DNA与解旋酶RecQ的相互作用动力学研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    10674173
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    38.0万
  • 负责人：
    王鹏业
  • 依托单位：
    中国科学院物理研究所
  • 学科分类：
    A2014.凝聚态物理新兴与交叉领域
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2006
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

解旋酶是一种生物分子马达，利用水解ATP的能量将DNA解旋。在生命过程中起重要作用，并且与人类一些重大疾病密切相关，例如癌症、早老症等。我们将在已有的研究基础上，深入开展DNA与解旋酶RecQ的相互作用动力学研究。揭示解旋酶的作用机制、解旋过程动力学、四级结构的影响等。我们采用的研究手段包括软物质物理实验室已经建立的单分子荧光显微技术、Stopped-flow快速反应动力学系统、原子力显微镜(AFM)以及正在计划建立的单分子荧光共振能量转移(FRET)技术。利用这些现代物理学及化学技术，我们将系统测量RecQ与DNA的相互作用时间，RecQ在对DNA的解旋过程中取向的变化，RecQ的解旋速度，RecQ水解ATP的时间过程等。还将结合生物技术定量观察和测量点突变、溶液环境等对这些动力学过程的影响。从而在分子的层次上定量分析和了解DNA与解旋酶的微观相互作用机理。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（9）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
The zinc-binding motif of human RECQ5 beta suppresses the intrinsic strand-annealing activity of its DExH helicase domain and is essential for the helicase activity of the enzyme
人 RECQ5 beta 的锌结合基序抑制其 DExH 解旋酶结构域的内在链退火活性，并且对该酶的解旋酶活性至关重要
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Biochemical Journal
  • 影响因子：
    4.1
  • 作者：
    Liu, Jie-Iin;Wang, Peng-Ye;Hu, Jin-Shan;Ren, Hua;Zhang, Xing-Dong;Janscak, Pavel;Xi, Xu Guang;Dou, Shuo-Xing;Kanagaraj, Radhakrishnan
  • 通讯作者：
    Kanagaraj, Radhakrishnan
The arginine finger of the Bloom syndrome protein: its structural organization and its role in energy coupling.
布卢姆综合征蛋白的精氨酸指：其结构组织及其在能量耦合中的作用
  • DOI：
    10.1093/nar/gkm544
  • 发表时间：
    2007
  • 期刊：
    Nucleic acids research
  • 影响因子：
    14.9
  • 作者：
    Ren H;Dou SX;Rigolet P;Yang Y;Wang PY;Amor-Gueret M;Xi XG
  • 通讯作者：
    Xi XG
生物软物质研究的新进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    物理
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王鹏业;李明;翁羽翔
  • 通讯作者：
    翁羽翔
Evidence for a functional dimeric form of the PcrA helicase in DNA unwinding.
DNA 解旋中 PcrA 解旋酶功能性二聚体形式的证据
  • DOI：
    10.1093/nar/gkm1174
  • 发表时间：
    2008-04
  • 期刊：
    Nucleic acids research
  • 影响因子：
    14.9
  • 作者：
    Yang Y;Dou SX;Ren H;Wang PY;Zhang XD;Qian M;Pan BY;Xi XG
  • 通讯作者：
    Xi XG
Formation of DNA toroids inside confined droplets adsorbed on mica surfaces
在云母表面吸附的受限液滴内形成 DNA 环形线圈
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Physical Review E
  • 影响因子：
    2.4
  • 作者：
    Hou, Xi-Miao;Li, Wei;Zhang, Ling-Yun;Xie, Ping;Wang, Peng-Ye;Dou, Shuo-Xing;Wang, Wei-Chi
  • 通讯作者：
    Wang, Wei-Chi

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  • 作者：
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  • 通讯作者：
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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