歯周病原因菌の病原性因子及び挿入配列を制御するsmall RNAの解析

控制牙周病致病菌毒力因子和插入序列的小RNA分析

基本信息

批准号：
20K09922
负责人：
大貝悠一
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Kagoshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K09922/
关键词：
歯周病原因菌 sRNA small RNA 挿入配列

项目摘要

Aggregatibacter actinomycetemcomitansのsmall RNA発現性の解析を目的とし、RNAシャペロンのひとつでありsRNAを介した発現制御に関与するhfqの欠損株、外環境の刺激に応答し各種遺伝子やsRNAの制御を担う２成分制御系の欠損株の解析を行った。一部の２成分制御系因子の欠損株においてはヒト培養細胞への付着性、酸化ストレスに対する抵抗性に変化が認められたため、現在詳細なメカニズムの検討中である。下流遺伝子の解析においては二次元電気泳動法により酸化ストレスに変動を示す２成分制御系欠損株１株においてTCA回路で働く因子のタンパク発現量の増加を認めた。同欠損株を用いたRNAseq解析においては嫌気呼吸関連因子や酸化ストレス関連因子の発現変動を複数認めた。これら個別の因子とTCSの関連を現在検討中である。hfq欠損株は二次元電気泳動で複数の著明な発現変動を示すタンパクが見られる。RNAseq解析においては外膜タンパクの一種であるオートトランスポーターなど病原性との関連が示唆されている因子の発現変動を確認した。これらの発現制御に関与するsRNAの探索を今後行う予定である。Fusobacteirum nucleatumは歯周病原因菌の一つである。本菌は他細菌と結合する（共凝集）ことにより、口腔内のプラーク成熟に重要な役割を持つと考えられている。当研究では本菌にも着目し、Hfqタンパクやその他２成分制御系などのレギュレーターの遺伝子欠損株の解析から既報のF. nucleatum sRNAの発現性などを解析する予定である。

为了分析聚集放线菌的小RNA表达，我们分析了HFQ的菌株，缺乏表达控制，一种RNA伴侣，并参与了SRNA介导的表达控制，以及对两组分量控制系统的菌株，对控制外部环境的刺激，控制了各种基因和SRNAS。在缺乏两个组分调节因素的某些菌株中，已经观察到它们对人培养细胞的粘附变化和对氧化应激的抵抗力，目前正在研究详细的机制。在对下游基因的分析中，在一个两组分组控制系统的一个菌株中观察到了在TCA回路中起作用的因子的蛋白质表达水平的增加，该菌株表现出2D电泳在氧化应激中的变化。在使用相同缺乏应变的RNASEQ分析中，观察到厌氧呼吸相关因子表达的多个变化和氧化应激相关因素。这些个人因素与TC之间的关联目前正在研究中。 HFQ缺陷菌株通过二维电泳在表达上显示出多种显着变化。 RNASEQ分析证实了已建议与致病性有关的因子的表达变化，例如自动转运蛋白，一种外膜蛋白。我们计划在将来搜索涉及控制这些表达的SRNA。 fusobacteirum核是牙周病理的致病细菌之一。该细菌被认为通过与其他细菌结合（凝聚）在口腔斑块成熟中起重要作用。这项研究还侧重于该细菌，并将通过分析调节剂（例如HFQ蛋白和其他两种组分调节系统）的基因缺陷菌株分析先前报道的Nucleatum sRNA的表达。