新型深海弹性蛋白酶Pseudoalterin对弹性蛋白的降解机制和适冷机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31000034
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

深海沉积物难降解颗粒有机氮(PON)和高分子量可溶有机氮(DON)多数可以被微生物分泌的特异高效蛋白酶降解,但是对于参与其中的微生物种类、蛋白酶种类和降解机制目前并不清楚。弹性蛋白可能是深海沉积物PON和高分子量DON的重要成分。我们从中国南海深海沉积物菌株的胞外分离了一种M23家族的新型弹性蛋白酶Pseudoalterin。该酶是目前报道的第二个深海沉积物来源的弹性蛋白酶。前期研究显示,它与已报道的第一个深海沉积物弹性蛋白酶对弹性蛋白的降解机制明显不同。本项目在系统研究该酶基本生化和酶学性质基础上,进一步使用扫描电镜(SEM)和原子力显微镜(AFM)技术在纳米水平上研究该酶对弹性蛋白的降解机制,同时开展不同弹性蛋白酶对弹性蛋白协同降解的研究和该酶适冷机制的研究。本项目将为揭示深海沉积物中难降解PON和高分子量DON中的弹性蛋白的降解机制以及阐明深海氮循环的机理奠定基础。

结项摘要

深海沉积物中难降解颗粒有机氮(PON)和高分子量可溶有机氮(DON)多数可以被微生物分泌的特异高效蛋白酶降解,但是对于参与其中的微生物种类、蛋白酶种类和降解机制目前并不清楚。弹性蛋白可能是深海沉积物PON 和高分子量DON 的重要成分。我们从中国南海深海沉积物菌株的胞外分离了一种M23 家族的新型弹性蛋白酶Pseudoalterin。该酶是目前报道的第二个深海沉积物来源的弹性蛋白酶。前期研究显示,它与已报道的第一个深海沉积物弹性蛋白酶对弹性蛋白的降解机制明显不同。本项目研究表明Pseudoalterin是一个适冷碱性蛋白酶,其最适酶活温度为25°C,与其来自深海相一致,最适pH为pH9.5,与其来源自海洋环境相一致。综合光学显微镜、扫描电镜、质谱等多种技术手段的研究结果,提出了该酶降解弹性蛋白的机制模型。弹性蛋白由丝状纤维通过相互交联形成,使用Pseudoalterin处理后,该酶优先降解丝状纤维之间的亲水交联区,使弹性蛋白变成分散的丝状纤维;随着降解时间的延长,丝状纤维进一步被将解为小球,最后释放出弹性蛋白原单体并进一步降解为可溶的肽段。对弹性蛋白酶Myroilysin和Pseudolysin降解弹性蛋白的机制进行了比较研究,结果表明,三个弹性蛋白酶由于底物偏好性的不同,导致对弹性蛋白不同位点降解的顺序不同,形成了对弹性蛋白不同的降解模式。此外,本项目对Pseudoalterin进行了结晶并解析了晶体结构。本项目为揭示深海沉积物中难降解的弹性蛋白的降解机制以及阐明深海氮循环的机理奠定基础。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genome Sequences of Type Strains of Seven Species of the Marine Bacterium Pseudoalteromonas
七种海洋假交替单胞菌典型菌株基因组序列
  • DOI:
    10.1128/jb.00265-12
  • 发表时间:
    2012-05-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF BACTERIOLOGY
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Xie, Bin-Bin;Shu, Yan-Li;Zhang, Yu-Zhong
  • 通讯作者:
    Zhang, Yu-Zhong
Elastolytic Mechanism of a Novel M23 Metalloprotease Pseudoalterin from Deep-sea Pseudoalteromonas sp CF6-2 CLEAVING NOT ONLY GLYCYL BONDS IN THE HYDROPHOBIC REGIONS BUT ALSO PEPTIDE BONDS IN THE HYDROPHILIC REGIONS INVOLVED IN CROSS-LINKING
来自深海假交替单胞菌的新型 M23 金属蛋白酶假交替蛋白的弹力分解机制。
  • DOI:
    10.1074/jbc.m112.405076
  • 发表时间:
    2012-11-16
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Zhao, Hui-Lin;Chen, Xiu-Lan;Zhang, Yu-Zhong
  • 通讯作者:
    Zhang, Yu-Zhong

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

其他文献

Algimonas arctica sp. nov., isolated from intertidal sand, and emended description of the genus Algimonas
北极藻单胞菌 sp.
  • DOI:
    10.1099/ijsem.0.000402
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    刘畅;张熙颖;宋晓妍;苏海楠;秦启龙;解彬彬;陈秀兰;张玉忠;石梅
  • 通讯作者:
    石梅

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败,请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题,我已根据课题信息分析并撰写以下内容,帮您拓宽课题思路:

AI项目思路

AI技术路线图

解彬彬的其他基金

假交替单胞菌多糖利用能力的分化及其基因组基础
  • 批准号:
    31770412
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    56.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
北极海冰假交替单胞菌属细菌的多样性、系统分类及生态适应的遗传与生理基础
  • 批准号:
    31470001
  • 批准年份:
    2014
  • 资助金额:
    30.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
关闭
close
客服二维码