Development of detection method for multiple disease-causative proteins using dried blood spots

开发利用干血斑检测多种致病蛋白的方法

基本信息

  • 批准号：
    21K07877
  • 负责人：
    中島 大輔
  • 金额：
    $ 2.58万
  • 依托单位：
    Kazusa DNA Research Institute
  • 依托单位国家：
    日本
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份：
    2021
  • 资助国家：
    日本
  • 起止时间：
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态：
    已结题

项目摘要

乾燥ろ紙血から抽出した蛋白質に特化した高深度プロテオーム解析法の開発を行った。血液蛋白質はこれまで解析してきた培養細胞や生体組織と蛋白質の種類や濃度のダイナミックレンジが大きく異なるためシステムを再構築する必要がある。LC-MSのLCシステムについては、カラム充填剤の種類、カラム長、流速などを最適化した。MS部分についてはより多くの乾燥ろ紙血蛋白質を観測する為のイオン化法の改良、DIA法のMSレンジ、Isolation window幅、フラグメントイオンの蓄積時間などのパラメーターやノイズ除去の為のイオンモビリティーの電圧条件を最適化した。またin silico蛋白質同定用データベースを構築することにより、最終的に1検体1測定により乾燥ろ紙血から500以上の疾患原因蛋白質を含む3,000以上の蛋白質の同定・定量することができた。
我们开发了一种专门针对从干燥滤纸血液中提取的蛋白质的深度蛋白质组分析方法。血液蛋白的蛋白质类型和浓度的动态范围与迄今为止分析的培养细胞和生物组织有很大差异，因此有必要重建系统。对于LC-MS液相色谱系统，我们对柱填充材料的类型、柱长、流速等进行了优化。对于MS部分，我们改进了电离方法以观察更多的干燥滤纸血液蛋白，并改进了DIA方法的MS范围、隔离窗宽度和碎片离子积累时间以及离子淌度的电压条件等参数消除噪音。此外，通过构建计算机蛋白质识别数据库，我们最终能够对干燥的滤纸血液中每个样本一次测量来识别和量化 3,000 多种蛋白质，其中包括 500 多种致病蛋白质。

项目成果

期刊论文数量（5）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Development of a Simple and Stable NanoESI Spray System Using Suction Wind from the MS Inlet
利用 MS 入口的吸风开发简单稳定的 NanoESI 喷雾系统
  • DOI：
    10.1021/acs.jproteome.3c00146
  • 发表时间：
    2023
  • 期刊：
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Kawashima Yusuke;Ishikawa Masaki;Konno Ryo;Nakajima Daisuke;Ohara Osamu
  • 通讯作者：
    Ohara Osamu
Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry-Based Deep Proteome Analysis for Hydrophobic Proteins from Dried Blood Spots Enriched by Sodium Carbonate Precipitation
基于碳酸钠沉淀富集的干血斑中疏水性蛋白质的基于数据独立采集质谱的深度蛋白质组分析
  • DOI：
    10.1007/978-1-0716-1936-0_4
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Daisuke Nakajima; Osamu Ohara; Yusuke Kawashima
  • 通讯作者：
    Yusuke Kawashima
臨床プロテオミクスを目指した炭酸ナトリウム沈殿法を用いて調製した乾燥ろ紙血由来のタンパク質の簡便かつ高感度な解析法の開発
开发一种简单且高灵敏度的分析方法，用于临床蛋白质组学中使用碳酸钠沉淀法制备的干燥滤纸血液中的蛋白质
  • DOI：
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    中島大輔;小原收;川島祐介
  • 通讯作者：
    川島祐介
臨床プロテオミクスを目指した炭酸ナトリウム沈殿法を用いて調製した乾燥ろ紙血由来のタンパク質の簡便かつ高感度な解析法の開発
开发一种简单且高灵敏度的分析方法，用于临床蛋白质组学中使用碳酸钠沉淀法制备的干燥滤纸血液中的蛋白质
  • DOI：
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    中島大輔;小原收;川島祐介
  • 通讯作者：
    川島祐介
Toward proteome-wide exploration of proteins in dried blood spots using liquid chromatography-coupled mass spectrometry
使用液相色谱-质谱联用技术对干血斑中的蛋白质进行全蛋白质组探索
  • DOI：
    10.1002/pmic.202100019
  • 发表时间：
    2021
  • 期刊：
  • 影响因子：
    3.4
  • 作者：
    Daisuke Nakajima; Osamu Ohara; Yusuke Kawashima
  • 通讯作者：
    Yusuke Kawashima
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  • 通讯作者：
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  • 影响因子：
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  • 通讯作者：
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  • 发表时间：
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  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    堀江 静;山崎 貴男;岡本 剛;中島 大輔;緒方 勝也;飛松 省三
  • 通讯作者：
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    峯浦　一貴;田中 里奈;栢分 秀直;山田 義人;豊 洋次郎;中島 大輔;大角 明宏;濱路 政嗣;毛受 暁史;伊達 洋至
  • 通讯作者：
    伊達 洋至

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  • 发表时间：
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  • 资助金额：
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知道了