基于氢键活化策略“理性定制”酶催化有机合成反应的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21672081
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0705.生物合成化学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The lipase/additive co-catalyzed MBH reaction is selected as a model reaction. For the low reaction conversions and stereoselectivity, we are going to rationally customize the enzyme and additives based on hydrogen bond activation strategy. Firstly, the additive molecules which can improve the enzyme-catalyzed MBH reaction are screened, and its structural characteristics (with what kind of "hydrogen bond donor") are confirmed. And then, the catalytic mechanism of lipase/additive co-catalyzed MBH reaction is deeply investigated by NMR and molecular dynamics simulation. The hydrogen bond interactions of enzyme-substrate-additive are fully understood from the molecular level, and the relevance is determined. Under the guidance of the co-catalyzed mechanism, the enzyme and additive molecules are reasonable optimized based on hydrogen bond activation strategies, enhancing the intermolecular hydrogen bond interactions and the spatial match of enzyme-substrate-additive complex molecule, which finally achieve the novel enzyme molecules with higher catalytic activity and stereoselectivity and the novel additive molecules with more efficient regulation effects. The optimized enzyme and additive molecules are applied in MBH reaction, and the MBH products with high conversions and enantiomeric ratios can be obtained finally. The established strategies of rational customization of enzyme-catalyzed organic reaction based on hydrogen bond activation strategy, have the important guiding significance for the effective regulation of other enzyme-catalyzed reactions.
本项目拟以脂肪酶/添加剂共催化的MBH反应作为模型反应,针对反应转化率及立体选择性不理想等缺点,依据氢键活化策略,对酶及添加剂分子进行“理性定制”。首先筛选对酶催化MBH反应有激活作用的添加剂分子,确定其结构特点(含有哪类“氢键供体”);然后采用核磁共振和分子动力学模拟技术对酶/添加剂共催化MBH反应的分子机制进行研究,从分子水平上充分认识酶-底物-添加剂三者间形成的氢键相互作用及相关性;在此基础上,基于氢键活化策略合理改造酶及添加剂分子,强化酶-底物-添加剂分子间的氢键相互作用及空间匹配,获得具有更高效催化活性和立体选择性的新型酶源,具有更高效调控效果的新型添加剂分子;将改造后的酶及添加剂应用到MBH反应中,最终获得具有高转化率和高旋光纯度的手性MBH反应产物。本项目所建立的基于氢键活化策略“理性定制”酶催化有机反应的研究策略,对其它酶催化有机合成反应的有效调控具有重要的指导意义。

结项摘要

MBH反应是一类重要的碳-碳键形成反应,是有机化学中构成分子骨架的关键,是有机化学中最具挑战性的工作,但碳-碳键形成反应并不是酶催化的天然反应类型,所以酶往往不能表现出令人满意的催化性能,建立简单且高效的生物催化对映选择性MBH反应,显得尤为重要。针对以上问题,本项目以脂肪酶/添加剂共催化的MBH反应作为模型反应,针对反应转化率及立体选择性不理想等缺点,依据氢键活化策略,对酶及添加剂分子进行“理性定制”。首次发现酰胺类及氨基酸类化合物可以作为添加剂辅助脂肪酶催化MBH反应,实现惰性反应的生物转化;通过对酶/添加剂共催化MBH反应的分子机制进行研究,认为加入的添加剂与酶-底物复合物形成的氢键相互作用是实现脂肪酶催化MBH反应的关键;在此基础上,基于强化催化剂与底物分子间的氢键相互作用及空间匹配,设计并获得的重组酶,突变酶,小肽分子及氨基酸衍生物等均可以在磷酸钠缓冲液中作为催化剂实现立体选择性MBH转化,反应过程极大简化,且不需要额外引入添加剂,即可获得具有高转化率和高旋光纯度的手性MBH反应产物;将设计并获得的氨基酸衍生物作为添加剂应用于脂肪酶/添加剂共催化的MBH反应系统中,催化效果较未经修饰的氨基酸作为添加剂显著提升。本研究基于氢键活化策略“理性定制”生物催化MBH反应,属本课题组创新性工作,可以为MBH反应提供一种高效、绿色的手性合成途径;建立的基于添加剂策略理性设计重组酶调控酶催化不对称合成反应的研究策略具有创新性,可以为其它酶催化有机合成反应的合理调控提供新思路。建立的基于氢键活化策略“理性定制”酶催化有机合成反应的研究策略,对其它酶催化有机合成反应的有效调控具有重要的指导意义。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Soluble expression and biomimetic immobilization of a omega-transaminase from Bacillus subtilis: Development of an efficient and recyclable biocatalyst
枯草芽孢杆菌 omega-转氨酶的可溶性表达和仿生固定化:开发高效且可回收的生物催化剂
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    BIOCHEMICAL ENGINEERING JOURNAL
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Wenjun Ju;Xi Zhen;Liangyu Zheng
  • 通讯作者:
    Liangyu Zheng
Co-immobilization of enoate reductase with a cofactor-recycling partner enzyme
烯酸还原酶与辅因子回收伙伴酶的共固定化
  • DOI:
    10.1016/j.enzmictec.2017.09.013
  • 发表时间:
    2018-02-01
  • 期刊:
    ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Li, Han;Xiao, Wenhua;Zheng, Liangyu
  • 通讯作者:
    Zheng, Liangyu
Rational enhancement of enzyme-catalyzed enantioselective reaction by construction of recombinant enzymes based on additive strategy
基于加性策略构建重组酶合理增强酶催化对映选择性反应
  • DOI:
    10.1007/s00449-019-02170-1
  • 发表时间:
    2019-07
  • 期刊:
    BIOPROCESS AND BIOSYSTEMS ENGINEERING
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Yu Han;Xiaoxue Zhou;Liangyu Zheng
  • 通讯作者:
    Liangyu Zheng
Stereoselective synthesis of a key chiral intermediate of (S)-Rivastigmine by AKR-GDH recombinant whole cells
AKR-GDH重组全细胞立体选择性合成(S)-利斯的明关键手性中间体
  • DOI:
    10.1016/j.jbiotec.2018.11.016
  • 发表时间:
    2019-01-10
  • 期刊:
    JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Xie, Panpan;Zhou, Xiaoxue;Zheng, Liangyu
  • 通讯作者:
    Zheng, Liangyu

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其他文献

小麦ACCase CT功能域基因在大肠杆菌中的表达及与除草剂的相互作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王瑞俭;郑良玉;杨雪莹;杨晔;王晓娟;曹淑桂
  • 通讯作者:
    曹淑桂
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    秦林;郑良玉;高军龙;张锁秦;孙国栋;张新民;刘庆文
  • 通讯作者:
    刘庆文
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    刘庆文
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基于脯氨酸的氨基吡啶二肽作为直接羟醛反应的高效有机催化剂
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    CHEM. RES. CHINESE UNIVERSITIES
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张新民;张锁秦;高军龙;孙国栋;郑良玉
  • 通讯作者:
    郑良玉
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分析确定禾本科乙酰辅酶 A 羧化酶羧基转移酶结构域除草剂敏感性的关键残基
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    CHEM. RES. CHINESE UNIVERSITIES
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    田雪梅;郑良玉;赵博;陶进;曹淑桂
  • 通讯作者:
    曹淑桂

其他文献

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基于大环多胺类化合物调控的酶催化有机合成反应:机制与反应工程研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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