基于复杂网络的B细胞表位预测新方法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30600138
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1005.生物成像、电子与探针
  • 结题年份:
    2009
  • 批准年份:
    2006
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

B细胞表位是抗原中能被抗体特异性识别的线性片段或空间构象性结构,是体液免疫的基础。确定B细胞表位对疾病预防、诊断、治疗意义重大。本项目的基本思路是将蛋白质抗原看作复杂网络,节点是氨基酸残基,边是氨基酸残基之间在序列或空间结构上的相邻关系。因此,B细胞表位可以看作是抗原这个"大图"里的一些特定子图;线性和非线性B细胞表位的预测问题被统一为从大图中搜寻特定子图的过程。本项目将在我们已有的前期工作基础上

结项摘要

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(7)
专利数量(0)
CED: a conformational epitope database.
CED:构象表位数据库
  • DOI:
    10.1186/1471-2172-7-7
  • 发表时间:
    2006-04-07
  • 期刊:
    BMC IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Huang, Jian;Honda, Wataru
  • 通讯作者:
    Honda, Wataru
MIMOX: a web tool for phage display based epitope mapping.
MIMOX:基于噬菌体展示的表位作图网络工具
  • DOI:
    10.1186/1471-2105-7-451
  • 发表时间:
    2006-10-12
  • 期刊:
    BMC BIOINFORMATICS
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Huang, Jian;Gutteridge, Alex;Honda, Wataru;Kanehisa, Minoru
  • 通讯作者:
    Kanehisa, Minoru

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  • 作者:
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其他文献

水稻根系形态生理及其与稻米品质关系的研究进展
  • DOI:
    10.16035/j.issn.1001-7283.2020.02.001
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    作物杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱安;高捷;黄健;汪浩;陈云;刘立军
  • 通讯作者:
    刘立军
广西会仙湿地鱼类多样性
  • DOI:
    10.13248/j.cnki.wetlandsci.2017.02.014
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    湿地科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄健;胡祎祥;黄亮亮;吴志强;封文利;尹超;徐莉
  • 通讯作者:
    徐莉
稻田甲烷排放的微生物学机理及节水栽培对甲烷排放的影响
  • DOI:
    10.16819/j.1001-7216.2022.201202
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    中国水稻科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    余锋;李思宇;邱园园;卓鑫鑫;黄健;汪浩;朱安;刘昆;刘立军
  • 通讯作者:
    刘立军
Clonal chromosomal abnormalities in Philadelphia-negative cells in chronic myeloid leukemia patients treated with nilotinib used in first-line therapy
接受一线治疗的尼洛替尼治疗的慢性粒细胞白血病患者中费城阴性细胞的克隆染色体异常
  • DOI:
    10.1007/s00277-013-1816-z
  • 发表时间:
    2013-06
  • 期刊:
    Ann Hematol
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄健
  • 通讯作者:
    黄健
基于(100)定向金刚石薄膜的辐射探测器研究
  • DOI:
    10.3724/sp.j.1077.2009.01254
  • 发表时间:
    2009-11
  • 期刊:
    无机材料学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    夏义本;王林军;徐闰;史伟民;沈沪江;黄健
  • 通讯作者:
    黄健

其他文献

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    青年科学基金项目
模拟肽的生物信息处理与分析新方法研究
  • 批准号:
    61071177
  • 批准年份:
    2010
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
    面上项目

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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