鼻咽癌中p53靶分子miR-34s的分子网络研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30973289
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    31.0万
  • 负责人：
    陈主初
  • 依托单位：
    中南大学
  • 学科分类：
    H1824.肿瘤大数据与人工智能
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

60-80%以上的鼻咽癌组织和几乎100%的鼻咽癌细胞株有p53蛋白过表达或聚集现象。在鼻咽癌中p53蛋白未突变、高表达但未起到抑癌作用。miR-34s是p53的直接靶标，具有调控细胞增殖和凋亡的功能。项目拟以鼻咽癌中miR-34s作为目标靶，采用定量蛋白质组学方法，结合全基因组表达谱芯片和生物信息学技术分离、鉴定p53蛋白的高表达时miR-34s的靶蛋白；利用CHIP、CO-IP寻找与p53蛋白DNA结合区域的miR-34s靶蛋白及相互作用蛋白，用RNAi技术分别剔除鼻咽癌细胞中miR-34s靶蛋白和p53蛋白的表达，发现miR-34s靶蛋白在p53信号通路中作用。进一步研究miR- 34s靶蛋白、p53蛋白与鼻咽癌临床特征之间的关系。项目研究结果不仅有助于揭示鼻咽癌细胞中p53蛋白功能失活的分子机理，而且为阐明p53蛋白在鼻咽癌发病中的作用提供依据和新线索，具有重要的理论和实际意义。

结项摘要

MicroRNAs（miRNAs）是长度在20-23个核苷酸左右的内源性非编码小分子RNA，具有转录后基因调控功能。鼻咽癌（nasopharyngeal carcinoma，NPC）是我国南方及东南亚常见的一种恶性肿瘤，具有高的侵袭和转移恶性。60-80%以上的NPC组织和几乎100%的NPC细胞株有p53蛋白过表达。本研究首先用生物信息学分析了24个与鼻咽癌相关microRNAs，分子网络涉及到肿瘤、内分泌紊乱、胃肠道疾病、生殖系统疾病、肝脏系统疾病、结缔组织紊乱和炎症疾病等通路。鼻咽癌中p53的靶分子miR-34c在鼻咽癌细胞中表达，构建高表达miR-34c载体转染鼻咽癌细胞，与对照组进行定量蛋白质组学分析，差异蛋白质102个，50个蛋白下调，52个上调，对这些分子进行网络分析，发现涉及糖原异生I、蛋白质泛素化通路、糖酵解I、非同源末端连接的DNA双链断裂修复、转录因子NRF-2介导的氧化性应激、端粒酶协助下的端粒延伸、网格蛋白介导的胞吞信号途径、外源性凝血酶原激活通路、心血管系统缺氧信号通路等通路。

项目成果

期刊论文数量（6）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（3）
专利数量（0）
ZNF403, a Novel Cell Cycle Regulator
ZNF403，一种新型细胞周期调节剂
  • DOI：
    10.3724/sp.j.1206.2012.00119
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    生物化学与生物物理进展
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    关瑞;侯德富;饶翔;关勇军;欧阳咏梅;余艳辉;JimHU;陈主初
  • 通讯作者：
    陈主初
Periostin, a stroma-associated protein, correlates with tumor invasiveness and progression in nasopharyngeal carcinoma
骨膜素是一种基质相关蛋白，与鼻咽癌的肿瘤侵袭性和进展相关
  • DOI：
    10.1007/s10585-012-9465-5
  • 发表时间：
    2012-12-01
  • 期刊：
    CLINICAL & EXPERIMENTAL METASTASIS
  • 影响因子：
    4
  • 作者：
    Li, Meixiang;Li, Cui;Chen, Zhuchu
  • 通讯作者：
    Chen, Zhuchu
Cancer: A proteomic disease
癌症：一种蛋白质组疾病
  • DOI：
    10.1007/s11427-011-4163-0
  • 发表时间：
    2011-05-01
  • 期刊：
    SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES
  • 影响因子：
    9.1
  • 作者：
    Li GuoQing，Guo Qing;Xiao ZheFeng，Zhefeng;Chen ZhuChu，Zhuchu
  • 通讯作者：
    Chen ZhuChu，Zhuchu
Mitochondrial proteomics of nasopharyngeal carcinoma metastasis.
鼻咽癌转移的线粒体蛋白质组学
  • DOI：
    10.1186/1755-8794-5-62
  • 发表时间：
    2012-12-06
  • 期刊：
    BMC medical genomics
  • 影响因子：
    2.7
  • 作者：
    Liu J;Zhan X;Li M;Li G;Zhang P;Xiao Z;Shao M;Peng F;Hu R;Chen Z
  • 通讯作者：
    Chen Z
Quantitative Proteomic Analysis of Formalin-fixed and Paraffin-embedded Nasopharyngeal Carcinoma Using iTRAQ Labeling, Two-dimensional Liquid Chromatography, and Tandem Mass Spectrometry
使用 iTRAQ 标记、二维液相色谱和串联质谱法对福尔马林固定和石蜡包埋的鼻咽癌进行定量蛋白质组学分析
  • DOI：
    10.1369/jhc.2010.955526
  • 发表时间：
    2010-06-01
  • 期刊：
    JOURNAL OF HISTOCHEMISTRY & CYTOCHEMISTRY
  • 影响因子：
    3.2
  • 作者：
    Xiao, Zhefeng;Li, Guoqing;Chen, Zhuchu
  • 通讯作者：
    Chen, Zhuchu

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其他文献

TGF-α对鼻咽癌CNE2细胞作用的蛋白质组学分析
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
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磷酸化蛋白质组学方法在信号网络解析中的应用
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    陈主初
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  • 期刊：
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  • 影响因子：
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  • 通讯作者：
    肖志强
NR4A1 DNA 结合域的表达纯化
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  • 期刊：
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    陈小娟;陈永恒;陈林;陈主初
  • 通讯作者：
    陈主初
应用LCM和蛋白质组学技术筛选肺腺癌的差异表达蛋白质
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  • 发表时间：
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  • 作者：
    代书炎;李茂玉;李育;覃婉元;梅城;付莹;陈永恒;陈主初;彭芳
  • 通讯作者：
    彭芳

其他文献

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鼻咽癌中P53复合体的结构与功能研究
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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