sRNA srvg23535调控exsE影响溶藻弧菌毒力的分子机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31902415
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1908.水产生物病原学与病害控制
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Bacterial small RNA (sRNA) mediated gene regulation plays an important role in the modulation of bacterial life activities. Our previous study has identified a novel sRNA srvg23535 in Vibrio alginolyticus. The deletion of srvg23535 significantly increased its virulence to zebrafish, and down-regulated the expression of a type III secretion system (T3SS) regulator gene exsE, indicating srvg23535 may negatively regulate the virulence of V. alginolyticus by promoting the expression of exsE and thus influencing the activity of T3SS. To test this hypothesis, the means of EMSA, sRNA-mRNA interaction system, transcriptional fusion, translation fusion and rifampicin block experiment will be employed to elucidate interaction mechinism between srvg23535 and exsE. By employing qRT-PCR, cell adhesion, cell invasion and zebrafish infection experiments, the effects of srvg23535 and exsE deletion on T3SS-related gene expression and host virulence will be explored. This project aims to clarify the virulence regulation mechanism by the new sRNA srvg23535 in V. alginolyticus, which may help to further deepen the pathogenic mechanism research of sRNAs in V. alginolyticus and even other pathogenic vibrio with providing new targets for vibriosis prevention and control.
细菌小RNA(sRNA)介导的基因表达调控是细菌生命活动的重要调节手段。前期研究我们首次鉴定得到溶藻弧菌sRNA srvg23535,并发现其缺失后对斑马鱼的毒力增强,且三型分泌系统(T3SS)调控子编码基因exsE的表达显著下降。因此,推测srvg23535通过促进exsE表达,影响T3SS活性,进而负调控溶藻弧菌的毒力。在此基础上,本项目拟结合sRNA-mRNA双质粒作用系统、EMSA、转录融合、翻译融合以及利福平阻滞等手段,明确srvg23535与exsE的相互作用机制;进一步通过qRT-PCR、细胞黏附、细胞侵袭和鱼体感染实验,确定srvg23535调控exsE影响溶藻弧菌T3SS的表达及对宿主的毒性,从而阐明srvg23535调控exsE影响溶藻弧菌毒力的分子机制。这将进一步深化sRNAs对溶藻弧菌甚至海洋病原弧菌致病的作用机制的研究,也为海洋弧菌病害防控技术的研发提供新的靶标。

结项摘要

细菌小RNA(sRNA)介导的基因表达调控是细菌生命活动的重要调节手段。前期研究我们首次鉴定得到溶藻弧菌sRNA srvg23535,并发现其可能调控三型分泌系统(T3SS)调控子编码基因exsE的表达,而影响T3SS活性,进而调控溶藻弧菌的毒力。本项目在前期研究基础上,结合sRNA-mRNA双质粒作用系统、EMSA、翻译融合、WesternBlot分析、基因敲除、RT-PCR等手段,明确溶藻弧菌中sRNA srvg23535以及伴侣蛋白Hfq调控exsE基因影响细菌毒力的作用机理。研究发现,exsE在srvg23535和hfq缺失后,翻译水均提高;此外,exsE在hfq缺失后转录水平在对数早期显著提高;同时EMSA实验表明,srvg23535和exsE均与Hfq蛋白结合,因此srvg23535在hfq协助下负调控exsE的翻译。进一步斑马鱼毒力研究发现,srvg23535缺失后,溶藻弧菌毒力略微下降, hfq缺失后,细菌毒力显著下降至0%,而exsE缺失后,细菌毒力显著上升至75.5%。因此,srvg23535在Hfq辅助下,抑制exsE的翻译,从而促进溶藻弧菌毒力。此外,利用比较转录组,我们获得了104个主要涉及鞭毛合成、趋化运动、生物膜形成、以及细菌分泌系统的基因为srvg23535的潜在靶标基因,并对其中的cbpD进行功能研究,发现cbpD可能通过正调控溶藻弧菌的运动能力和胞外蛋白酶分泌活性,而促进溶藻弧菌的毒力。此研究丰富了溶藻弧菌sRNAs的调控作用研究,也为海洋弧菌病害的防控技术的研发提供新的靶标,旨在为保障水产品的健康提供参考。

项目成果

期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
哈维弧菌 flhF 和 CU052_26825 缺失株的构建及其生物学特性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    广东海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邓益琴;张亚秋;林梓阳;冯娟;程长洪;马红玲;刘广鑫;苏友禄
  • 通讯作者:
    苏友禄
Functional characterization of VscCD, an important component of the type Ⅲ secretion system of Vibrio harveyi
哈维氏弧菌Ⅲ型分泌系统重要组成部分VscCD的功能表征
  • DOI:
    10.1016/j.micpath.2021.104965
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Microbial Pathogenesis
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Yaqiu Zhang;Yiqin Deng;Juan Feng;Zhixun Guo;Haoxiang Chen;Baotun Wang;Jianmei Hu;Ziyang Lin;Youlu Su
  • 通讯作者:
    Youlu Su
What drives changes in the virulence and antibiotic resistance ofVibrio harveyiin the South China Sea?
是什么推动了南海哈维氏弧菌毒力和抗生素耐药性的变化?
  • DOI:
    10.1111/jfd.13197
  • 发表时间:
    2020-06-18
  • 期刊:
    JOURNAL OF FISH DISEASES
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Deng, Yiqin;Xu, Liwen;Feng, Juan
  • 通讯作者:
    Feng, Juan
LuxS modulates motility and secretion of extracellular protease in fish pathogen Vibrio harveyi
LuxS 调节鱼类病原体哈维氏弧菌的运动和细胞外蛋白酶的分泌
  • DOI:
    10.1139/cjm-2021-0311
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Canadian Journal of Microbiology
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Ya-Qiu Zhang;Yi-Qin Deng;Juan Feng;Jian-Mei Hu;Hao-Xiang Chen;Zhi-Xun Guo;You-Lu Su
  • 通讯作者:
    You-Lu Su
Analysis of virulence genes and antibiotic resistance of Photobacterium damselae isolated from marine fishes in coastal South China
  • DOI:
    10.13343/j.cnki.wsxb.20200129
  • 发表时间:
    2020-01-01
  • 期刊:
    Weishengwu Xuebao
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Deng, Yiqin;Xu, Liwen;Feng, Juan
  • 通讯作者:
    Feng, Juan

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其他文献

我国热带典型海草床潜在致病菌群落结构及其毒力基因丰度的空间特征
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    --
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    江志坚
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    海洋科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邓益琴;赵哲;刘松林;陈偿
  • 通讯作者:
    陈偿
石斑鱼及暂养环境中副溶血弧菌分离鉴定与毒力评价
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
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    --
  • 作者:
    邓益琴;刘助红;龙云映;陈偿
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    陈偿
溶藻弧菌在海水长期饥饿胁迫下的活性分析及菌落相变特征
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
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    --
  • 作者:
    张吕平;韦露;邓益琴;陈偿
  • 通讯作者:
    陈偿

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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