减数分裂产生的重组、基因转换和突变的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91331205
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    350.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0607.基因组学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Meiosis is an important process to regulate genetic variation between generations. The mutation, crossing-over and gene conversion generated in this process is the most important inner force for genome variation. Recently, the development of re-sequencing technology makes it possible to reveal the detailed change of DNA sequences in meiosis. By special genetic design to get animal and plant materials for re-sequencing, the goal of this project is to understand the basic theory and law of micro-evolution. Our plan is 1) to detect the mutation rate of offspring from one meiosis; 2) to discover the difference of mutation rate from heterozygous and homozygous individual plants; 3) to find the number and distribution of crossing-over and gene conversion events after one meiosis; 4) to characterize the crossing-over and gene conversion of Arabidopsis thaliana by using tetrads. The project will not only reveal the law and impact on genome change of inner driving forces but also help to understand the inner base of eukaryotic adaptation and evolution.
减数分裂是调控生物世代交替过程中遗传与变异的关键环节。减数分裂过程产生的突变(mutation)、重组(crossing-over)、基因转换(gene conversion)等是基因组变异最重要的内在驱动要素。近年来,重测序技术的进步使研究其过程中产生的DNA细节变化成为可能。本项目就是通过特定的遗传设计,构建适合重测序的动植物遗传材料,进而检测只经历一次减数分裂子代的突变率;检测杂合体和纯合体子代的突变率是否存在差异; 检测减数分裂后重组和基因转换事件的数量和分布;用四分孢子DNA研究拟南芥重组和基因转换事件的区别与特征等,从而探索微进化机制的基本理论与法则。这些研究,将揭示内在驱动要素变化的规律性、了解它们对基因组变异的作用、并可更深入理解生物适应与进化的内在基础。

结项摘要

减数分裂是调控生物世代交替过程中遗传与变异的关键环节。减数分裂过程产生的突变、重组、基因转换等是基因组变异最重要的内在驱动要素。近年来,重测序技术的进步使对这些要素的系统研究成为可能。本项目通过特定的遗传设计,以拟南芥、水稻、桃树、蜜蜂、酵母等为研究材料,构建了一系列的杂合体及分离世代和四分孢子,通过重测序,系统的评估了生物遗传变异过程中的一些基本生物学问题。本项目的研究明确了各物种一次减数分裂产生突变、重组和基因转换的数量和模式,发现基因组的异质性可促进减数分裂的重组与突变,基因组杂合率越高,其突变、重组率越高。其核心在于揭示了生物多样性分子水平的“马太效应”,为基因组普遍存在的突变热点提供了新的解释。同时也说明,物种的交配与繁殖方式、群体的多样性等,与这些物种本身的遗传变异与演化速率相关。这些研究,加深了我们对生物体遗传变异来源及其演化过程的理解,为更深入理解生物适应与进化的内在基础和探索微进化机制的基本法则提供了研究素材。

项目成果

期刊论文数量(17)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Insertions/Deletions-Associated Nucleotide Polymorphism in Arabidopsis thaliana.
拟南芥插入/缺失相关核苷酸多态性
  • DOI:
    10.3389/fpls.2016.01792
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Guo C;Du J;Wang L;Yang S;Mauricio R;Tian D;Gu T
  • 通讯作者:
    Gu T
Extreme expansion of NBS-encoding genes in Rosaceae.
蔷薇科 NBS 编码基因的极度扩展。
  • DOI:
    10.1186/s12863-015-0208-x
  • 发表时间:
    2015-05-03
  • 期刊:
    BMC genetics
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Jia Y;Yuan Y;Zhang Y;Yang S;Zhang X
  • 通讯作者:
    Zhang X
Parent-progeny sequencing indicates higher mutation rates in heterozygotes
亲代测序表明杂合子的突变率较高
  • DOI:
    10.1038/nature14649
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Nature
  • 影响因子:
    64.8
  • 作者:
    Yang Sihai;Wang Long;Huang Ju;Zhang Xiaohui;Yuan Yang;Chen Jian-Qun;Hurst Laurence D.;Tian Dacheng
  • 通讯作者:
    Tian Dacheng
Dynamic evolution of NBS-LRR genes in bread wheat and its progenitors
面包小麦及其祖先NBS-LRR基因的动态进化
  • DOI:
    10.1007/s00438-014-0948-8
  • 发表时间:
    2015-04-01
  • 期刊:
    MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Gu, Longjiang;Si, Weina;Zhang, Xiaohui
  • 通讯作者:
    Zhang, Xiaohui
Cloning of novel rice blast resistance genes from two rapidly evolving NBS-LRR gene families in rice
从水稻两个快速进化的 NBS-LRR 基因家族中克隆新型稻瘟病抗性基因
  • DOI:
    10.1007/s11103-015-0398-7
  • 发表时间:
    2016-01-01
  • 期刊:
    PLANT MOLECULAR BIOLOGY
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Guo, Changjiang;Sun, Xiaoguang;Zhang, Xiaohui
  • 通讯作者:
    Zhang, Xiaohui

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水稻基因组中抗病基因正选择方式及基因转换的研究
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    杨四海
足细胞特异性因子nephrin及肿瘤蛋白-1在肾小球硬化过程中表达变化
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    保莉;田大成;郑亚莉
  • 通讯作者:
    郑亚莉

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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