Development of liquid biopsy technology (donor-derived DNA analysis) aimed at improving the results of liver transplantation

开发液体活检技术（供体来源的 DNA 分析），旨在改善肝移植的结果

• 批准号: 20K08967
• 负责人: 篠田 昌宏
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: International University of Health and Welfare
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K08967/
• 关键词: ドナー由来cfDNA; 肝移植; 拒絶反応; グラフト機能; 早期診断; 拒絶; cell free DNA

ctDNA (circulating tumor DNA)に着眼した診断は、「早期診断」「正確性」「低侵襲性」を兼ね備えた新しい技術として注目されている。臓器移植においては、ドナーとレシピエントの遺伝子の違いを利用し、血液中のddcfDNA（donor derived cell free DNA)を検知することによるリキッドバイオプシーの価値が注目されている。心、肺、肝、腎、膵、小腸など各種の臓器移植で移植後急性期におけるグラフト機能マーカーとしての有用性が相次ぎ、複数の臨床試験が行われている。微量なddcfDNAを正確に測定する技術は研究の新規性の一つである。2016年より国立遺伝学研究所によってPCRによる増幅、次世代シーケンシング（Next-generation DNA sequencing、以下NGS）による解析が開始されたが、PCRに用いるprimerによって選択性と増幅効率にbiasがかかるために、PCRによるbiasを避け正確にドナーとレシピエントを区別するためにcapture hybridizationを採用し、生物学的統計を基に1000 Single Nucleotide Polymorphism (SNP)を採用している。またコンピューター解析によってドナーとレシピエントの遺伝情報が無くても解析が可能であり、新規の移植患者のみならず過去に移植を受けた患者にも応用が可能である。SNP多型のパネルは集団毎に異なっており、欧米のパネルを日本人に適用することはできないが、我々は日本人をターゲットとした多型パネルとオリジナルのddcfDNA算出法を確立している。我々は、肝移植後急性期に急性拒絶などで移植肝が障害されていることを把握するのにddcfDNAが有用であるとの仮説を立て研究を行った。

专注于CTDNA（循环肿瘤DNA）的诊断一直吸引着一种新技术，将“早期诊断”，“准确性”和“低侵入性”结合在一起。在器官移植中，使用供体和食谱爱好者之间的基因，通过检测血液中DDCFDNA（供体衍生细胞的无细胞DNA）的液体活检值引起了人们的注意。各种器官，例如思维，肺，肝，肾脏，胰腺和小肠，在移植后移植期间已被用作移植功能标记，并正在进行多次临床试验。精确测量少量DDCFDNA的技术是研究的新颖性之一。 2016年，美国国家基因学术界已经通过PCR进行了分析，并通过下一代测序（下一代DNA测序，以下是NGS），但是由于选择了用于PCR的底漆，以避免使用偏见。 PCR的偏置并准确区分供体和受体，它被采用，并根据生物统计数据使用1000个单核苷酸多态性（SNP）。此外，可以在没有捐助者和接受者的遗传信息的情况下对计算机分析进行分析，并且不仅可以应用于新移植的患者，还可以应用于过去已移植的患者。每组SNP多态面面板都不同，并且不可能将西方面板应用于日语，但是我们已经建立了一个针对日语的多形面板和原始的DDCFDNA计算方法。我们进行了一个假设，即DDCFDNA有用，可以理解移植肝在肝移植后紧急情况下由于急性拒绝而受到损害。

项目成果

移植医療におけるリキッドバイオプシー 肝移植と小腸移植におけるドナー由来cell free DNA解析の試みと展望.

移植医学中的液体活检：肝脏和小肠移植中供体来源的无细胞 DNA 分析的试验和前景。

• 发表时间: 2021
• 作者: 金森 洋樹;山田 洋平;長谷川 康;篠田 昌宏;井ノ上 逸朗;尾原 秀明;北川 雄光;黒田 達夫.
• 通讯作者: 黒田 達夫.

肝移植におけるドナー由来cell free DNA解析の試みと展望

肝移植中供体来源的无细胞 DNA 分析的试验与展望

• 发表时间: 2022
• 作者: Katsuki Miyazaki;Morine Y;Imura S;Ikemoto T;Saito Y;Yamada S;Tokuda K;Okikawa S;Yamashita S;Oya T;Tsuneyama K;Shimada M;篠田 昌宏
• 通讯作者: 篠田 昌宏

肝移植と小腸移植におけるドナー由来cell free DNA解析の試みと展望

肝脏和小肠移植中供体来源的无细胞 DNA 分析的试验和前景

• 发表时间: 2022
• 作者: 金森 洋樹;山田 洋平;梅山 知成;高橋 信博;加藤 源俊;長谷川 康;尾原 秀明;篠田 昌宏;入江 理恵;辻川 華子;大喜多 肇;西郷 健一;光永 滋樹;井ノ上 逸朗;黒田 達夫
• 通讯作者: 黒田 達夫