图像处理技术应用于自动化DNA分子手术过程的探索研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    60575029
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    26.0万
  • 负责人：
    孙洁林
  • 依托单位：
    上海交通大学
  • 学科分类：
    F0604.机器感知与机器视觉
  • 结题年份：
    2008
  • 批准年份：
    2005
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2006-01-01 至2008-12-31

项目摘要

"DNA分子手术"将在诸如基因导入、辅助基因测序、单分子SNP检测、DNA的复制与转录机制、单分子DNA计算、临床组织切片原位病理分析等方面产生重要突破。本项目申请人所在实验室在国际上较早开始了DNA分子手术的研究，并已经取得了突破性的进展。但是要想真正获得在生物医学领域中的实际应用，就必须实现分子手术的自动化。本项目将图像处理方法应用于自动化DNA分子手术的研究内容包括：采用基于标记点图像配准方法对分子手术过程的非线性热漂移进行自适应补偿；利用图像分割方法以及非刚性图像配准方法重构DNA分子的弹性性质图像；结合图像处理方法建立一套量化的阈值可控的指标体系用于自动识别和统计分析等，同时采用软硬件结合的方法，实现与系统软件的无缝连接。本项目将有助于解决分子手术实用化所面临的一些基本问题以及尽早实现分子手术的自动化。本项目的开展也将为图像处理技术开辟一个新的应用领域。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（2）
专利数量（0）
单个黄原胶分子的样品制备与原子力显微镜检测
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    核技术，2008，Vol.31(12), P951-954
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Study of Radial Compression Elasticity of Single Xanthan Molecules by Vibrating Scanning Polarization Force Microscopy
振动扫描偏振力显微镜研究黄原胶单个分子的径向压缩弹性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Characterizing AFM tip shape in use
表征使用中的 AFM 尖端形状
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Effect of Substrate Hydrophobicity / Hydrophilicity on Height Measurement of Individual DNA Molecules
基质疏水性/亲水性对单个 DNA 分子高度测量的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Geometric Characterization of Carbon Nanotubes by Atomic Force Microscopy in Conjunction with a Tip Characterizer
通过原子力显微镜结合尖端表征仪对碳纳米管进行几何表征
  • DOI：
    10.1143/jjap.47.6128
  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 作者：
  • 通讯作者：

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其他文献

基于原子力显微镜技术的单个生物
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
    电子显微学报，2005，24(3)，P238-242
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    周星飞;孙洁林;米丽娟;王化斌
  • 通讯作者：
    王化斌
基于原子力显微镜抬高模式的DNA
  • DOI：
    10.1111/gcb.12335
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    科学通报，2004，49（15）：1491-1494
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭云昌;周星飞;孙洁林;李民乾
  • 通讯作者：
    李民乾
单分子中心定位精度与信噪比关系及中心定位算法改进研究
  • DOI：
    10.1371/journal.pgen.1002997
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    电子显微学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    翟人宽;李小卫;孙洁林;邵志峰
  • 通讯作者：
    邵志峰
裂殖酵母核心启动子结构的初步研究
  • DOI：
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  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    核技术
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    侯婧逸;李华;康亚妮;孙洁林
  • 通讯作者：
    孙洁林
舌鳞癌切片的原子力显微镜纳米操
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中华医学杂志，2006; 86(8)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李鑫辉;孙洁林;季彤*
  • 通讯作者：
    季彤*

其他文献

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孙洁林的其他基金

基于FM NC-AFM方法对溶液中生物分子实现亚纳米级高分辨成像的机理研究
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    青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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