基于单分子力谱方法研究病毒融合肽与脂膜相互作用的物理机制

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基本信息

  • 批准号:
    11074168
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    45.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A2013.软凝聚态与生物物理
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

针对一类病毒(如人流感病毒)侵染细胞的关键步骤:融合肽与细胞膜的结合与作用,本项目将应用单分子力谱方法(微吸管皮牛测力系统和平行大通量高灵敏磁场力系统),通过调节外力和溶液环境等条件,对此类病毒融合肽在脂膜中的寿命进行单分子测量。而融合肽在外力下的寿命是直接揭示形成融合孔的必要条件,这也是迄今尚未完全解答的基本问题。通过时间分辨的动态过程研究融合肽与脂膜相互作用的能量图谱,并结合分子动力学模拟阐述融合肽导致病毒与胞膜融合(病毒感染的关键步骤)的物理机制。本项目将系统合成一系列相关病毒融合肽(流感、SARS和HIV等病毒及序列突变),在单分子层面揭示其与脂膜作用的热力学性质及动力学过程。新发展的平行大通量磁力系统具有皮牛的灵敏度,能够同时对大量非同步随机过程进行定量测量,是适用于不可逆单分子实验的新方法。既是完成本项目的重要工具,也是对单分子力谱方法的重要延伸,可用于多种分子的相互作用研究。

结项摘要

本课题针对病毒融合肽与宿主细胞膜相互作用这一病毒侵染细胞的关键动力学过程展开了相关的单分子力学研究。我们首先适用于单分子研究的融合肽与磷脂膜相互作用的样品体系,我们(中空、玻璃)微球或玻片表面包裹上一层磷脂双分子层用来模拟细胞膜表面,将病毒融合肽插入磷脂膜中,一端连接于另一微球上,使用单分子力谱系统来测量融合肽在磷脂膜中的停留时间。同时,我们基于电子光学的原理研制了一种新型的电磁装置,该装置可以同时对大量磁性微球进行平行大通量单分子力学测量;通过使用一种简单的瞬时高压产生系统,该装置可以在5ms时间内,在直径1mm的范围内产生一个均匀的最大约20pN的作用力;我们进一步对该装置进行生物学应用验证,其可以同时拉伸多于50根单分子双链DNA,双链DNA长度与外力的对应关系与已有经典理论一致,从而验证了该装置的实验有效性。我们将新发展的平行大通量单分子力学测量系统应用于病毒融合肽与细胞膜相互作用研究中,测量了在不同恒定外力下流感病毒融合肽在磷脂双分子层中的停留时间。同时,我们使用微吸管系统测量了不同拉速下流感病毒融合肽与磷脂膜分离的作用力;并进一步改变环境pH,用微吸管系统分别测定pH 7.4与pH5.0下,不同拉速下融合肽与磷脂膜相互作用,通过数据分析得到了不同pH环境下融合肽离开细胞膜的能量景观。将上述实验结果与分子动力学模拟分析相结合,我们推测了融合肽在不同pH 值下的构象与其动力学稳定性的对应关系,在一定程度上阐明了病毒侵染细胞的物理学过程。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A Novel Electromagnetic Apparatus for Rapid Multiplex Single Molecule Force Spectroscopy
一种用于快速多重单分子力谱的新型电磁装置
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Journal of Nanoscience and Nanotechnology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Shen; Yi;Czajkowsky; Daniel M.;Li; Xiaowei;Sun; Jielin;Hu; Jun;Shao; Zhifeng
  • 通讯作者:
    Zhifeng
Bias controlled capacitive driven cantilever oscillation for high resolution dynamic force microscopy
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  • DOI:
    10.1063/1.4793205
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Applied Physics Letters
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Jinjin Zhang;Daniel M. Czajkowsky;Yi Shen;Jielin Sun;Chunhai Fan;Jun Hu;Zhifeng Shao
  • 通讯作者:
    Zhifeng Shao
裂殖酵母核心启动子结构的初步研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    核技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    侯婧逸;李华;康亚妮;孙洁林
  • 通讯作者:
    孙洁林
Enhanced PCR Amplification of GC-Rich DNA Templates by Gold Nanoparticles
金纳米颗粒增强了富含 GC 的 DNA 模板的 PCR 扩增
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    ACS Applied Materials & Interfaces
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wenchao Yang;Xinhui Li;Jielin Sun;Zhifeng Shao
  • 通讯作者:
    Zhifeng Shao
Self-Assembling Organic Nanotubes with Precisely Defined, Sub-nanometer Pores: Formation and Mass Transport Characteristics
具有精确定义的亚纳米孔的自组装有机纳米管:形成和传质特性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Accounts of Chemical Research
  • 影响因子:
    18.3
  • 作者:
    Bing Gong;Zhifeng Shao
  • 通讯作者:
    Zhifeng Shao

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其他文献

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裂殖酵母核心启动子结构的初步研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    核技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    侯婧逸;李华;康亚妮;孙洁林
  • 通讯作者:
    孙洁林
基于原子力显微镜的单个DNA分子
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    邵志峰

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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