Fan-miR73靶向作用ABI5转录因子调控草莓果实成熟的分子机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31772366
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1509.园艺作物采后生物学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31
  • 项目参与者:
    章华仙; 路洪艳; 李栋; 王迪; 王毅; 童志超; 蒋蕾;
  • 关键词:

项目摘要

ABA and its signal transduction are very important in regulating non-climacteric fruit ripening. MiRNAs were recently found to regulate fruit ripening by targeting components in ABA signaling pathway, however, transcription factors involved in the downstream of ABA signaling and feed-back regulatory mechanism have not been reported. This project which is based on the previous newly identified Fan-miR73 and its degradation effect on ABI5 mRNA will investigate the transcriptional levels of Fan-miR73 and ABI5 during wild strawberry (Fragaria vesca) fruit ripening, and it will also study the influences of over-expression or knock-out of Fan-miR73 or ABI5 on fruit ripening. We will explore the feed-back effect of ABI5 on Fan-miR73 by using methods of EMSA, yeast one-hybrid and ChIP-PCR. By taking advantages of ChIP-Seq and transcriptome technologies, we will further seek the downstream regulating genes of ABI5 transcription factor. The result may not only provide technical support for developing efficient preservation approaches for postharvest non-climacteric fruits, it will also illustrate the mechanism that how ABA signaling transduction regulates non-climacteric fruit ripening.
ABA及其信号传导调控非跃变型果实成熟是一个重要科学问题,近年来发现miRNA通过与ABA信号通路上元件互补调控参与果实成熟,ABA信号下游转录因子及其反馈调控模式的研究未见报道。本项目在前期新发现Fan-miR73及靶向作用ABI5转录因子的工作基础上,以二倍体草莓为研究对象,探究Fan-miR73和ABI5在草莓果实成熟期间的表达模式,明确Fan-miR73和ABI5过表达或敲除对果实成熟的影响。采用EMSA、酵母单杂和ChIP-PCR等分子生物学手段,解析ABI5转录因子对Fan-miR73的反馈调控机制。利用ChIP-Seq和转录组学技术,挖掘ABI5转录因子下游调控基因。从而揭示Fan-miR73靶向作用ABI5转录因子调控草莓果实成熟中的分子调控机制。研究结果不仅为开发草莓等非跃变型果实采后保鲜方法提供技术支撑,也为揭示ABA信号传导调控非跃变型果实成熟机制提供理论依据。

结项摘要

果实成熟衰老生物学机制是重要的科学问题。ABA信号如何响应采后非生物胁迫并调控果实营养与品质有待进一步研究。本课题以草莓ABA信号转导途径关键靶点FaABI5及其调控因子Fan_miR73为研究对象,开展了ABA信号转导关键靶点鉴定、FaABI5 过表达与下调对草莓果实成熟的影响、ABI5 转录因子下游调控基因研究等研究内容。研究发现非生物胁迫不仅调控ABA生物合成,同时对ABA信号转导产生影响,改变果实对ABA敏感性。利用转录组学删选到ABA信号转导途径中受非生物胁迫调控的65个潜在靶点,包括12个PYL家族基因,21个PP2C家族基因,13个SnAPK家族基因,6个SnRK2家族基因,10个ABF/AREB家族基因,以及3个未注释的novel genes。进一步研究确定了ABI5为其中的关键靶点。采用WGCNA分析鉴定得到FaABI5下游靶标基因FaFLS1,经酵母单杂及双荧光素酶实验明确了FaABI5对FaFLS1的转录激活作用。此外,研究还通过小RNA组学在草莓果实中鉴定了47个保守microRNA,其属于25类microRNA家族,以及28个新microRNA,并通过降解组测序鉴定了上述microRNA的降解靶标。其中Fan_miR73靶向降解FaABI5,在FaABI5响应ABA信号及UV-B、盐胁迫等非生物胁迫中作为关键因子发挥重要作用。通过以上研究系统性构建了“Fan-miR73_FaABI5-FaFLS1”的信号调控模块,揭示了草莓果实中“Abiotic stress→Fan-miR73→FaABI5→FaFLS1→Flavonoids”的信号传导模式。研究成果完善了草莓果实成熟衰老调控网络,为草莓等浆果果实的精准采后保鲜技术研发提供重要的理论依据。本课题研究成果在New Phytologist、Foood Chemistry、Journal of Agricultural and Food Chemistry、等国内外高水平刊物发表论文17篇,授权国家发明专利2件,培养博士研究生5名,硕士研究生1名。

