p53信号转导网络的动力学和功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11175084
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    52.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A2503.统计物理与复杂系统
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

电离辐射造成DNA双链断裂后,细胞会启动一系列的程序来阻滞细胞周期、修复损伤或实施凋亡。肿瘤抑制因子p53在其中起着关键的作用。阐明细胞命运抉择(存活或凋亡)的机制具有重要的理论和现实意义。本项目通过构建模块化的p53信号转导网络模型,建立微分方程组刻画蛋白浓度和其他量随时间的变化,详细描述从产生DNA断裂到决定细胞命运的全过程。我们运用统计物理和非线性动力学的概念和方法,分析信号传导过程,重点研究p53脉冲的反馈回路机制、复杂网络的动力学和功能,揭示p53和p53辅助因子的协作机制,阐明细胞核内、外的p53信号通路协同决定细胞命运的机制。这些研究内容涉及了细胞DNA损伤应激反应的核心过程。我们已开展了大量的预研工作,提出了有关细胞抉择过程的机制的假说,得到的初步结果表明我们的方案是可行的。本项目将促进人们对p53抑癌功能的了解,为发展新的肿瘤诊断和治疗手段提供线索和思路。

结项摘要

P53蛋白是细胞最重要的肿瘤抑制因子之一,被誉为“基因组卫士”。细胞内存在以p53为中心的信号转导网络,调控细胞应答多种应激信号。阐明细胞命运抉择(细胞周期阻断、细胞衰老或凋亡)的调控机制具有重要的理论和现实意义。.本项目运用数学建模、数值模拟和理论分析的方法,详细研究了p53信号网络应答DNA损伤、端粒缩短、低氧和癌基因活化等应激信号的动力学和功能。我们构建模块化的p53网络模型,建立微分方程组刻画蛋白浓度和其他量随时间的变化,结合描述网络的动力学来阐明细胞命运抉择的分子机制。主要的成果如下:1)基于网络中的反馈回路结构,阐述重要信号分子的动力学(如p53浓度的周期振荡或开关式激发等)及其调控机制;2)描述了p53的翻译后修饰、胞内定位、与辅助因子的相互作用,p53网络与其他信号通路的对话,微小RNA等对细胞应答行为的调控机制,揭示了p53动力学对细胞命运抉择的重要影响;3)根据不同的应激信号类型和细胞类型,提出了一系列的细胞命运抉择机制,如根据p53脉冲的个数决定DNA双链断裂后MCF7和MCF10A细胞的命运;4)刻画了基因转录过程的动力学行为及其分子机制。.我们的工作提供了有关细胞应激响应行为的系统、整合的图像,解释了实验现象,调和了文献中看似矛盾、冲突的结果,促进了人们对p53抑癌功能的了解,为发展新的肿瘤诊疗手段和药物设计提供了线索和思路。这些工作凸显了研究细胞信号转导动力学机制的重要性和必要性,推动了对p53动力学的研究。我们提出的理论框架和研究方法可广泛用于探究细胞的信号转导机制。我们已发表了10篇论文,另有5篇论文在审稿或修改中。.

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Coordination between p21 and DDB2 in the cellular response to UV radiation.
p21 和 DDB2 在细胞对紫外线辐射反应中的协调
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0080111
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Li H;Zhang XP;Liu F
  • 通讯作者:
    Liu F
Dynamic mechanism for the transcription apparatus orchestrating reliable responses to activators.
转录装置协调对激活剂的可靠响应的动态机制
  • DOI:
    10.1038/srep00422
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    SCIENTIFIC REPORTS
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Wang, Yaolai;Liu, Feng;Wang, Wei
  • 通讯作者:
    Wang, Wei
Interplay between Mdm2 and HIPK2 in the DNA damage response
Mdm2 和 HIPK2 在 DNA 损伤反应中的相互作用
  • DOI:
    10.1098/rsif.2014.0319
  • 发表时间:
    2014-07
  • 期刊:
    Journal of the Royal Society Interface
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Zhang, Xiao-Peng;Liu, Feng;Wang, Wei
  • 通讯作者:
    Wang, Wei
p53信号网络的非线性动力学研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国科学:物理学 力学 天文学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张小鹏;刘锋;王炜
  • 通讯作者:
    王炜
Reconciling the concurrent fast and slow cycling of proteins on gene promoters
协调基因启动子上蛋白质的同时快速和慢速循环
  • DOI:
    10.1098/rsif.2014.0253
  • 发表时间:
    2014-07-06
  • 期刊:
    JOURNAL OF THE ROYAL SOCIETY INTERFACE
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Wang,Yaolai;Liu,Feng;Wang,Wei
  • 通讯作者:
    Wang,Wei

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刘锋的其他基金

能量压力下细胞命运抉择机制的研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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