乙烯荷尔蒙诱导的与叶器官的细胞分裂分化相关的翻译后修饰(PTM)网络

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31570187
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0207.植物生殖与发育
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Ethylene is one of the most important plant hormones that regulate plant growth and development. It is actively involved in regulation of leaf organ formation, leaf growth, development and senescence. Ethylene has both stimulatory and inhibitory effects on cell division and expansion during shoot bending, flowering and leaf development. For example, a low dose of ethylene stimulates Arabidopsis growth and expansion while higher level inhibits its growth and development in ACC synthase-deletion or ethylene biosynthesis deficient (acs) line. To further elucidate the molecular mechanism underlying leaf organ development and cell cycle, division and expansion, our laboratory plan to utilize the acs mutant as the experimental material and study the ethylene-regulated post-translational modification (PTM) network and 26S proteasome-mediated protein degradation during leaf development using functional and quantitative PTM proteomics approach and to reveal the multiple and dual-and-opposing effects of ethylene on leaf cell division, differentiation and expansion and uncover the PTM network-mediated cell signaling in cell cycle and the key crosstalks between ethylene and cell cycle. We plan to adopt multiple steps to purify and use mass spectrometer to analyze a large quantity of phosphosites and proteasome-targeted proteins. In addition, we intend to study the biological functions of these newly identified phosphosites and proteasome-targeted protein in leaf cell division, differentiation and expansion. The outcomes of this investigation will be applied to molecular breeding, molecular designing and new cultivar generation of agricultural and forestry crops.
乙烯是调节植物生长发育的重要荷尔蒙之一,它积极参与影响叶器官萌出、生长、衰老等阶段。乙烯对茎弯曲、开花和叶片发育过程的细胞分裂和扩张有着正负两种调控作用,如低浓度乙烯促进乙烯生物合成缺陷突变体acs叶片扩张,而高浓度抑制其扩张。为进一步了解乙烯调控叶细胞分裂和扩张的机理,本项目将用拟南芥acs植株作材料,利用定量蛋白组学方法挖掘鉴定、配合生物学功能分析对乙烯调控的翻译后修饰(PTM)网络-磷酸化蛋白质组和蛋白降解组进行研究。采用多步纯化、质谱鉴定、定量分析来挖掘大量磷酸化位点与泛素修饰的目标蛋白,探索由乙烯诱导的磷酸化蛋白组与泛素-26S蛋白酶体介导的降解蛋白组在乙烯信号调控叶器官细胞分裂和扩张中的作用。揭示乙烯在植物叶器官细胞分裂和扩张中的多重和双互抗作用以及PTM网络所介导的信号通道是如何调控细胞周期中的重要节点。这一研究成果及研究方法将广泛服务于农林业分子育种,分子设计和新品种培育。

结项摘要

乙烯是调节植物生长发育的重要荷尔蒙之一,它积极参与影响叶器官萌出、生长、衰老等阶段。乙烯对茎弯曲、开花和叶片发育过程的细胞分裂和扩张有着正负两种调控作用,如低浓度乙烯促进乙烯生物合成缺陷突变体acs叶片扩张,而高浓度抑制其扩张。为进一步了解乙烯调控叶细胞分裂和扩张的机理,本项目将用拟南芥acs植株作材料,利用定量蛋白组学方法挖掘鉴定、配合生物学功能分析对乙烯调控的翻译后修饰(PTM)网络-磷酸化蛋白质组和蛋白降解组进行研究。探索由乙烯诱导的磷酸化蛋白组与泛素-26S 蛋白酶体介导的降解蛋白组在乙烯信号调控叶器官细胞分裂和扩张中的作用。揭示乙烯在植物叶器官细胞分裂和扩张中的多重和双互抗作用以及PTM网络所介导的信号通道是如何调控细胞周期中的重要节点。这一研究成果及研究方法将广泛服务于农林业分子育种,分子设计和新品种培育。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
In planta chemical cross-linking and mass spectrometry analysis of protein structure and interaction in Arabidopsis
拟南芥蛋白质结构和相互作用的植物化学交联和质谱分析
  • DOI:
    10.1002/pmic.201500310
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Proteomics
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Zhu Xinliang;Yu Fengchao;Yang Zhu;Liu Shichang;Dai Chen;Lu Xiaoyun;Liu Chenyu;Yu Weichuan;Li Ning
  • 通讯作者:
    Li Ning
Quantitative and Functional Phosphoproteomic Analysis Reveals that Ethylene Regulates Water Transport via the C-Terminal Phosphorylation of Aquaporin PIP2;1 in Arabidopsis
定量和功能磷酸化蛋白质组学分析揭示乙烯通过拟南芥中水通道蛋白 PIP2;1 的 C 端磷酸化调节水运输
  • DOI:
    10.1016/j.molp.2015.10.001
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Molecular Plant
  • 影响因子:
    27.5
  • 作者:
    QING DONGjin;Yang Zhu;Li Mingzhe;Wong Waishing;Guo Guangyu;Liu Shichang;Guo Honhwei;Li Ning
  • 通讯作者:
    Li Ning
Establishment of Dimethyl Labeling-based Quantitative Acetylproteomics in Arabidopsis
基于二甲基标记的拟南芥定量乙酰蛋白质组学的建立
  • DOI:
    10.1074/mcp.ra117.000530
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Molecular & Cellular Proteomics
  • 影响因子:
    7
  • 作者:
    Liu Shichang et al.;Li Ning
  • 通讯作者:
    Li Ning
Quantitative and functional posttranslational modification proteomics reveals that TREPH1 plays a role in plant touch-delayed bolting
定量和功能翻译后修饰蛋白质组学揭示 TREPH1 在植物接触延迟抽苔中发挥作用
  • DOI:
    10.1073/pnas.1814006115
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Wang Kai;Yang Zhu;Qing Dongjin;Ren Feng;Liu Shichang;Zheng Qingsong;Liu Jun;Zhang Weiping;Dai Chen;Wu Madeline;Chehab E Wassim;Braam Janet;Li Ning
  • 通讯作者:
    Li Ning
ECL: an exhaustive search tool for the identification of cross-linked peptides using whole database
ECL:使用整个数据库识别交联肽的详尽搜索工具
  • DOI:
    10.1186/s12859-016-1073-y
  • 发表时间:
    2016-05-20
  • 期刊:
    Bmc Bioinformatics
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Yu F;Li N;Yu W
  • 通讯作者:
    Yu W

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    黄健萌;陈晶晶;李凝
  • 通讯作者:
    李凝

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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