项目成果

期刊论文数量(17)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Effects of elevated CO2 on energy metabolism and γ-aminobutyric acid shunt pathway in postharvest strawberry fruit
CO2升高对采后草莓果实能量代谢和γ-氨基丁酸分流途径的影响
  • DOI:
    10.1016/j.foodchem.2018.05.106
  • 发表时间:
    2018-11-01
  • 期刊:
    FOOD CHEMISTRY
  • 影响因子:
    8.8
  • 作者:
    Li, Dong;Li, Li;Luo, Zisheng
  • 通讯作者:
    Luo, Zisheng
植物中花色苷转运蛋白研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    食品安全质量检测学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李栋;李莉;徐艳群;罗自生
  • 通讯作者:
    罗自生
Integrated analysis of high-throughput sequencing data shows abscisic acid-responsive genes and miRNAs in strawberry receptacle fruit ripening
高通量测序数据综合分析显示草莓花托果实成熟过程中脱落酸响应基因和 miRNA
  • DOI:
    10.1038/s41438-018-0100-8
  • 发表时间:
    2019-02-01
  • 期刊:
    HORTICULTURE RESEARCH
  • 影响因子:
    8.7
  • 作者:
    Li, Dongdong;Mou, Wangshu;Luo, Zisheng
  • 通讯作者:
    Luo, Zisheng
Natural deep eutectic solvent enhanced pulse-ultrasonication assisted extraction as a multi-stability protective and efficient green strategy to extract anthocyanin from blueberry pomace
天然低共熔溶剂增强脉冲超声辅助提取作为多稳定性保护和高效绿色策略从蓝莓果渣中提取花青素
  • DOI:
    10.1016/j.lwt.2021.111220
  • 发表时间:
    2021-03-08
  • 期刊:
    LWT-FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY
  • 影响因子:
    6
  • 作者:
    Fu, Xizhe;Wang, Di;Luo, Zisheng
  • 通讯作者:
    Luo, Zisheng
Potential epigenetic regulation of RNA 5′-terminal NAD decapping associated with cellular energy status of postharvest Fragaria x ananassa in response to Botrytis cinerea invasion
RNA 5-末端 NAD 脱帽的潜在表观遗传调控与草莓采后响应灰霉病入侵的细胞能量状态相关
  • DOI:
    10.1016/j.postharvbio.2022.111840
  • 发表时间:
    2022-01-10
  • 期刊:
    POSTHARVEST BIOLOGY AND TECHNOLOGY
  • 影响因子:
    7
  • 作者:
    Ma, Quan;Xu, Yanqun;Luo, Zisheng
  • 通讯作者:
    Luo, Zisheng

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其他文献

Interaction of abscisic acid and auxin on gene expression involved in banana ripening
脱落酸和生长素的相互作用对香蕉成熟相关基因表达的影响
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2018-02
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    罗自生
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    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    罗自生
  • 通讯作者:
    罗自生
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张莉
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    园艺学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    罗自生
  • 通讯作者:
    罗自生

其他文献

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罗自生的其他基金

FaCMT3蛋白介导的FaMYB10甲基化调控草莓花色苷合成机制
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    面上项目
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    31571895
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相似国自然基金

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  • 财政年份:
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  • 项目类别:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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