高压条件下嗜高压细菌脂类生物合成过程中的碳同位素分馏研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41373071
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    100.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0312.生物地球化学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

We propose to investigate stable isotope fractionation in biosynthesis of lipids by deep-sea piezophilic bacteria under high-pressure conditions. This research is significant because establishing the systematics of high-pressure isotope geochemistry will afford the fundamental theory and principles of biological isotope fractionation under high-pressure conditions. These theories and principles are essential for studying life in the deep sea and the deep biosphere and the biogeochemical processes they modulate. This project will investigate carbon isotope fractionation in lipid biosynthesis by piezotolerant, piezophilic, and hyperpiezophilic bacteria with different metabolic pathways. It is a step toward attainment of the Principal Investigator's long-term goals of establishing the high-pressure isotope geochemistry by investigating (1) isotope fractionation of all bio-elements (e.g., C, H, O, N, and S) under high hydrostatic pressure conditions; (2) abiotic isotope fractionation under high hydrostatic/lithostatic pressure conditions. Results from this study can lead to new predictive models for understanding marine biogeochemistry and carbon cycle in the deep sea and the deep biosphere and provide a key to understanding paleoclimate, paleooceanography, and paleoecology through analysis of marine sediments and sedimentary rocks.
深海和深部生物圈无论在空间上还是在生物量上均占极大优势,研究它们对探究全球碳循环和气候变化具有重要理论和实际意义。脂类化合物及其稳定碳同位素比值是研究碳循环和生物地球化学过程的重要工具,但由于脂类化合物碳同位素分馏与微生物的生长压力有关,传统的根据常压微生物发展起来的碳同位素理论不适合深海和深部生物圈生物地球化学过程的研究。本项目拟通过实验室嗜高压细菌的培养,系统调查高压条件下深海嗜高压细菌脂类化合物生物合成过程中的碳同位素分馏与压力、温度、呼吸条件和代谢方式间的关系,查明不同脂类化合物间碳同位素分馏的差别,并建立各种嗜高压细菌不同脂类化合物碳同位素分馏与水压力、温度、呼吸条件和代谢方式间的关系模型。我们的研究将为探索深海和深部生物圈碳循环、微生物生理和生物地球化学过程提供有价值的研究工具,也将为今后建立高压同位素生物地球化学、进行脂类化合物的同位素异数体研究提供理论基础和实验数据。

结项摘要

微生物脂类生物标志化合物及其碳、氢同位素比值,是研究深海碳循环、深部生物圈生物-岩石-水相互作用、微生物代谢和生物地球化学循环的重要工具。但目前海洋学家和地球化学家所用的碳、氢同位素地球化学理论是基于地表微生物而建立起来的,不适用于深海和深部生物圈地球化学过程研究。在本项目实施的四年里,我们系统研究了嗜高压细菌在不同温度和生长压力条件下在脂类化合物生物合成过程中的碳、氢同位素分馏。项目按计划实施,已圆满完成原定研究目标,并取得了丰硕成果:(1)建立了嗜高压微生物在不同生长压力条件下脂类化合物生物合成过程中的碳同位素分馏模型。我们的研究表明,深海革兰氏阴性嗜高压微生物在脂类化合物生物合成中的碳同位素分馏与微生物生长压力有关,压力越高,碳同位素分馏越大;(2)建立了嗜高压微生物在不同生长压力条件下脂类化合物生物合成过程中的氢同位素分馏模型;(3)通过同位素测定,首次确定了嗜高压细菌生物合成多不饱和脂肪酸的生物合成途径,这是科学界过去欲通过基因鉴定和其他方法未能阐述的生物合成途径;(4)创立了新的同位素地球化学分支学科:高压同位素生物地球化学;(5)上述碳、氢同位素分馏模型的建立为生物地球化学家研究深海和深部生物圈碳、氢循环打下了基础。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Variation in abundance and community structure of particle-attached and free-living bacteria in the South China Sea
南海颗粒附着细菌和自由生活细菌丰度和群落结构的变化
  • DOI:
    10.1016/j.dsr2.2015.07.006
  • 发表时间:
    2015-12-01
  • 期刊:
    DEEP-SEA RESEARCH PART II-TOPICAL STUDIES IN OCEANOGRAPHY
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Li, Jiangtao;Wei, Bingbing;Fang, Jiasong
  • 通讯作者:
    Fang, Jiasong
Complete genome sequence of bacillus subtilis strain 29R7-12, a piezotolerant bacterium isolatedfrom coal-Bearing Sediments 2.4 km below the seafloor.
枯草芽孢杆菌菌株 29R7-12 的完整基因组序列,这是一种从海底以下 2.4 公里的含煤沉积物中分离出来的耐压细菌。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Genome Announcements
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wei Y;Cao J;Fang J;Kato C;Cui W
  • 通讯作者:
    Cui W
Microbial distribution in different spatial positions within the walls of a black sulfide hydrothermal chimney
黑色硫化物热液烟囱壁内不同空间位置的微生物分布
  • DOI:
    10.3354/meps10841
  • 发表时间:
    2014-08
  • 期刊:
    Marine Ecology Progress Series
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Li Jiangtao;Zhou Huaiyang;Fang Jiasong;Sun Yannan;Dasgupta Shamik
  • 通讯作者:
    Dasgupta Shamik
The POM-DOM piezophilic microorganism continuum (PDPMC)-The role of piezophilic microorganisms in the global ocean carbon cycle
POM-DOM亲压微生物连续体(PDPMC)-亲压微生物在全球海洋碳循环中的作用
  • DOI:
    10.1007/s11430-014-4985-2
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    SCIENCE CHINA-EARTH SCIENCES
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Fang JiaSong;Zhang Li;Wang FengPing
  • 通讯作者:
    Wang FengPing
Leeuwenhoekiella nanhaiensis sp nov., isolated from deep-sea water
Leeuwenhoekiella nanhaiensis sp nov.,从深海水中分离
  • DOI:
    10.1099/ijsem.0.000883
  • 发表时间:
    2016-03-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Liu, Qianfeng;Li, Jiangtao;Fang, Jiasong
  • 通讯作者:
    Fang, Jiasong

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海底CORK观测30年:发展、应用与展望
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    --
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  • 通讯作者:
    杨金龙
生长压力对Bacillus subtilis磷脂脂肪酸同位素分馏的影响
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    赵伟强;方家松;黄咸雨;张一鸣;王亚松;张利;李江燕
  • 通讯作者:
    李江燕
~(234)Th/~(238)U不平衡法及其在海洋颗粒物循环研究中的应用
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    方家松

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方家松的其他基金

评价嗜高压细菌在南海深部碳循环中的作用
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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