症例につき、以下のphylogeny解析を追加した。正常細胞から原発巣、転移巣を生じるまでのphylogeny：原発巣と転移巣の遺伝子変異解析結果を用いて、N-J法によりクラスター解析を行い、phylogenetic解析（‘ape’ and ‘phangon R’, 3.2.3 on linux）を追加した。腫瘍の進化系統樹を作成し、正常細胞から分岐まで、分岐後各成分までの遺伝子学的距離、関連遺伝子変異を推定し、腫瘍の進化過程・病勢進行の機序を検証した。また、Trunk-ratio (正常細胞から分岐までの遺伝子学的距離/全遺伝子学的距離)や付加されるmutationのpattern・個数と術後予後との相関を検証した。以上より、clinical outcomeに影響するmutational factorsが同定された。

有其他器官癌症（结直肠癌、胃癌、乳腺癌、头颈癌、骨肉瘤等）治疗史，随后发生肺部肿瘤，2014年4月至2014年4月期间在我院接受肺癌治疗的患者2021年4月。受试者为接受肿瘤切除手术的病例。该研究纳入了提供书面同意的患者，今年总共分析了 42 名患者。利用前一年进行的NGS分析结果，我们进行了基因突变的聚类分析，并对其他器官癌症和肺部肿瘤的基因突变模式进行了统计比较和检查。在 42 例病例中，可以根据一致或不一致的基因突变模式诊断原发性肺癌（7 例）或转移性肺肿瘤（35 例）。此外，为了探讨手术治疗（局部控制）对寡转移的意义及其对长期预后的影响，我们对35例肺转移病例添加了以下系统发育分析。从正常细胞到原发性和转移性病灶的系统发育：利用原发性和转移性病灶的基因突变分析结果，采用N-J方法进行聚类分析，进行系统发育分析（‘ape’和‘phangon R’, 3.2.3 on linux)已添加。我们构建了肿瘤的进化系统发育树，估算了正常细胞到分支的遗传距离、分支后到各组成部分的遗传距离以及相关基因突变，验证了肿瘤的进化过程和疾病进展的机制。我们还验证了主干比（正常细胞与分支的遗传距离/总遗传距离）、添加突变的模式/数量和术后预后之间的相关性。基于上述，确定了影响临床结果的突变因素。