聚缩虫科原生动物的分类学及系统发育研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31772413
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

This project is mainly focused on taxonomy and phylogeny of family Zoothamnidae (Protista, Ciliophora), which will be carried out by standard morphological and taxonomic research methods (in vivo observation and silver staining), with ecological and molecular biological research techniques. The research will include study of species and ecological diversity, experimental ecology, and multiple gene sequencing/analysis. Besides improving our knowledge of this family, the project aims also to discuss and figure out its exact phylogenetic pattern, the evolution order of morphological characters and their weights on species identification and phylogenetic study.
本课题选取聚缩虫科作为研究对象,以形态分类学标准研究方法(显微活体观察结合各类银染方法)为基础,结合生态、分子生物学研究手段,从聚缩虫科的形态与物种多样性、生态多样性、实验生态学、及多基因测序分析等方面进行针对性研究,在丰富对该类群生物基本认知的同时,期望通过形态学特征与分子信息的相互比对印证,进一步确认该科的系统发育模式,并探讨各分类学特征的分化次序及其在该类生物鉴定和系统发育分析中的权重。

结项摘要

本研究自2018年1月至2021年12月结束,主要内容为利用形态学与分子生物学技术结合的整合分类学方法, 对以聚缩虫科纤毛虫进行广泛采集、分离观察、形态信息及分子序列信息获取、物种鉴定以及该类群的系统发育分析。主要成果包括:1)共采集并鉴定以聚缩虫为核心的固着目缘毛类纤毛虫34种,其他伴生纤毛虫类49种,其中包含新种7个,新组合1个,恢复遗忘属1个; 2)获得具有对应形态学信息的SSU、LSU及ITS1-5.8S-ITS2等rDNA序列信息共120余条,并通过多基因联合分析及二级结构相似性比对,深入探讨并确立了聚缩虫科的系统发育模式以及与累枝虫科的进化关系;3)对纤毛虫分类学研究的关键性方法—蛋白银染色进行了完善,提高了成功率与染色效果; 4)对莱州湾近岸周丛生及底栖纤毛虫多样性进行了周期性调查,积累了一批原创性信息资料,为今后进一步深入研究打下了基础。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Phylogeny of the families Zoothamniidae and Epistylididae (Protozoa: Ciliophora: Peritrichia) based on analyses of three rRNA-coding regions
基于三个 rRNA 编码区分析的 Zoothamniidae 和 Episylididae 科(原生动物:纤毛纲:Peritrichia)的系统发育
  • DOI:
    10.1016/j.ympev.2017.09.023
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Molecular Phylogenetics and Evolution
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Zhuang Yuan;Clamp John C.;Yi Zhenzhen;Ji Daode
  • 通讯作者:
    Ji Daode
Novel contributions to the peritrich family Vaginicolidae (Protista: Ciliophora), with morphological and phylogenetic analyses of poorly known species of Pyxicola, Cothurnia and Vaginicola
对周毛科 Vaginicolidae(原生生物:Ciliophora)的新贡献,对鲜为人知的 Pyxicola、Cothurnia 和 Vaginicola 物种进行形态学和系统发育分析
  • DOI:
    10.1093/zoolinnean/zlz009
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Zoological Journal of the Linnean Society
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Lu Borong;Li Lifang;Hu Xiaozhong;Ji Daode;Al Rasheid Khaled A S;Song Weibo
  • 通讯作者:
    Song Weibo
New discoveries of the genus Thuricola Kent, 1881 (Ciliophora, Peritrichia, Vaginicolidae), with descriptions of three poorly known species from China
Thuricola Kent 属的新发现,1881 年(Ciliophora、Peritrichia、Vaginicolidae),以及来自中国的三个鲜为人知的物种的描述
  • DOI:
    10.4467/16890027ap.18.011.8985
  • 发表时间:
    2018-12
  • 期刊:
    Acta Protozoologica
  • 影响因子:
    0.5
  • 作者:
    Borong Lu;Daode Ji;Yalan Sheng;Weibo Song;Xiaozhong Hu;Xiangrui Chen;Al-Rasheid A. S. Khaled
  • 通讯作者:
    Al-Rasheid A. S. Khaled
Morphological and Molecular Identification of a New Ciliate, Zoothamnium palmphlatum nov. spec. (Ciliophora, Peritrichia) from North China
新纤毛虫Zoothamnium palmphlatum nov的形态学和分子鉴定。
  • DOI:
    10.1111/jeu.12713
  • 发表时间:
    2019-02
  • 期刊:
    Journal of Eukaryotic Microbiology
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Wang Xueyan;Ji Daode
  • 通讯作者:
    Ji Daode
Morphology and phylogeny of four new vorticella species (Ciliophora: Peritrichia) from coastal waters of Southern China
中国南方沿海涡藻属四种新种(纤毛纲:周毛纲)的形态和系统发育
  • DOI:
    10.1111/jeu.12668
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Journal of Eukaryotic Microbiology
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Ziyao Liang;Zhuo Shen;Yong Zhang;Daode Ji;Jiqiu Li;Alan Warren;Xiaofeng Lin
  • 通讯作者:
    Xiaofeng Lin

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其他文献

青岛沿海的自由生聚缩虫属纤毛虫(原生动物,纤毛门,缘毛目)
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    计算机工程
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    季道德;宋微波
  • 通讯作者:
    宋微波
莱州湾近岸海域浮游纤毛虫群落组成和季节变化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    海洋与湖沼
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李雯璐;徐大鹏;季道德
  • 通讯作者:
    季道德
Taxonomic Characterization of Three Marine Peritrichous Ciliates from China: Zoothamnium alrasheidi spec. nov., Z. marinum Kahl, 1933 and Z. vermicola Precht, 1935 (Ciliophora: Peritrichia)
中国三种海洋周毛纤毛虫的分类学特征:Zoothamnium alrasheidispec.
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2009-04
  • 期刊:
    Acta Protozoologica
  • 影响因子:
    0.5
  • 作者:
    季道德
  • 通讯作者:
    季道德

其他文献

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季道德的其他基金

黄河等径流影响下南渤海纤毛门原生动物物种多样性研究
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    2023
  • 资助金额:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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