组合VB/EFP方法研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    21003101
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    苏培峰
  • 依托单位：
    厦门大学
  • 学科分类：
    B0301.化学理论与方法
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

本项目拟应用有效片段势方法(EFP)开展凝聚相体系的价键理论计算新方法研究，发展从头计算水平的组合VB/EFP计算方法。作为组合QM/MM方法，VB/EFP方法将研究体系分为两部分，体系的活性部分或溶质分子采用价键方法计算，而惰性部分或溶剂环境采用EFP方法处理。该方法将分别结合不同计算级别的价键方法和EFP方法，发展不同计算等级的组合VB/EFP方法，包括VBSCF/EFP1，VBSCF/EFP2，DFVB/EFP1和DFVB/EFP2. 在VB/EFP方法的基础上，进一步结合PCM方法，发展组合VB/EFP/PCM方法，处理更大的研究体系。基于VB/EFP和VB/EFP/PCM，我们将开展一系列显含溶剂分子的化学反应，以及氨基酸、多肽等生物体系参与的重要生化反应的从头算价键研究。组合VB/EFP方法将进一步丰富凝聚相体系的价键计算方法，扩展价键理论方法的应用范围。

结项摘要

本项目致力于开展凝聚相体系的价键理论计算新方法研究，发展从头计算水平的组合VB/EFP 计算方法。自2011年实施以来，要研究内容包括理论计算方法研究和应用研究两部分。该项目的进行发展沿着两条路线：1. 扩大研究体系；2. 提高计算精度。在理论计算方法研究中，先后提出了密度泛函价键（DFVB）方法，组合VB-EFP方法，并实现了VB-EFP/PCM组合计算；应用计算包括甲醛和丙酮分子溶剂位移的VB-EFP/PCM计算研究, C2 分子化学键本质的研究等。.除此以外，我们还开展了溶剂环境中能量分解方法EDA-PCM的研究。

项目成果

期刊论文数量（8）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Ab initio nonorthogonal valence bond methods
从头算非正交价键方法
  • DOI：
    10.1002/wcms.1105
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Wiley Interdisciplinary Reviews-Computational Molecular Science
  • 影响因子：
    11.4
  • 作者：
    Su, Peifeng;Wu, Wei
  • 通讯作者：
    Wu, Wei
理论与计算化学研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    厦门大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    苏培峰;谭凯;吴安安;吕鑫;赵仪;曹泽星;吴玮
  • 通讯作者：
    吴玮
Ab Initio Computational Method for Classical Valence Bond Theory
经典价键理论的从头计算方法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012-06
  • 期刊：
    Progress in Chemistry
  • 影响因子：
    1.3
  • 作者：
    Su Peifeng;Wu Wei
  • 通讯作者：
    Wu Wei

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其他文献

具有SIFT描述的多尺度角点图像配准
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    计算机工程与科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    苏培峰;黄世奇;王艺婷;刘代志
  • 通讯作者：
    刘代志
Measurement and study on scattering characteristics of ground objects with multi-bands and full polarization
多波段全偏振地物散射特性测量与研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    Journal of the Balkan Tribological Association
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    黄世奇;刘志刚;王艺婷;苏培峰
  • 通讯作者：
    苏培峰
用图像矩特征描述的SIFT特征SAR图像配准
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    电光与控制
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    苏培峰;黄世奇;王艺婷;刘代志
  • 通讯作者：
    刘代志

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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