脊椎动物神经后部化过程中染色质重塑蛋白BPTF调控核小体定位的机制及功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91519329
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    75.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0603.表观遗传调控
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2016-12-31

项目摘要

The chromatin remodeling protein BPTF (Bromodomain PHD-finger Transcription Factor) is proviously identified by us as a Smad2 binding protein. BPTF, the largest NURF subunit, recruits NURF complex to specific DNA squence by binding with other transcription factors and then regulates gene expression by remodeling nucleosome sliding. During vertebrate gastrulation, “posteriorizing” signal from the ventral mesoderm converts already neuralized tissue to more posterior neural tissues. We find that, in zebrafish embryos, bptf plays crucial roles during the patterning of the anterior vs. the posterior neuroectoderm. Bptf and TGF-β/Smad2 mediate nucleosome remodeling to regulate wnt8a expression and hence neural posteriorization. However, little is known about the genome-wide remodeling of nucleosome positions mediated by BPTF during neural ectodermal posteriorization. Furthermore, whether Bptf functionally and physically interacts with other transcription factors to regulate nucleosome remodeling also remains unknown. Our project will elucidate the molecular mechanism of BPTF-mediated dynamic changes of chromatin higher-order structure in neural ectodermal posteriorization.
染色质重塑蛋白BPTF是核小体重塑因子复合体(NURF)最大的亚基,通过与其它转录因子结合,将NURF招募到启动子区,调控核小体定位促进基因表达,但其在胚胎发育中的功能所知甚少。在脊椎动物原肠期,来自于腹侧中胚层的信号分子会促进神经外胚层分化为前部神经和后部神经组织。初步研究表明,BPTF及其介导的染色体重塑在前后神经图式形成中有重要作用。Smad2/3通过与染色质重塑蛋白BPTF协同作用,改变靶基因wnt8a启动子区核小体密度,增强wnt8a转录,促进神经外胚层后部化。但是,神经外胚层后部化过程中BPTF所介导的全基因组水平核小体位置具有怎样的动态变化?BPTF还可以与哪些转录因子相互作用影响染色质重塑?这些重要的问题均有待回答。本项目将围绕这些明确的科学问题,阐明脊椎动物神经后部化过程中BPTF调控染色质重塑的功能及分子机制。

结项摘要

染色质重塑蛋白BPTF是核小体重塑因子复合体(NURF)最大的亚基,通过与其它转录因子结合,将NURF招募到启动子区,调控核小体定位促进基因表达,但其在胚胎发育中的功能所知甚少。我们以前的研究结果表明,BPTF及其介导的染色体重塑在前后神经图式形成中有重要作用。Smad2/3通过与染色质重塑蛋白BPTF协同作用,改变靶基因wnt8a启动子区核小体密度,增强wnt8a转录,促进神经外胚层后部化。本项目的主要研究目标是探讨神经后部化过程中BPTF调控染色质重塑的功能及分子机制。但是,在研究过程中,我们发现BPTF在中枢神经诱导过程中发挥了更加重要的作用,而且这种作用是通过调控母源的Wnt信号通路发生的。BPTF调控Wnt信号的分子机制还在更进一步的研究过程中。另外,我们通过TALENs技术制备了BPTF的突变体,但其纯合突变体正在筛选过程中。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Fscn1 is required for the trafficking of TGF-beta family type I receptors during endoderm formation.
内胚层形成过程中 TGF-β 家族 I 型受体的运输需要 Fscn1。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Nat Commun
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Meng, Anming;Wang, Qiang;Wang, Qiang;Wang, Qiang
  • 通讯作者:
    Wang, Qiang
The guanine nucleotide exchange factor Net1 facilitates the specification of dorsal cell fates in zebrafish embryos by promoting maternal beta-catenin activation.
鸟嘌呤核苷酸交换因子 Net1 通过促进母体 β-连环蛋白激活,促进斑马鱼胚胎背细胞命运的规范。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Cell Res
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Cao, Yu;Wang, Qiang;Wang, Qiang;Wang, Qiang
  • 通讯作者:
    Wang, Qiang
The coiled-coil domain containing protein Ccdc136b antagonizes maternal Wnt/beta-catenin activity during zebrafish dorsoventral axial patterning.
含有卷曲螺旋结构域的蛋白质 Ccdc136b 在斑马鱼背腹轴向模式形成过程中拮抗母体 Wnt/β-catenin 活性。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    J Genet Genomics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Cao, Yu;Wang, Qiang;Wang, Qiang;Wang, Qiang
  • 通讯作者:
    Wang, Qiang

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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